转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 21 / 126 下载 TSV

上一页 21 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003409 Chr01 NC_080387.1:52749678-52749692promoter 内 254-268 bp - 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 52753425-52755236(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCGCCGAC
SmilChr04G003494 Chr04 NC_080390.1:51373194-51373208promoter 内 196-210 bp + 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 51365035-51369403(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCATCTCC
SmilChr03G004022 Chr03 NC_080389.1:59188630-59188644promoter 内 170-184 bp + 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 59192461-59197626(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCGATGACGTGGCA
SmilChr08G003316 Chr08 NC_080394.1:34401290-34401304promoter 内 118-132 bp + 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 34391154-34397421(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGTTCTAC
SmilChr02G001164 Chr02 NC_080388.1:21232659-21232673promoter 内 15-29 bp + 3972 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 21227040-21228687(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCTTCATG
SmilChr01G003151 Chr01 NC_080387.1:50313165-50313179promoter 内 3465-3479 bp - 522 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 50313701-50316532(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGCGTAT
SmilChr01G002064 Chr01 NC_080387.1:36499304-36499318promoter 内 2657-2671 bp - 1330 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 36495443-36497974(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATGGACACGTGTCG
SmilChr01G002095 Chr01 NC_080387.1:36960026-36960040promoter 内 2582-2596 bp + 1405 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 36961445-36963873(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATGGACACGTGTCG
SmilChr08G004767 Chr08 NC_080394.1:57015269-57015283promoter 内 2524-2538 bp - 1463 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 57011719-57013806(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGGTGCCACGTGGCG
SmilChr03G001505 Chr03 NC_080389.1:18403983-18403997promoter 内 1956-1970 bp - 2031 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 18406028-18407845(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCTCCATC
SmilChr04G002107 Chr04 NC_080390.1:34016450-34016464promoter 内 1775-1789 bp + 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 34013504-34014238(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGCAGCC
SmilChr07G001969 Chr07 NC_080393.1:17237153-17237167promoter 内 3935-3949 bp + 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 17222280-17237101(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCAGCTCT
SmilChr04G001684 Chr04 NC_080390.1:27874588-27874602promoter 内 3882-3896 bp - 105 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 27872470-27874483(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATGGACACGTGTCG
SmilChr04G001676 Chr04 NC_080390.1:27777014-27777028promoter 内 3869-3883 bp + 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 27777146-27779100(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATGGACACGTGTCG
SmilChr08G004712 Chr08 NC_080394.1:56548780-56548794promoter 内 3785-3799 bp - 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 56545405-56548578(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGAGGACACGTGTCG
SmilChr08G004713 Chr08 NC_080394.1:56548780-56548794promoter 内 3747-3761 bp - 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 56549034-56551255(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCCTCA
SmilChr03G000944 Chr03 NC_080389.1:10708694-10708708promoter 内 3310-3324 bp + 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 10709385-10713375(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATAGTGACGTGGCA
SmilChr03G000947 Chr03 NC_080389.1:10740605-10740619promoter 内 3303-3317 bp + 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 10741303-10745284(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATAGTGACGTGGCA
SmilChr08G001168 Chr08 NC_080394.1:9353454-9353468promoter 内 2697-2711 bp + 1290 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 9354758-9356843(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAATGCGACGTGGCA
SmilChr01G004332 Chr01 NC_080387.1:61462961-61462975promoter 内 2677-2691 bp - 1310 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 61460341-61461651(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATACGCCACGTGGCA
SmilChr06G001569 Chr06 NC_080392.1:17139647-17139661promoter 内 2474-2488 bp - 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 17136675-17138134(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGAGCTGACGTGGCA
SmilChr02G000938 Chr02 NC_080388.1:16369100-16369114promoter 内 2404-2418 bp + 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 16358836-16367517(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCACATGT
SmilChr01G002185 Chr01 NC_080387.1:37971701-37971715promoter 内 2397-2411 bp + 1590 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 37965979-37970111(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGGCGTAT
SmilChr05G000535 Chr05 NC_080391.1:4101325-4101339promoter 内 2240-2254 bp - 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 4097265-4099578(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGGGGACACGTGTCG
SmilChr07G003898 Chr07 NC_080393.1:49021588-49021602promoter 内 2028-2042 bp - 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 49023561-49026218(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCGTGC
SmilChr04G000729 Chr04 NC_080390.1:8616493-8616507promoter 内 1457-1471 bp - 2530 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 8619037-8620930(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCCTCA
SmilChr03G001333 Chr03 NC_080389.1:15565016-15565030promoter 内 1447-1461 bp + 2540 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 15559588-15562476(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCACCATC
SmilChr02G003594 Chr02 NC_080388.1:57142707-57142721promoter 内 1253-1267 bp - 2734 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 57145455-57146741(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTCCCAG
SmilChr04G000674 Chr04 NC_080390.1:7648554-7648568promoter 内 772-786 bp - 3215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 7651783-7655599(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCTGCCTC
SmilChr08G001158 Chr08 NC_080394.1:9216448-9216462promoter 内 3892-3906 bp + 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 9216557-9217590(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAATGCGACGTGGCA
SmilChr03G000943 Chr03 NC_080389.1:10708694-10708708promoter 内 3643-3657 bp + 344 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 10707604-10708350(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCACTATA
SmilChr03G000946 Chr03 NC_080389.1:10740605-10740619promoter 内 3643-3657 bp + 344 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 10739515-10740261(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCACTATA
SmilChr01G002895 Chr01 NC_080387.1:47653862-47653876promoter 内 3621-3635 bp + 366 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 47654242-47656712(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AACGCAGACGTGGCA
SmilChr08G002147 Chr08 NC_080394.1:19331819-19331833promoter 内 3588-3602 bp + 399 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 19332232-19336673(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGAGGAGACGTGGCT
SmilChr08G002783 Chr08 NC_080394.1:27520404-27520418promoter 内 3567-3581 bp - 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 27516875-27519984(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACAGATGACGTGGCA
SmilChr02G004722 Chr02 NC_080388.1:69468303-69468317promoter 内 3201-3215 bp + 786 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 69460615-69467517(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCTGCTTC
SmilChr01G004536 Chr01 NC_080387.1:63519496-63519510promoter 内 3029-3043 bp + 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 63520468-63524011(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GATGGAGACGTGGCT
SmilChr08G000117 Chr08 NC_080394.1:727523-727537promoter 内 3004-3018 bp - 983 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 725782-726540(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACAGATGACGTGGCA
SmilChr02G003708 Chr02 NC_080388.1:58637798-58637812promoter 内 2899-2913 bp - 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 58634544-58636710(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCTGCCCACGTGGCA
SmilChr02G001427 Chr02 NC_080388.1:26932071-26932085promoter 内 2689-2703 bp - 1298 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 26933383-26936742(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGCTCG
SmilChr08G004218 Chr08 NC_080394.1:51568547-51568561promoter 内 2343-2357 bp + 1644 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 51570205-51572375(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAGCTGACGTGGCG
SmilChr07G002592 Chr07 NC_080393.1:24921469-24921483promoter 内 2277-2291 bp + 1710 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 24923193-24926301(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACAGATGACGTGGCA
SmilChr02G002158 Chr02 NC_080388.1:38807143-38807157promoter 内 2223-2237 bp - 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 38804041-38805379(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGTCGACACGTGGCA
SmilChr08G000075 Chr08 NC_080394.1:436554-436568promoter 内 2152-2166 bp + 1835 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 438403-442039(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GATGGTGACGTGGCT
SmilChr03G002847 Chr03 NC_080389.1:45036558-45036572promoter 内 1608-1622 bp - 2379 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 45029734-45034179(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGAGCTGACGTGGCA
SmilChr02G000639 Chr02 NC_080388.1:9681394-9681408promoter 内 1475-1489 bp - 2512 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 9674435-9678882(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAGCTGACGTGGCG
SmilChr03G001461 Chr03 NC_080389.1:17459222-17459236promoter 内 1187-1201 bp + 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 17462036-17467359(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTGGACACGTGGCT
SmilChr01G002459 Chr01 NC_080387.1:42227834-42227848promoter 内 1176-1190 bp - 2811 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 42230659-42233117(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCACGA
SmilChr01G004528 Chr01 NC_080387.1:63476782-63476796promoter 内 1115-1129 bp - 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 63467710-63473910(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACATGTGACGTGGCA
SmilChr01G004396 Chr01 NC_080387.1:62109148-62109162promoter 内 876-890 bp - 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 62112273-62113970(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCATCATG