转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 26 / 139 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001273 Chr01 NC_080387.1:25425776-25425787promoter 内 2993-3004 bp + 997 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 25418890-25424779(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAGCT
SmilChr03G003513 Chr03 NC_080389.1:53739405-53739416promoter 内 2993-3004 bp + 997 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 53734229-53738408(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAGCT
SmilChr01G000584 Chr01 NC_080387.1:12602535-12602546promoter 内 2841-2852 bp + 1149 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 12599471-12601386(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGGG
SmilChr04G001899 Chr04 NC_080390.1:31034192-31034203promoter 内 2714-2725 bp + 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 31035479-31039870(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCCGACGTGGA
SmilChr02G003034 Chr02 NC_080388.1:51054421-51054432promoter 内 2689-2700 bp + 1301 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 51055733-51058690(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCCGACGTGGG
SmilChr01G002136 Chr01 NC_080387.1:37343066-37343077promoter 内 2628-2639 bp + 1362 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 37344439-37346896(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCCGACGTGGA
SmilChr04G002362 Chr04 NC_080390.1:38106212-38106223promoter 内 2530-2541 bp - 1460 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 38107683-38113503(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGGC
SmilChr03G003514 Chr03 NC_080389.1:53739405-53739416promoter 内 2403-2414 bp + 1587 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 53741003-53748268(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGTC
SmilChr03G002703 Chr03 NC_080389.1:42979523-42979534promoter 内 2301-2312 bp - 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 42981223-42983855(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGGC
SmilChr01G005939 Chr01 NC_080387.1:75134400-75134411promoter 内 2067-2078 bp - 1923 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 75131935-75132477(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGTG
SmilChr02G002214 Chr02 NC_080388.1:39374756-39374767promoter 内 1999-2010 bp + 1991 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 39376758-39379132(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCCGACGTGGA
SmilChr02G000515 Chr02 NC_080388.1:7115674-7115685promoter 内 1982-1993 bp + 2008 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 7117693-7119003(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCCGACGTGGG
SmilChr02G003647 Chr02 NC_080388.1:57848247-57848258promoter 内 1958-1969 bp + 2032 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 57850290-57853512(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCTGACGTCGC
SmilChr01G004488 Chr01 NC_080387.1:63009095-63009106promoter 内 1760-1771 bp - 2230 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 63011336-63014466(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAGCT
SmilChr04G002923 Chr04 NC_080390.1:45498704-45498715promoter 内 1662-1673 bp + 2328 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 45491549-45496376(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGGG
SmilChr03G002443 Chr03 NC_080389.1:38826528-38826539promoter 内 1635-1646 bp - 2355 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 38828894-38831374(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAGCT
SmilChr02G005483 Chr02 NC_080388.1:75039090-75039101promoter 内 1254-1265 bp + 2736 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 75034610-75036354(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGGC
SmilChr02G004501 Chr02 NC_080388.1:67524140-67524151promoter 内 1229-1240 bp - 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 67517176-67521379(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCCGACGTGGA
SmilChr02G004600 Chr02 NC_080388.1:68518226-68518237promoter 内 1168-1179 bp - 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 68521059-68526346(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGGC
SmilChr03G004577 Chr03 NC_080389.1:63664437-63664448promoter 内 1120-1131 bp - 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 63658036-63661567(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGTC
SmilChr01G005573 Chr01 NC_080387.1:72482330-72482341promoter 内 834-845 bp + 3156 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 72485497-72488218(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCCGACGTGGT
SmilChr02G002850 Chr02 NC_080388.1:48681389-48681400promoter 内 535-546 bp + 3455 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 48674009-48677934(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAGCT
SmilChr05G000107 Chr05 NC_080391.1:697822-697833promoter 内 508-519 bp - 3482 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 691735-694340(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGTG
SmilChr04G002890 Chr04 NC_080390.1:45119064-45119075promoter 内 213-224 bp + 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 45111525-45115287(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAGCT
SmilChr01G001274 Chr01 NC_080387.1:25425776-25425787promoter 内 202-213 bp + 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 25429575-25430228(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGTC
SmilChr01G000079 Chr01 NC_080387.1:1392428-1392439promoter 内 111-122 bp - 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 1396318-1400364(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGGGT
SmilChr04G002775 Chr04 NC_080390.1:43545575-43545586promoter 内 68-79 bp - 3922 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 43540338-43541653(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTGTG
SmilChr02G002935 Chr02 NC_080388.1:49850236-49850247promoter 内 41-52 bp + 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 49845838-49846287(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGGC
SmilChr02G004074 Chr02 NC_080388.1:63025125-63025136promoter 内 336-347 bp - 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 6 63028790-63037407(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCACTC
SmilChr03G001204 Chr03 NC_080389.1:13877898-13877909promoter 内 3509-3520 bp + 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 5 13878390-13879761(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGTGACGTGGG
SmilChr02G005511 Chr02 NC_080388.1:75233953-75233964promoter 内 2950-2961 bp - 1040 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 5 75235004-75238347(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCACTC
SmilChr05G000207 Chr05 NC_080391.1:1648606-1648617promoter 内 3767-3778 bp - 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 4 1645530-1648383(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATCACGTGGC
SmilChr03G001241 Chr03 NC_080389.1:14299643-14299654promoter 内 2196-2207 bp - 1794 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 4 14296983-14297849(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGTGACGTGGG
SmilChr03G000606 Chr03 NC_080389.1:6694482-6694493promoter 内 3169-3180 bp - 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 6692792-6693661(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGTGACGTGGG
SmilChr03G000599 Chr03 NC_080389.1:6652050-6652061promoter 内 3024-3035 bp - 966 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 6647610-6651084(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGTGACGTGGG
SmilChr03G000605 Chr03 NC_080389.1:6694482-6694493promoter 内 968-979 bp - 3022 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 6689380-6691460(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGTGACGTGGG
SmilChr04G002432 Chr04 NC_080390.1:38963714-38963725promoter 内 933-944 bp + 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 38966782-38968770(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGTGACGTGGG
SmilChr02G000289 Chr02 NC_080388.1:3681224-3681235promoter 内 451-462 bp - 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 3676633-3677685(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGTGACGTGGG
SmilChr03G000223 Chr03 NC_080389.1:2606829-2606840promoter 内 251-262 bp - 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 2610579-2611193(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGATCA
SmilChr03G004704 Chr03 NC_080389.1:64333332-64333343promoter 内 3878-3889 bp + 112 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 64333455-64336742(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCCGACGTGGC
SmilChr03G003094 Chr03 NC_080389.1:47963646-47963657promoter 内 3400-3411 bp + 590 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 47958809-47963056(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCACTC
SmilChr03G004703 Chr03 NC_080389.1:64333332-64333343promoter 内 2966-2977 bp + 1024 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 64328867-64332308(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGGAA
SmilChr01G002364 Chr01 NC_080387.1:40804227-40804238promoter 内 1989-2000 bp + 2001 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 40806239-40815704(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACCGACGTGGC
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SmilChr03G002147 Chr03 NC_080389.1:33409544-33409555promoter 内 1384-1395 bp - 2606 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 33406591-33406938(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGTCGG
SmilChr03G002344 Chr03 NC_080389.1:36981031-36981042promoter 内 1279-1290 bp + 2711 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 36977173-36978320(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCACTC
SmilChr04G003715 Chr04 NC_080390.1:53450807-53450818promoter 内 1217-1228 bp + 2773 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 53438018-53448034(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCCC
SmilChr01G002990 Chr01 NC_080387.1:48829420-48829431promoter 内 1214-1225 bp - 2776 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 48823379-48826644(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACCGACGTGGC
SmilChr04G003397 Chr04 NC_080390.1:50507291-50507302promoter 内 1137-1148 bp - 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 50510155-50510932(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCATGC
SmilChr04G003485 Chr04 NC_080390.1:51301293-51301304promoter 内 796-807 bp - 3194 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 51304498-51308761(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGACGTCAGCA