转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 26 / 128 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003728 Chr01 NC_080387.1:55591227-55591238promoter 内 2502-2513 bp + 1488 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 55592726-55594756(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGAA
SmilChr02G003230 Chr02 NC_080388.1:53573833-53573844promoter 内 2272-2283 bp - 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 53575562-53577213(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTTTA
SmilChr01G004896 Chr01 NC_080387.1:67033036-67033047promoter 内 2270-2281 bp + 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 67034767-67037714(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGAA
SmilChr02G004255 Chr02 NC_080388.1:64751812-64751823promoter 内 2018-2029 bp + 1972 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 64753795-64759325(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGAA
SmilChr01G003987 Chr01 NC_080387.1:58300873-58300884promoter 内 2010-2021 bp - 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 58302864-58303077(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTTCC
SmilChr01G001118 Chr01 NC_080387.1:22814513-22814524promoter 内 1721-1732 bp + 2269 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 22811251-22812244(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTC
SmilChr03G000304 Chr03 NC_080389.1:3473502-3473513promoter 内 1661-1672 bp - 2329 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 3466537-3471173(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCC
SmilChr02G003968 Chr02 NC_080388.1:61826941-61826952promoter 内 1467-1478 bp + 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 61823186-61824418(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTTTG
SmilChr01G005679 Chr01 NC_080387.1:73057649-73057660promoter 内 1189-1200 bp - 2801 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 73060461-73061805(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTC
SmilChr02G001312 Chr02 NC_080388.1:24350524-24350535promoter 内 1132-1143 bp - 2858 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 24346163-24347666(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGGG
SmilChr02G002810 Chr02 NC_080388.1:48145795-48145806promoter 内 1027-1038 bp + 2963 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 48148769-48150806(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGGG
SmilChr03G001556 Chr03 NC_080389.1:19621132-19621143promoter 内 874-885 bp - 3116 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 19624259-19628291(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCC
SmilChr02G000483 Chr02 NC_080388.1:6597351-6597362promoter 内 864-875 bp + 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6600488-6602111(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGAA
SmilChr02G003379 Chr02 NC_080388.1:54920768-54920779promoter 内 779-790 bp + 3211 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 54914167-54917557(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTTCC
SmilChr01G001417 Chr01 NC_080387.1:27759291-27759302promoter 内 742-753 bp + 3248 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 27755515-27756043(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTTC
SmilChr03G000657 Chr03 NC_080389.1:7340675-7340686promoter 内 652-663 bp + 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 7336345-7337337(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCC
SmilChr01G004027 Chr01 NC_080387.1:58698733-58698744promoter 内 574-585 bp - 3416 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 58694404-58695317(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGCC
SmilChr01G003545 Chr01 NC_080387.1:54036277-54036288promoter 内 511-522 bp + 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 54039767-54043050(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGAA
SmilChr02G000423 Chr02 NC_080388.1:5411065-5411076promoter 内 472-483 bp - 3518 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 5414594-5417561(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTTCC
SmilChr01G001630 Chr01 NC_080387.1:30363050-30363061promoter 内 430-441 bp + 3560 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 30366621-30368468(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGAA
SmilChr02G002376 Chr02 NC_080388.1:41646066-41646077promoter 内 262-273 bp + 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 41649805-41652168(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGGA
SmilChr02G002987 Chr02 NC_080388.1:50499513-50499524promoter 内 186-197 bp + 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50503328-50506990(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGAA
SmilChr01G001109 Chr01 NC_080387.1:22715872-22715883promoter 内 1161-1172 bp + 2829 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 10 22710281-22713043(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TACTCTGTTTTA
SmilChr01G000630 Chr01 NC_080387.1:14080353-14080364promoter 内 248-259 bp + 3742 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 5 14084106-14086762(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGGG
SmilChr02G000969 Chr02 NC_080388.1:16923229-16923240promoter 内 2549-2560 bp + 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 16918347-16921788(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTTTT
SmilChr03G001296 Chr03 NC_080389.1:15155682-15155693promoter 内 2392-2403 bp + 1598 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 15157291-15160121(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGTT
SmilChr01G002342 Chr01 NC_080387.1:40580170-40580181promoter 内 1150-1161 bp + 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 40574844-40577330(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTTT
SmilChr01G000634 Chr01 NC_080387.1:14267463-14267474promoter 内 949-960 bp - 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 14270515-14271940(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTCT
SmilChr01G002341 Chr01 NC_080387.1:40580170-40580181promoter 内 841-852 bp + 3149 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 40574844-40577021(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTTT
SmilChr01G003972 Chr01 NC_080387.1:58158750-58158761promoter 内 3982-3993 bp - 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 58156146-58158742(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGAC
SmilChr02G001700 Chr02 NC_080388.1:31322532-31322543promoter 内 3872-3883 bp + 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 31322661-31326472(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGTT
SmilChr02G001943 Chr02 NC_080388.1:35059742-35059753promoter 内 3827-3838 bp + 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 35059916-35063956(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGTT
SmilChr02G005152 Chr02 NC_080388.1:72887176-72887187promoter 内 3821-3832 bp + 169 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 72887356-72893574(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGTT
SmilChr01G002702 Chr01 NC_080387.1:45293810-45293821promoter 内 3603-3614 bp + 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 45294208-45295405(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGTT
SmilChr01G001330 Chr01 NC_080387.1:26498063-26498074promoter 内 3330-3341 bp + 660 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 26498734-26500788(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAACAGAGTC
SmilChr02G002566 Chr02 NC_080388.1:44652820-44652831promoter 内 3294-3305 bp - 696 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 44648304-44652124(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGGAACAGAGGA
SmilChr01G003689 Chr01 NC_080387.1:55270604-55270615promoter 内 3181-3192 bp + 809 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 55267026-55269795(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCTG
SmilChr03G001393 Chr03 NC_080389.1:16526791-16526802promoter 内 3168-3179 bp + 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 16525863-16525969(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCTG
SmilChr01G000250 Chr01 NC_080387.1:4696954-4696965promoter 内 2967-2978 bp - 1023 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 4697988-4698093(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCTG
SmilChr01G005816 Chr01 NC_080387.1:74154493-74154504promoter 内 2948-2959 bp + 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 74152452-74153451(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AACTCTGTTTTT
SmilChr02G002863 Chr02 NC_080388.1:48804180-48804191promoter 内 2902-2913 bp + 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 48796898-48803092(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TACTCTGTTTTA
SmilChr01G003958 Chr01 NC_080387.1:57953365-57953376promoter 内 2371-2382 bp - 1619 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 57954995-57958129(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCCC
SmilChr02G005156 Chr02 NC_080388.1:72925179-72925190promoter 内 2074-2085 bp + 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 72920166-72923263(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTTCT
SmilChr02G004230 Chr02 NC_080388.1:64496572-64496583promoter 内 1959-1970 bp + 2031 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 64498614-64500758(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGAACAGAGCG
SmilChr02G005310 Chr02 NC_080388.1:73996639-73996650promoter 内 1912-1923 bp - 2078 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 73998728-74000883(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GACTCTGTTTCC
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SmilChr03G001690 Chr03 NC_080389.1:22418209-22418220promoter 内 1476-1487 bp + 2514 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 22415028-22415695(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTTCT
SmilChr02G003436 Chr02 NC_080388.1:55599276-55599287promoter 内 1329-1340 bp - 2661 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 55589245-55596615(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGTA
SmilChr01G001880 Chr01 NC_080387.1:33825907-33825918promoter 内 1247-1258 bp - 2743 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 33820325-33823164(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGAC
SmilChr02G001198 Chr02 NC_080388.1:22114947-22114958promoter 内 1012-1023 bp + 2978 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 22117936-22121739(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGAC