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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 34 / 139 下载 TSV

上一页 34 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001639 Chr02 NC_080388.1:30410693-30410704promoter 内 1232-1243 bp - 2758 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 30413462-30415790(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGGT
SmilChr01G001616 Chr01 NC_080387.1:30283044-30283055promoter 内 1164-1175 bp + 2826 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 30278689-30280218(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCCGCG
SmilChr04G000344 Chr04 NC_080390.1:3167927-3167938promoter 内 1122-1133 bp + 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 3164241-3165059(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGAG
SmilChr03G002938 Chr03 NC_080389.1:46111743-46111754promoter 内 1103-1114 bp + 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 46107894-46108856(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGAG
SmilChr02G000327 Chr02 NC_080388.1:4134722-4134733promoter 内 980-991 bp + 3010 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 4130655-4131712(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGAG
SmilChr04G002825 Chr04 NC_080390.1:44324957-44324968promoter 内 970-981 bp + 3020 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 44327988-44329322(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCCCACGTGGC
SmilChr04G003018 Chr04 NC_080390.1:46566047-46566058promoter 内 914-925 bp - 3076 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 46557291-46562971(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACAGACGTGGC
SmilChr03G000655 Chr03 NC_080389.1:7273809-7273820promoter 内 879-890 bp - 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 7269520-7270698(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGC
SmilChr02G005293 Chr02 NC_080388.1:73919089-73919100promoter 内 854-865 bp + 3136 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 73915211-73915953(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGAG
SmilChr03G004562 Chr03 NC_080389.1:63558080-63558091promoter 内 826-837 bp - 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 63561255-63565218(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGACA
SmilChr02G000857 Chr02 NC_080388.1:14641709-14641720promoter 内 825-836 bp - 3165 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 14637642-14638544(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCTGACGTGGA
SmilChr03G000563 Chr03 NC_080389.1:6114238-6114249promoter 内 824-835 bp + 3166 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 6117415-6118876(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGC
SmilChr01G000910 Chr01 NC_080387.1:19169774-19169785promoter 内 823-834 bp - 3167 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 19172952-19173816(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGAG
SmilChr02G000739 Chr02 NC_080388.1:11978708-11978719promoter 内 780-791 bp + 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 11981929-11982861(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCCCACGTGGC
SmilChr04G003016 Chr04 NC_080390.1:46558131-46558142promoter 内 724-735 bp + 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 46553509-46554865(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGGT
SmilChr03G001723 Chr03 NC_080389.1:23137894-23137905promoter 内 665-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 23133489-23134569(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACAGACGTGGC
SmilChr01G004449 Chr01 NC_080387.1:62601651-62601662promoter 内 648-659 bp - 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 62597685-62598309(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGC
SmilChr04G001659 Chr04 NC_080390.1:27559865-27559876promoter 内 593-604 bp + 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 27563273-27563987(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCCCACGTGGC
SmilChr01G001794 Chr01 NC_080387.1:32809525-32809536promoter 内 490-501 bp - 3500 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 32813036-32817226(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGAG
SmilChr02G002844 Chr02 NC_080388.1:48574566-48574577promoter 内 485-496 bp - 3505 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 48578082-48580292(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGAC
SmilChr03G000832 Chr03 NC_080389.1:9559134-9559145promoter 内 452-463 bp - 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 9548359-9555596(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTCGACGTGGC
SmilChr01G005608 Chr01 NC_080387.1:72619697-72619708promoter 内 378-389 bp - 3612 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 72613265-72616085(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCCACGTGGC
SmilChr03G000531 Chr03 NC_080389.1:5687620-5687631promoter 内 351-362 bp + 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 5691270-5693390(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCCCACGTGGC
SmilChr03G004622 Chr03 NC_080389.1:63895461-63895472promoter 内 296-307 bp + 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 63899166-63902492(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCCCACGTGGC
SmilChr04G003834 Chr04 NC_080390.1:54383158-54383169promoter 内 236-247 bp - 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 54386923-54390307(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAGGG
SmilChr04G001913 Chr04 NC_080390.1:31229081-31229092promoter 内 114-125 bp + 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 31223803-31225205(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGTCA
SmilChr04G003919 Chr04 NC_080390.1:54876964-54876975promoter 内 112-123 bp + 3878 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 54880853-54883102(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCTGACGTGGA
SmilChr03G002433 Chr03 NC_080389.1:38626642-38626653promoter 内 83-94 bp - 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 38630560-38633258(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGAG
SmilChr03G003629 Chr03 NC_080389.1:54962542-54962553promoter 内 81-92 bp - 3909 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 54966462-54969699(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCCGCG
SmilChr01G001618 Chr01 NC_080387.1:30283044-30283055promoter 内 74-85 bp + 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 30286971-30294955(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGC
SmilChr01G000226 Chr01 NC_080387.1:4017336-4017347promoter 内 45-56 bp + 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 4010354-4013391(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGGT
SmilChr04G003232 Chr04 NC_080390.1:49148932-49148943promoter 内 3527-3538 bp + 463 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 4 49146843-49148469(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGCA
SmilChr04G003327 Chr04 NC_080390.1:49998967-49998978promoter 内 3502-3513 bp + 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 4 49996884-49998479(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGCA
SmilChr02G001541 Chr02 NC_080388.1:28674043-28674054promoter 内 2568-2579 bp - 1422 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 4 28672181-28672621(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCAGACGTGGA
SmilChr04G000195 Chr04 NC_080390.1:1727009-1727020promoter 内 2124-2135 bp + 1866 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 4 1724233-1725143(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCCG
SmilChr02G001542 Chr02 NC_080388.1:28674043-28674054promoter 内 1117-1128 bp - 2873 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 4 28676927-28682190(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGCA
SmilChr03G001536 Chr03 NC_080389.1:19265704-19265715promoter 内 3961-3972 bp - 29 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 19261872-19265675(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGTGTA
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SmilChr01G001628 Chr01 NC_080387.1:30346746-30346757promoter 内 3988-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 30341174-30346744(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCATCACGTGGC
SmilChr01G003001 Chr01 NC_080387.1:48986384-48986395promoter 内 3952-3963 bp + 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 48986433-48988887(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGTGTA
SmilChr04G000811 Chr04 NC_080390.1:10131682-10131693promoter 内 3725-3736 bp - 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 10131958-10141812(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGCA
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SmilChr04G000810 Chr04 NC_080390.1:10131682-10131693promoter 内 2455-2466 bp - 1535 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 10128874-10130147(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCAGACGTGGA
SmilChr01G001561 Chr01 NC_080387.1:29625369-29625380promoter 内 2361-2372 bp + 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 29627009-29628114(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCAGACGTGGA
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SmilChr03G002887 Chr03 NC_080389.1:45526381-45526392promoter 内 936-947 bp + 3054 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 45520383-45523327(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGCA