转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004579; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010264-RA_Salv SmilChr01G004579 MYB XP_057787263.1 MP00132 CTTTTCCAACCACCTTTTC

可能结合的靶基因

9926 个结合位点 7583 个候选靶基因 第 27 / 152 下载 TSV

上一页 27 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004527 Chr01 NC_080387.1:63461058-63461076promoter 内 693-711 bp + 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 63464366-63467673(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATTATTCAACCACTTCCTC
SmilChr02G002697 Chr02 NC_080388.1:46753118-46753136promoter 内 653-671 bp - 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 46749046-46749788(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCATCCCAACCACTAGGCC
SmilChr04G001975 Chr04 NC_080390.1:32007209-32007227promoter 内 542-560 bp + 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 32002398-32003768(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCAGTGGTGGTTGCAGCAC
SmilChr03G003888 Chr03 NC_080389.1:57956247-57956265promoter 内 539-557 bp + 3444 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 57959709-57961036(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCTACCCAACCACCTAACG
SmilChr01G000209 Chr01 NC_080387.1:3709024-3709042promoter 内 446-464 bp - 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 3699722-3705487(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGACTCCAACCACCATTTA
SmilChr04G001771 Chr04 NC_080390.1:29108345-29108363promoter 内 88-106 bp + 3895 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 29101225-29104450(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCGAAGGTGGTTGCAGCGT
SmilChr02G002283 Chr02 NC_080388.1:40298041-40298059promoter 内 30-48 bp - 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 40302012-40303908(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGTGAGTTGGTTGGAAGTG
SmilChr04G002523 Chr04 NC_080390.1:40275397-40275415promoter 内 3939-3957 bp + 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40275459-40278004(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTCAGCCAACCACCATCTC
SmilChr02G003205 Chr02 NC_080388.1:53184361-53184379promoter 内 3925-3943 bp + 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53184437-53187017(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTCAGCCAACCACCATCTC
SmilChr04G000957 Chr04 NC_080390.1:12674446-12674464promoter 内 3846-3864 bp - 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 12674601-12675732(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCGAAGGTGGTTGCAGCGT
SmilChr03G002171 Chr03 NC_080389.1:33769514-33769532promoter 内 3817-3835 bp - 166 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 33769698-33771496(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CGAAGAGTGGTTGGAAGAG
SmilChr05G000296 Chr05 NC_080391.1:2267042-2267060promoter 内 3752-3770 bp + 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 2259730-2266811(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAAGGTGTGGTTGGAGGGT
SmilChr05G002538 Chr05 NC_080391.1:28330629-28330647promoter 内 3453-3471 bp + 530 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 28327685-28330099(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TGGGAAGTGGTTGAGATTA
SmilChr01G000161 Chr01 NC_080387.1:2702176-2702194promoter 内 3276-3294 bp - 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 2701038-2701469(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTCTCCAACCACTGTCCT
SmilChr01G002604 Chr01 NC_080387.1:44238850-44238868promoter 内 3069-3087 bp + 914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 44234632-44237936(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGAAGGTTGGTTGGGGGGA
SmilChr01G005440 Chr01 NC_080387.1:71522498-71522516promoter 内 2930-2948 bp - 1053 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 71519011-71521445(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACTTTTCAACCACCATTGT
SmilChr01G004877 Chr01 NC_080387.1:66869955-66869973promoter 内 2463-2481 bp - 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 66871493-66876814(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGGGGAGTGGTTGATGATG
SmilChr01G000647 Chr01 NC_080387.1:14451140-14451158promoter 内 2406-2424 bp + 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 14448406-14449563(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCATTAGTGGTTGAGGATT
SmilChr04G002249 Chr04 NC_080390.1:36378806-36378824promoter 内 2364-2382 bp - 1619 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36371399-36377187(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TGGCTCCAACCACTTTAAA
SmilChr04G003921 Chr04 NC_080390.1:54895747-54895765promoter 内 2324-2342 bp - 1659 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54889238-54894088(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TACTTCCAACTACCTCAAA
SmilChr03G000987 Chr03 NC_080389.1:11179677-11179695promoter 内 2168-2186 bp + 1815 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11181510-11189568(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAACCACAACCACCGTTGC
SmilChr02G002017 Chr02 NC_080388.1:36326102-36326120promoter 内 2054-2072 bp + 1929 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36328049-36329753(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGTGCCCAACCACTGCTGC
SmilChr01G003406 Chr01 NC_080387.1:52724021-52724039promoter 内 2041-2059 bp + 1942 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 52725981-52727578(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CACCTGCAACCACTTCTTT
SmilChr02G000907 Chr02 NC_080388.1:15701810-15701828promoter 内 2029-2047 bp + 1954 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 15703782-15707926(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CATTTCCAACCACTCTCAA
SmilChr04G002247 Chr04 NC_080390.1:36329996-36330014promoter 内 1839-1857 bp + 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36332158-36339168(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCCTCCCAACCACCCAAAT
SmilChr01G000271 Chr01 NC_080387.1:5366354-5366372promoter 内 1760-1778 bp - 2223 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 5363352-5364131(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCACCGCACCCACCTTCTG
SmilChr01G002869 Chr01 NC_080387.1:47301357-47301375promoter 内 1679-1697 bp - 2304 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47303679-47304702(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGGGGAGTGGTTGATGAAG
SmilChr03G002495 Chr03 NC_080389.1:39741710-39741728promoter 内 1594-1612 bp - 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39744117-39747305(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CGGTGGGTGGTTGAGATTG
SmilChr01G003733 Chr01 NC_080387.1:55628470-55628488promoter 内 1387-1405 bp + 2596 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55618087-55625874(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TAAATGGTGGTTGGAGTCC
SmilChr01G002254 Chr01 NC_080387.1:39196965-39196983promoter 内 1196-1214 bp + 2787 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39192654-39194178(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGCCTAGTGGTTGGGATGG
SmilChr03G003856 Chr03 NC_080389.1:57661576-57661594promoter 内 1143-1161 bp - 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 57653959-57658736(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTTTCTCAACCACTACTAC
SmilChr02G001379 Chr02 NC_080388.1:26102677-26102695promoter 内 1032-1050 bp + 2951 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 26097113-26099726(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACGAAAGTGGGTGGAAAAT
SmilChr02G002860 Chr02 NC_080388.1:48787005-48787023promoter 内 1017-1035 bp + 2966 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48782144-48784039(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCGGCGTTGGTTGGGGTTA
SmilChr04G004113 Chr04 NC_080390.1:56048024-56048042promoter 内 942-960 bp + 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56043982-56044983(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCGGTTGTGGTTGGGAATT
SmilChr04G003190 Chr04 NC_080390.1:48589593-48589611promoter 内 889-907 bp - 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48584890-48586499(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCCCTCCAACCACTGCCTA
SmilChr02G002722 Chr02 NC_080388.1:47061008-47061026promoter 内 883-901 bp + 3100 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47056261-47057908(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTGAAGGTGGGTGGGTCAA
SmilChr04G003915 Chr04 NC_080390.1:54861930-54861948promoter 内 735-753 bp - 3248 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54865196-54868355(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAGGTGGTGGTTGTGTGCG
SmilChr05G000693 Chr05 NC_080391.1:5244274-5244292promoter 内 648-666 bp + 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 5239438-5240939(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAGAAAGTGGTTGCGCAAG
SmilChr04G003325 Chr04 NC_080390.1:49983246-49983264promoter 内 637-655 bp + 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 49978204-49979900(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAAGTAGTGGTTGAGAAAC
SmilChr01G004506 Chr01 NC_080387.1:63163954-63163972promoter 内 569-587 bp - 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 63167386-63168771(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ACGGCGGTGGTTGGCTGAG
SmilChr04G001873 Chr04 NC_080390.1:30559106-30559124promoter 内 552-570 bp - 3431 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 30562555-30565159(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GATGTTGTGGTTGGGAAGT
SmilChr03G002392 Chr03 NC_080389.1:37871595-37871613promoter 内 471-489 bp - 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 37867241-37868083(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTTCGGCAACCACCTCCGG
SmilChr01G001397 Chr01 NC_080387.1:27462370-27462388promoter 内 333-351 bp - 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 27466038-27466984(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGGGTTGTGGTTGGGCGAA
SmilChr04G003877 Chr04 NC_080390.1:54638412-54638430promoter 内 188-206 bp + 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54634544-54634617(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTTAAGTGGTTGAGGTAT
SmilChr02G003823 Chr02 NC_080388.1:59883891-59883909promoter 内 2-20 bp + 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 59887890-59889453(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CTTTGCCAACCACCCGCGT
SmilChr04G002232 Chr04 NC_080390.1:36031822-36031840promoter 内 3400-3418 bp - 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 6 36032423-36033049(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GCGGTGGTGGTTGTTGGCG
SmilChr04G002848 Chr04 NC_080390.1:44590662-44590680promoter 内 3072-3090 bp - 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 5 44585088-44589751(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CGCCAACAACCACCACCGC
SmilChr02G004691 Chr02 NC_080388.1:69261711-69261729promoter 内 3817-3835 bp - 166 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 69261895-69268038(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATAGATGTGGTTGGGTTGG
SmilChr03G004212 Chr03 NC_080389.1:60719440-60719458promoter 内 2876-2894 bp - 1107 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 60715972-60718333(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCAACCCAACCACATCTAT
SmilChr01G004779 Chr01 NC_080387.1:65957728-65957746promoter 内 1943-1961 bp - 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 65959786-65963505(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATAGATGTGGTTGGGTTGG