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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 21 / 134 下载 TSV

上一页 21 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002537 Chr02 NC_080388.1:44158143-44158155promoter 内 3033-3045 bp + 956 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 44154115-44157187(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGTACA
SmilChr02G004651 Chr02 NC_080388.1:68952160-68952172promoter 内 3003-3015 bp + 986 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 68939557-68951174(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATTAT
SmilChr02G000751 Chr02 NC_080388.1:12264173-12264185promoter 内 2921-2933 bp - 1068 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 12261593-12263105(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTTGGATAAGA
SmilChr01G005693 Chr01 NC_080387.1:73210491-73210503promoter 内 2802-2814 bp + 1187 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 73205725-73209304(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTTTT
SmilChr01G003077 Chr01 NC_080387.1:49610753-49610765promoter 内 2253-2265 bp - 1736 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 49605095-49609017(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGA
SmilChr02G002538 Chr02 NC_080388.1:44158143-44158155promoter 内 2237-2249 bp + 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 44159907-44165662(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTACGGATAAGG
SmilChr02G001276 Chr02 NC_080388.1:23402064-23402076promoter 内 2131-2143 bp + 1858 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 23403934-23411765(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATGCAGATAAGG
SmilChr01G004878 Chr01 NC_080387.1:66882872-66882884promoter 内 1456-1468 bp - 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 66876875-66880339(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTTGGATAAGA
SmilChr02G005405 Chr02 NC_080388.1:74585711-74585723promoter 内 1243-1255 bp - 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 74579314-74582965(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GACATGGATAAGG
SmilChr02G001572 Chr02 NC_080388.1:29145554-29145566promoter 内 1170-1182 bp - 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 29148385-29153062(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATTTG
SmilChr02G004621 Chr02 NC_080388.1:68737618-68737630promoter 内 1136-1148 bp - 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 68732778-68734765(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAAAGGATAAGA
SmilChr03G001470 Chr03 NC_080389.1:17559163-17559175promoter 内 1121-1133 bp + 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 17553895-17556295(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGCTAC
SmilChr01G004444 Chr01 NC_080387.1:62556073-62556085promoter 内 904-916 bp - 3085 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 62559170-62565033(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCAAG
SmilChr02G002804 Chr02 NC_080388.1:48110827-48110839promoter 内 848-860 bp - 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 48113980-48115436(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTTTT
SmilChr02G002963 Chr02 NC_080388.1:50146186-50146198promoter 内 770-782 bp - 3219 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 50141901-50142967(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGA
SmilChr02G005417 Chr02 NC_080388.1:74635425-74635437promoter 内 603-615 bp - 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 74626092-74632039(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GACATGGATAAGG
SmilChr01G003588 Chr01 NC_080387.1:54427510-54427522promoter 内 597-609 bp + 3392 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 54430914-54433917(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATATCGGATAAGG
SmilChr02G005410 Chr02 NC_080388.1:74594336-74594348promoter 内 413-425 bp + 3576 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 74597924-74598825(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GACATGGATAAGG
SmilChr02G005183 Chr02 NC_080388.1:73128144-73128156promoter 内 267-279 bp + 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 73131878-73133462(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTTGGATAAGA
SmilChr02G004510 Chr02 NC_080388.1:67622564-67622576promoter 内 170-182 bp - 3819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 67626395-67631109(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCAAG
SmilChr02G005128 Chr02 NC_080388.1:72747906-72747918promoter 内 141-153 bp - 3848 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 72751766-72754924(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACTCA
SmilChr02G005108 Chr02 NC_080388.1:72597055-72597067promoter 内 1898-1910 bp + 2091 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 6 72591050-72594964(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTAAACC
SmilChr01G005350 Chr01 NC_080387.1:70754789-70754801promoter 内 2326-2338 bp + 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 5 70748580-70753126(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTATA
SmilChr02G000186 Chr02 NC_080388.1:2345098-2345110promoter 内 2982-2994 bp + 1007 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 4 2346117-2348603(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGATAGGATAAGG
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SmilChr03G001630 Chr03 NC_080389.1:20999751-20999763promoter 内 1738-1750 bp - 2251 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 20995491-20997500(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATAAGGATAAGA
SmilChr02G000494 Chr02 NC_080388.1:6811292-6811304promoter 内 1609-1621 bp - 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 6813684-6815029(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTA
SmilChr03G001556 Chr03 NC_080389.1:19621303-19621315promoter 内 1045-1057 bp + 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 19624259-19628291(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAGTGGATAAGC
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SmilChr02G002813 Chr02 NC_080388.1:48179050-48179062promoter 内 573-585 bp + 3416 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 48182478-48183750(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAAGA
SmilChr01G003521 Chr01 NC_080387.1:53851482-53851494promoter 内 3885-3897 bp - 104 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 53851598-53855012(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCAATT
SmilChr01G000852 Chr01 NC_080387.1:18408658-18408670promoter 内 3854-3866 bp + 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 18408805-18412146(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTTAGATAAGG
SmilChr03G002023 Chr03 NC_080389.1:30312798-30312810promoter 内 3642-3654 bp - 347 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 30310880-30312451(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCATTGGATAAGG
SmilChr01G004365 Chr01 NC_080387.1:61839115-61839127promoter 内 3638-3650 bp - 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 61839478-61842573(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTAATA
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SmilChr03G000302 Chr03 NC_080389.1:3451780-3451792promoter 内 3445-3457 bp - 544 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 3449974-3451236(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTGAAGATAAGG
SmilChr01G001791 Chr01 NC_080387.1:32770395-32770407promoter 内 3221-3233 bp - 768 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 32771175-32776784(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATTTA
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SmilChr03G001425 Chr03 NC_080389.1:16902000-16902012promoter 内 1554-1566 bp - 2435 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 16898811-16899565(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTAAGGATAAGA
SmilChr02G002272 Chr02 NC_080388.1:40188998-40189010promoter 内 1536-1548 bp - 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 40185049-40186545(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGATTGGATAAGA
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SmilChr01G006000 Chr01 NC_080387.1:75592533-75592545promoter 内 1254-1266 bp - 2735 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 75581816-75589798(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTTGGATAAGC
SmilChr01G002924 Chr01 NC_080387.1:48021410-48021422promoter 内 1244-1256 bp + 2745 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 48015447-48018665(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTACTCT
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SmilChr03G002040 Chr03 NC_080389.1:30813100-30813112promoter 内 1134-1146 bp + 2855 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 30815967-30837413(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAAGA