转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 35 / 148 下载 TSV

上一页 35 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G000928 Chr07 NC_080393.1:6619260-6619273promoter 内 911-924 bp - 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 6622350-6624231(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCATCAT
SmilChr02G000876 Chr02 NC_080388.1:15084712-15084725promoter 内 654-667 bp - 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 15080626-15081378(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAATGTCACGTGC
SmilChr04G003001 Chr04 NC_080390.1:46404953-46404966promoter 内 505-518 bp + 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 46408449-46422261(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATGCGACACGTGG
SmilChr04G003215 Chr04 NC_080390.1:48988380-48988393promoter 内 449-462 bp - 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 48970628-48984841(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATGCGACACGTGG
SmilChr02G004500 Chr02 NC_080388.1:67500468-67500481promoter 内 233-246 bp + 3755 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 67504236-67504990(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATGCGACACGTGG
SmilChr08G000916 Chr08 NC_080394.1:6787464-6787477promoter 内 232-245 bp + 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 6781406-6783708(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATACG
SmilChr05G002362 Chr05 NC_080391.1:25651628-25651641promoter 内 126-139 bp + 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 25655503-25657209(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CACAGGGCACGTGG
SmilChr07G002202 Chr07 NC_080393.1:20261267-20261280promoter 内 2060-2073 bp - 1928 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 20263208-20278573(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCATGAT
SmilChr04G003963 Chr04 NC_080390.1:55127854-55127867promoter 内 1745-1758 bp + 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 55130110-55131123(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAAGGTCACGTGT
SmilChr07G000229 Chr07 NC_080393.1:1482642-1482655promoter 内 753-766 bp - 3235 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 1485890-1487849(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTCTCT
SmilChr07G002065 Chr07 NC_080393.1:18780073-18780086promoter 内 285-298 bp + 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 18774292-18776370(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCGTCA
SmilChr08G001142 Chr08 NC_080394.1:9003015-9003028promoter 内 27-40 bp + 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 9006989-9012934(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGAGCTCACGTGT
SmilChr01G005291 Chr01 NC_080387.1:70227902-70227915promoter 内 22-35 bp + 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 70231881-70234315(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCAAGCCACGTGG
SmilChr06G003237 Chr06 NC_080392.1:45078494-45078507promoter 内 3854-3867 bp - 134 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 45078641-45080191(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTCGAC
SmilChr04G004106 Chr04 NC_080390.1:56020419-56020432promoter 内 2903-2916 bp - 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 56016397-56019334(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGACGGGCACGTGG
SmilChr01G004399 Chr01 NC_080387.1:62122342-62122355promoter 内 2880-2893 bp + 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 62123463-62125691(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CACGTGACACGTGG
SmilChr07G002457 Chr07 NC_080393.1:23088388-23088401promoter 内 2849-2862 bp - 1139 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 23089540-23091704(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACTGCT
SmilChr07G002083 Chr07 NC_080393.1:18946729-18946742promoter 内 2546-2559 bp + 1442 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 18948184-18948253(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAGAGTCACGTGA
SmilChr02G002451 Chr02 NC_080388.1:42758350-42758363promoter 内 2349-2362 bp - 1639 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 42760002-42761349(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATCTT
SmilChr01G003642 Chr01 NC_080387.1:54923437-54923450promoter 内 2329-2342 bp + 1659 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 54919370-54921778(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTACCT
SmilChr01G003644 Chr01 NC_080387.1:54923437-54923450promoter 内 2317-2330 bp + 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 54925121-54932996(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTAGACACGTGG
SmilChr07G000501 Chr07 NC_080393.1:3511985-3511998promoter 内 2151-2164 bp + 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 3508671-3510148(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATCTT
SmilChr06G001019 Chr06 NC_080392.1:10082533-10082546promoter 内 2053-2066 bp - 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 10084481-10086508(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTTCAT
SmilChr02G002450 Chr02 NC_080388.1:42758350-42758363promoter 内 1527-1540 bp - 2461 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 42755311-42755889(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGATGACACGTGG
SmilChr06G003236 Chr06 NC_080392.1:45078494-45078507promoter 内 1516-1529 bp - 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 45073365-45076022(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCGACACACGTGG
SmilChr06G001022 Chr06 NC_080392.1:10132918-10132931promoter 内 1511-1524 bp - 2477 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 10129660-10130441(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGAAGCCACGTGG
SmilChr04G001061 Chr04 NC_080390.1:15181322-15181335promoter 内 1432-1445 bp + 2556 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 15183891-15184523(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGGAATCACGTGG
SmilChr02G005314 Chr02 NC_080388.1:74027336-74027349promoter 内 1380-1393 bp + 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 74029957-74031686(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGATGACACGTGG
SmilChr04G002738 Chr04 NC_080390.1:43056629-43056642promoter 内 1308-1321 bp + 2680 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 43053877-43053949(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATCTT
SmilChr01G005290 Chr01 NC_080387.1:70227902-70227915promoter 内 1276-1289 bp + 2712 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 70230627-70231738(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCAAGCCACGTGG
SmilChr05G000416 Chr05 NC_080391.1:3147565-3147578promoter 内 1262-1275 bp + 2726 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 3143893-3144839(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTTTT
SmilChr06G001023 Chr06 NC_080392.1:10132918-10132931promoter 内 1062-1075 bp - 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 10135857-10137909(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTTCAT
SmilChr06G001018 Chr06 NC_080392.1:10082533-10082546promoter 内 33-46 bp - 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 10077835-10078578(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGAAGCCACGTGG
SmilChr02G004459 Chr02 NC_080388.1:67016067-67016080promoter 内 3800-3813 bp - 188 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 66989070-67015879(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAACGTCACGTGA
SmilChr04G003961 Chr04 NC_080390.1:55127854-55127867promoter 内 3720-3733 bp + 268 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 55125607-55127586(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACCTTCA
SmilChr03G001187 Chr03 NC_080389.1:13678024-13678037promoter 内 3707-3720 bp - 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 13655651-13677743(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCACAACACGTGG
SmilChr01G001113 Chr01 NC_080387.1:22742129-22742142promoter 内 3613-3626 bp + 375 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 22737791-22741754(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGATCCT
SmilChr07G001704 Chr07 NC_080393.1:14453918-14453931promoter 内 3423-3436 bp - 565 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 14449617-14453353(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAAGGTCACGTGT
SmilChr01G000339 Chr01 NC_080387.1:6938235-6938248promoter 内 3363-3376 bp + 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 6938873-6941858(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCCGGACACGTGG
SmilChr05G001159 Chr05 NC_080391.1:9733417-9733430promoter 内 3268-3281 bp - 720 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 9734150-9735607(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATCTT
SmilChr07G000857 Chr07 NC_080393.1:6102971-6102984promoter 内 3230-3243 bp - 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 6103742-6108402(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACCTAAG
SmilChr05G002411 Chr05 NC_080391.1:26623072-26623085promoter 内 3200-3213 bp - 788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 26620663-26622284(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAAGGGCACGTGG
SmilChr07G003268 Chr07 NC_080393.1:34442365-34442378promoter 内 3035-3048 bp - 953 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 34440662-34441412(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGAGTACACGTGG
SmilChr07G001738 Chr07 NC_080393.1:14762513-14762526promoter 内 2812-2825 bp + 1176 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 14760000-14761337(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACCTTCA
SmilChr01G005753 Chr01 NC_080387.1:73620156-73620169promoter 内 2803-2816 bp + 1185 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 73617899-73618971(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATCTT
SmilChr08G000807 Chr08 NC_080394.1:5951425-5951438promoter 内 2776-2789 bp - 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 5952650-5954251(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGGCGAT
SmilChr06G000042 Chr06 NC_080392.1:358463-358476promoter 内 2750-2763 bp + 1238 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 356006-357225(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCCATT
SmilChr05G001419 Chr05 NC_080391.1:12835403-12835416promoter 内 2629-2642 bp - 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 12829427-12834044(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAAGGGCACGTGG
SmilChr03G001031 Chr03 NC_080389.1:12017320-12017333promoter 内 2328-2341 bp - 1660 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 12013561-12015660(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGATGACACGTGG
SmilChr04G004073 Chr04 NC_080390.1:55823277-55823290promoter 内 2305-2318 bp + 1683 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 55824973-55827185(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCATGCCACGTGG