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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 29 / 136 下载 TSV

上一页 29 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000918 Chr03 NC_080389.1:10492681-10492691promoter 内 2222-2232 bp + 1769 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 10486447-10490912(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCT
SmilChr02G002371 Chr02 NC_080388.1:41518493-41518503promoter 内 2215-2225 bp - 1776 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 41520279-41524958(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
SmilChr08G001594 Chr08 NC_080394.1:13176741-13176751promoter 内 2145-2155 bp - 1846 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 13178597-13181066(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCT
SmilChr08G001606 Chr08 NC_080394.1:13298107-13298117promoter 内 2106-2116 bp - 1885 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 13300002-13302311(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCT
SmilChr06G000361 Chr06 NC_080392.1:2760243-2760253promoter 内 1961-1971 bp - 2030 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 2762283-2765846(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
SmilChr01G001205 Chr01 NC_080387.1:24262054-24262064promoter 内 1875-1885 bp + 2116 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 24264180-24277907(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGT
SmilChr03G000923 Chr03 NC_080389.1:10570179-10570189promoter 内 1869-1879 bp + 2122 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 10561337-10568057(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCT
SmilChr02G003436 Chr02 NC_080388.1:55598791-55598801promoter 内 1815-1825 bp + 2176 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 55589245-55596615(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGCT
SmilChr03G000919 Chr03 NC_080389.1:10492681-10492691promoter 内 1785-1795 bp + 2206 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 10494897-10518912(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGT
SmilChr07G001464 Chr07 NC_080393.1:11490438-11490448promoter 内 1777-1787 bp + 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 11487473-11488224(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCT
SmilChr02G004364 Chr02 NC_080388.1:65932293-65932303promoter 内 1712-1722 bp - 2279 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 65934582-65938264(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
SmilChr07G001287 Chr07 NC_080393.1:9901073-9901083promoter 内 1696-1706 bp - 2295 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 9903378-9906398(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGGT
SmilChr04G000828 Chr04 NC_080390.1:10434648-10434658promoter 内 1688-1698 bp + 2303 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 10436961-10437734(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCT
SmilChr06G000594 Chr06 NC_080392.1:5113933-5113943promoter 内 1650-1660 bp + 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 5116284-5118832(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTC
SmilChr04G003497 Chr04 NC_080390.1:51385900-51385910promoter 内 1519-1529 bp + 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 51388382-51391111(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGG
SmilChr05G002028 Chr05 NC_080391.1:21062037-21062047promoter 内 1514-1524 bp + 2477 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 21064524-21068807(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCCCAGCGCG
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SmilChr08G004776 Chr08 NC_080394.1:57100820-57100830promoter 内 1097-1107 bp + 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 57103724-57105775(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTC
SmilChr06G001866 Chr06 NC_080392.1:22074348-22074358promoter 内 929-939 bp + 3062 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 22068029-22071286(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
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SmilChr07G003674 Chr07 NC_080393.1:44071499-44071509promoter 内 856-866 bp - 3135 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 44074644-44078672(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
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SmilChr03G002059 Chr03 NC_080389.1:31363104-31363114promoter 内 790-800 bp - 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 31366315-31369436(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
SmilChr03G001773 Chr03 NC_080389.1:24186366-24186376promoter 内 758-768 bp + 3233 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 24180198-24183133(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
SmilChr06G000911 Chr06 NC_080392.1:8581612-8581622promoter 内 711-721 bp - 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 8584902-8585833(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCT
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SmilChr04G001027 Chr04 NC_080390.1:14418039-14418049promoter 内 611-621 bp - 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 14421429-14424490(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGTT
SmilChr05G002724 Chr05 NC_080391.1:31349267-31349277promoter 内 455-465 bp - 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 31339663-31345731(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGT
SmilChr01G004829 Chr01 NC_080387.1:66439465-66439475promoter 内 395-405 bp + 3596 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 66434750-66435869(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCG
SmilChr05G003864 Chr05 NC_080391.1:52226215-52226225promoter 内 336-346 bp + 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 52222487-52222560(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCG
SmilChr03G001134 Chr03 NC_080389.1:13070740-13070750promoter 内 61-71 bp - 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 13074680-13077615(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGCT
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SmilChr06G001743 Chr06 NC_080392.1:20153491-20153501promoter 内 3990-4000 bp + 1 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 20153502-20164577(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGCA
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SmilChr07G001884 Chr07 NC_080393.1:16306573-16306583promoter 内 1701-1711 bp + 2290 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 16308873-16315457(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTG
SmilChr03G002831 Chr03 NC_080389.1:44809105-44809115promoter 内 1030-1040 bp + 2961 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 44804631-44806144(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTG
SmilChr01G001294 Chr01 NC_080387.1:25762975-25762985promoter 内 106-116 bp - 3885 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 25766870-25771005(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGCC
SmilChr05G000193 Chr05 NC_080391.1:1592862-1592872promoter 内 3938-3948 bp + 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 1547844-1592809(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGGT
SmilChr06G003176 Chr06 NC_080392.1:44689394-44689404promoter 内 3816-3826 bp + 175 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 44689579-44695390(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGCA
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SmilChr03G000180 Chr03 NC_080389.1:1933841-1933851promoter 内 3368-3378 bp + 623 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 1928414-1933218(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGGT
SmilChr07G004637 Chr07 NC_080393.1:59231301-59231311promoter 内 3169-3179 bp + 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 59228857-59230479(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGGT
SmilChr02G000686 Chr02 NC_080388.1:10827994-10828004promoter 内 3007-3017 bp + 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 10828988-10829543(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTG
SmilChr02G003789 Chr02 NC_080388.1:59530513-59530523promoter 内 3007-3017 bp + 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 59531507-59532062(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTG