转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G001978; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00026506-RA_Salv SmilChr07G001978 SBP XP_057776996.1 MP00555 ATTGTACGGAT

可能结合的靶基因

9805 个结合位点 7648 个候选靶基因 第 24 / 153 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000015 Chr05 NC_080391.1:69963-69973promoter 内 1890-1900 bp - 2101 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 64443-67862(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TCTGTACGGAG
SmilChr05G001679 Chr05 NC_080391.1:15926006-15926016promoter 内 1738-1748 bp + 2253 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 15920526-15923753(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTCCGTACGCT
SmilChr01G001413 Chr01 NC_080387.1:27722919-27722929promoter 内 1708-1718 bp + 2283 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 27725212-27727241(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TCTGTACGGAG
SmilChr03G000287 Chr03 NC_080389.1:3261295-3261305promoter 内 1705-1715 bp + 2286 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 3263591-3264484(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GATGTACGGAT
SmilChr02G000409 Chr02 NC_080388.1:5100614-5100624promoter 内 1699-1709 bp - 2292 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 5096352-5098322(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 AATGTACGGCC
SmilChr01G001220 Chr01 NC_080387.1:24475337-24475347promoter 内 1679-1689 bp + 2312 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 24477659-24478409(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ACTGTACGGCA
SmilChr03G000224 Chr03 NC_080389.1:2623457-2623467promoter 内 1671-1681 bp - 2320 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 2625787-2628468(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACATC
SmilChr02G004805 Chr02 NC_080388.1:70242234-70242244promoter 内 1650-1660 bp - 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 70221396-70239893(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GATGTACGGAT
SmilChr05G001416 Chr05 NC_080391.1:12795238-12795248promoter 内 1586-1596 bp - 2405 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 12790333-12792833(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 CTTGTACGGCC
SmilChr02G002492 Chr02 NC_080388.1:43362811-43362821promoter 内 1568-1578 bp - 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 43353388-43360388(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 CTTGTACGGCC
SmilChr02G004924 Chr02 NC_080388.1:71255455-71255465promoter 内 1566-1576 bp - 2425 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 71252206-71253030(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 CTTGTACGGCC
SmilChr03G000286 Chr03 NC_080389.1:3261295-3261305promoter 内 1557-1567 bp + 2434 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 3256730-3258861(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACATC
SmilChr01G004960 Chr01 NC_080387.1:67696019-67696029promoter 内 1514-1524 bp + 2477 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 67692933-67693542(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACGGC
SmilChr05G001012 Chr05 NC_080391.1:8306842-8306852promoter 内 1502-1512 bp + 2489 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 8302989-8304353(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GTCCGTACCGA
SmilChr03G003869 Chr03 NC_080389.1:57803131-57803141promoter 内 1476-1486 bp + 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 57798026-57800616(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACATC
SmilChr03G001672 Chr03 NC_080389.1:21805040-21805050promoter 内 1442-1452 bp + 2549 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 21794417-21802491(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACGCT
SmilChr02G002003 Chr02 NC_080388.1:36183112-36183122promoter 内 1425-1435 bp - 2566 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 36185688-36187781(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACACG
SmilChr04G002259 Chr04 NC_080390.1:36542476-36542486promoter 内 1334-1344 bp + 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 36545143-36559440(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 CCTGTACGGTC
SmilChr02G005555 Chr02 NC_080388.1:75516971-75516981promoter 内 1244-1254 bp + 2747 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 75510048-75514224(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GGCCGTACATT
SmilChr02G005009 Chr02 NC_080388.1:71902204-71902214promoter 内 1232-1242 bp - 2759 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 71896415-71899445(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 CGTGTACGGAT
SmilChr01G004976 Chr01 NC_080387.1:67829330-67829340promoter 内 1141-1151 bp + 2850 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 67832190-67832949(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GATGTACGGAT
SmilChr03G000240 Chr03 NC_080389.1:2849400-2849410promoter 内 1070-1080 bp + 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 2845210-2846479(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACATC
SmilChr03G003350 Chr03 NC_080389.1:51829486-51829496promoter 内 1065-1075 bp + 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 51832422-51834098(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GATGTACGGAT
SmilChr04G001493 Chr04 NC_080390.1:24489609-24489619promoter 内 1063-1073 bp - 2928 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 24492547-24493209(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTCCGTACGCT
SmilChr05G002722 Chr05 NC_080391.1:31330137-31330147promoter 内 1048-1058 bp + 2943 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 31326104-31327194(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GGCCGTACATT
SmilChr03G003664 Chr03 NC_080389.1:55481770-55481780promoter 内 899-909 bp + 3092 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 55484872-55486992(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GTCGTACGGAA
SmilChr05G000385 Chr05 NC_080391.1:2896512-2896522promoter 内 899-909 bp + 3092 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 2899614-2900631(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GATGTACGGAT
SmilChr03G004111 Chr03 NC_080389.1:60000897-60000907promoter 内 897-907 bp - 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 60004001-60015907(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GGCCGTACAAG
SmilChr03G004105 Chr03 NC_080389.1:59937586-59937596promoter 内 891-901 bp - 3100 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 59940696-59952586(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GGCCGTACAAG
SmilChr02G000331 Chr02 NC_080388.1:4212442-4212452promoter 内 866-876 bp - 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 4207634-4209317(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 AGCGTACGGAT
SmilChr01G001948 Chr01 NC_080387.1:34692905-34692915promoter 内 853-863 bp - 3138 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 34696053-34698456(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 CTCCGTACAGA
SmilChr03G003935 Chr03 NC_080389.1:58409006-58409016promoter 内 768-778 bp + 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 58412239-58412667(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GATGTACGGAT
SmilChr05G003406 Chr05 NC_080391.1:45167233-45167243promoter 内 716-726 bp - 3275 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 45155778-45163958(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GATGTACGGAT
SmilChr04G000427 Chr04 NC_080390.1:4533139-4533149promoter 内 603-613 bp + 3388 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 4528979-4529751(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TGCCGTACAGT
SmilChr01G002269 Chr01 NC_080387.1:39467713-39467723promoter 内 555-565 bp + 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 39462288-39464277(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GGCCGTACAAG
SmilChr03G000684 Chr03 NC_080389.1:7631767-7631777promoter 内 536-546 bp + 3455 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 7635232-7652488(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GATGTACGGAT
SmilChr01G004255 Chr01 NC_080387.1:60827735-60827745promoter 内 505-515 bp - 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 60831231-60832355(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACGGC
SmilChr01G004664 Chr01 NC_080387.1:64748474-64748484promoter 内 492-502 bp + 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 64744474-64744975(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GGCCGTACAAG
SmilChr01G003388 Chr01 NC_080387.1:52571230-52571240promoter 内 341-351 bp + 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 52562027-52567580(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GGCCGTACAAG
SmilChr02G005435 Chr02 NC_080388.1:74772955-74772965promoter 内 286-296 bp + 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 74764283-74769250(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GGCCGTACATT
SmilChr03G002874 Chr03 NC_080389.1:45416108-45416118promoter 内 184-194 bp - 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 45419925-45425806(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GGCCGTACAAG
SmilChr05G003544 Chr05 NC_080391.1:47309947-47309957promoter 内 146-156 bp - 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 47304473-47306102(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 CTTGTACGGCC
SmilChr05G003018 Chr05 NC_080391.1:37560801-37560811promoter 内 131-141 bp - 3860 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 37564671-37565891(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GTCCGTACCGA
SmilChr04G000239 Chr04 NC_080390.1:2147513-2147523promoter 内 110-120 bp + 3881 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 2142455-2143632(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATCCGTACATC
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SmilChr03G002034 Chr03 NC_080389.1:30595392-30595402promoter 内 80-90 bp - 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 30599313-30599418(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GGCCGTACAAG
SmilChr04G001082 Chr04 NC_080390.1:15502081-15502091promoter 内 41-51 bp - 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 15497688-15498131(-) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GATGTACGGAT
SmilChr05G003540 Chr05 NC_080391.1:47266439-47266449promoter 内 22-32 bp - 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 47270418-47271831(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 GGCCGTACAAG
SmilChr04G002816 Chr04 NC_080390.1:44203481-44203491promoter 内 3709-3719 bp - 282 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 44203773-44205946(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 TTCCGTACACG
SmilChr04G001648 Chr04 NC_080390.1:27415047-27415057promoter 内 3162-3172 bp + 829 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 27415886-27424500(+) SMil_00026506-RA_Salv MP00555 ATGGTACGGAT