转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001269; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019281-RA_Salv SmilChr05G001269 G2-like XP_057765199.1 MP00252 AAAAGAATATTCC

可能结合的靶基因

9780 个结合位点 6478 个候选靶基因 第 28 / 130 下载 TSV

上一页 28 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005347 Chr02 NC_080388.1:74282913-74282925promoter 内 3076-3088 bp + 913 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 74283838-74287538(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAAGAATATTTC
SmilChr03G002039 Chr03 NC_080389.1:30777227-30777239promoter 内 1799-1811 bp + 2190 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 30779429-30780497(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TTGGGTATATTCC
SmilChr01G001711 Chr01 NC_080387.1:31578493-31578505promoter 内 536-548 bp + 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 31581958-31585419(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAAGAATATACT
SmilChr02G004133 Chr02 NC_080388.1:63599463-63599475promoter 内 291-303 bp + 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 63594719-63595765(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGAATATTCGAGT
SmilChr02G003848 Chr02 NC_080388.1:60218420-60218432promoter 内 3566-3578 bp - 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 60218855-60219814(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCTTCT
SmilChr01G004513 Chr01 NC_080387.1:63257584-63257596promoter 内 3328-3340 bp - 661 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 63258257-63262797(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCTTT
SmilChr02G004135 Chr02 NC_080388.1:63599463-63599475promoter 内 2961-2973 bp + 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 63600503-63600976(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ACTCGAATATTCG
SmilChr01G002450 Chr01 NC_080387.1:42094209-42094221promoter 内 2890-2902 bp - 1099 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 42095320-42108801(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGAATATTCTTGA
SmilChr01G005632 Chr01 NC_080387.1:72769443-72769455promoter 内 2536-2548 bp + 1453 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 72766936-72767990(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGCATATTCTTTA
SmilChr02G001147 Chr02 NC_080388.1:20869712-20869724promoter 内 2025-2037 bp - 1964 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 20871688-20874281(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATACCGGT
SmilChr02G003846 Chr02 NC_080388.1:60218420-60218432promoter 内 1038-1050 bp - 2951 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 60211654-60215469(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAAGAATATTTC
SmilChr01G001281 Chr01 NC_080387.1:25593751-25593763promoter 内 971-983 bp - 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 25596781-25598648(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTCAT
SmilChr02G002439 Chr02 NC_080388.1:42593320-42593332promoter 内 806-818 bp + 3183 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 42596515-42599981(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AACCGAATATTTC
SmilChr03G001546 Chr03 NC_080389.1:19394907-19394919promoter 内 659-671 bp - 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 19388937-19391577(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAGGAATATTTC
SmilChr01G003125 Chr01 NC_080387.1:50074356-50074368promoter 内 335-347 bp + 3654 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 50069069-50070702(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGAATATTCGAGT
SmilChr01G003302 Chr01 NC_080387.1:51707088-51707100promoter 内 52-64 bp - 3937 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 51701491-51703151(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAGGAATATTTT
SmilChr01G004087 Chr01 NC_080387.1:59275354-59275366promoter 内 3927-3939 bp + 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 59275428-59277249(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGAAGAATATTTC
SmilChr02G002429 Chr02 NC_080388.1:42310074-42310086promoter 内 3774-3786 bp + 215 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42310301-42311440(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ACAAGTATATTCC
SmilChr01G002359 Chr01 NC_080387.1:40760832-40760844promoter 内 3692-3704 bp + 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 40761141-40763492(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATGGAATATTTC
SmilChr01G004294 Chr01 NC_080387.1:61137588-61137600promoter 内 3174-3186 bp + 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 61138415-61143048(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGCAGAATATACC
SmilChr02G003650 Chr02 NC_080388.1:57887597-57887609promoter 内 2827-2839 bp + 1162 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57880193-57886435(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCTTT
SmilChr01G001061 Chr01 NC_080387.1:21923442-21923454promoter 内 2695-2707 bp + 1294 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 21924748-21926213(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGAGAATATTCA
SmilChr01G004696 Chr01 NC_080387.1:65058936-65058948promoter 内 2346-2358 bp - 1643 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 65060591-65062244(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCTTT
SmilChr01G002458 Chr01 NC_080387.1:42200781-42200793promoter 内 2148-2160 bp + 1841 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42202634-42205023(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAAGAATATGCC
SmilChr01G004080 Chr01 NC_080387.1:59215881-59215893promoter 内 2082-2094 bp - 1907 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 59217800-59219762(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATACGCAC
SmilChr01G003686 Chr01 NC_080387.1:55242186-55242198promoter 内 1825-1837 bp + 2164 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 55238048-55240022(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATACTTGT
SmilChr02G001824 Chr02 NC_080388.1:33269778-33269790promoter 内 1624-1636 bp + 2365 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 33264556-33267413(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGATATTCTTCC
SmilChr01G004292 Chr01 NC_080387.1:61137588-61137600promoter 内 1575-1587 bp + 2414 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 61132968-61135174(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGTATATTCTGCA
SmilChr01G003024 Chr01 NC_080387.1:49299388-49299400promoter 内 1514-1526 bp + 2475 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 49291554-49296913(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATGCTTGG
SmilChr01G000464 Chr01 NC_080387.1:9522168-9522180promoter 内 944-956 bp - 3045 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 9525225-9527003(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGGATATTCTCTA
SmilChr01G001298 Chr01 NC_080387.1:25849298-25849310promoter 内 766-778 bp + 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 25852533-25856306(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATCAGAATATCCG
SmilChr02G005095 Chr02 NC_080388.1:72526820-72526832promoter 内 741-753 bp - 3248 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 72521755-72523572(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATGAGAATATCCT
SmilChr01G002487 Chr01 NC_080387.1:42597941-42597953promoter 内 706-718 bp - 3283 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 42601236-42602303(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCTTT
SmilChr03G002191 Chr03 NC_080389.1:34395547-34395559promoter 内 670-682 bp - 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 34398878-34408496(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTCCT
SmilChr02G003795 Chr02 NC_080388.1:59600545-59600557promoter 内 464-476 bp + 3525 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 59592143-59597020(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTTCC
SmilChr01G003130 Chr01 NC_080387.1:50135187-50135199promoter 内 361-373 bp - 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 50127737-50131559(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CCAAGCATATTCC
SmilChr01G006064 Chr01 NC_080387.1:76059316-76059328promoter 内 199-211 bp - 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 76063118-76066924(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATACTTGT
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SmilChr01G003416 Chr01 NC_080387.1:52797182-52797194promoter 内 3498-3510 bp + 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 52797685-52800784(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGGGAATATTCA
SmilChr03G001107 Chr03 NC_080389.1:12756761-12756773promoter 内 2935-2947 bp + 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 12757827-12758819(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAAGAATATTTC
SmilChr02G003259 Chr02 NC_080388.1:53892258-53892270promoter 内 2928-2940 bp - 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 53887621-53891197(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGGAGTATATTCC
SmilChr01G002702 Chr01 NC_080387.1:45291721-45291733promoter 内 1514-1526 bp + 2475 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 45294208-45295405(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr02G003260 Chr02 NC_080388.1:53892258-53892270promoter 内 568-580 bp - 3421 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 53895691-53899274(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATACTCCA
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SmilChr02G002504 Chr02 NC_080388.1:43533040-43533052promoter 内 3199-3211 bp + 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 43533842-43537575(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGGAGTATATTCC
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SmilChr01G004147 Chr01 NC_080387.1:59994930-59994942promoter 内 2790-2802 bp - 1199 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 59990548-59993731(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAAGAATATTCA