转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 36 / 134 下载 TSV

上一页 36 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003293 Chr01 NC_080387.1:51621629-51621641promoter 内 2679-2691 bp + 1310 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 51622951-51629226(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTAAGGGATAAGG
SmilChr02G001360 Chr02 NC_080388.1:25436666-25436678promoter 内 2618-2630 bp + 1371 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 25433017-25435295(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGGAAG
SmilChr02G001045 Chr02 NC_080388.1:18510816-18510828promoter 内 2145-2157 bp - 1844 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 18507736-18508972(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AACTTGGATAAGG
SmilChr02G003799 Chr02 NC_080388.1:59622622-59622634promoter 内 2118-2130 bp - 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 59619165-59620751(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAACTGGATAAGA
SmilChr03G002024 Chr03 NC_080389.1:30354855-30354867promoter 内 1936-1948 bp + 2053 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 30351231-30352802(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGGAAG
SmilChr01G001439 Chr01 NC_080387.1:28052740-28052752promoter 内 1698-1710 bp + 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 28050333-28050449(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATTCG
SmilChr02G001193 Chr02 NC_080388.1:21957721-21957733promoter 内 1549-1561 bp + 2440 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 21960173-21963698(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTGGCGGATAAGG
SmilChr01G001349 Chr01 NC_080387.1:26768321-26768333promoter 内 1210-1222 bp + 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 26756632-26765542(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCAAAG
SmilChr01G003486 Chr01 NC_080387.1:53421117-53421129promoter 内 1001-1013 bp + 2988 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 53416969-53418129(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAGTT
SmilChr02G005291 Chr02 NC_080388.1:73910693-73910705promoter 内 973-985 bp + 3016 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 73906407-73907677(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCACTTT
SmilChr02G001608 Chr02 NC_080388.1:29949640-29949652promoter 内 860-872 bp - 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 29944973-29946511(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTAAGGATAAGG
SmilChr02G000003 Chr02 NC_080388.1:25816-25828promoter 内 518-530 bp - 3471 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 21172-22345(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATATAAGATAAGG
SmilChr02G000493 Chr02 NC_080388.1:6747666-6747678promoter 内 515-527 bp + 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 6751152-6755117(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATATAAGATAAGG
SmilChr01G002439 Chr01 NC_080387.1:41977626-41977638promoter 内 390-402 bp - 3599 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 41968455-41974027(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATATAAGATAAGG
SmilChr01G000319 Chr01 NC_080387.1:6221573-6221585promoter 内 290-302 bp + 3699 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 6216030-6217874(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTTAGG
SmilChr02G004695 Chr02 NC_080388.1:69291190-69291202promoter 内 3891-3903 bp + 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 69290475-69291092(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATCA
SmilChr02G001535 Chr02 NC_080388.1:28601263-28601275promoter 内 3884-3896 bp - 105 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 28601380-28601452(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATCA
SmilChr01G001473 Chr01 NC_080387.1:28492286-28492298promoter 内 3824-3836 bp - 165 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 28492463-28493845(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAGTT
SmilChr01G001488 Chr01 NC_080387.1:28658106-28658118promoter 内 3739-3751 bp + 250 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 28658368-28662849(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATTCAGATAAGG
SmilChr01G004849 Chr01 NC_080387.1:66640662-66640674promoter 内 3148-3160 bp + 841 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 66636330-66639821(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCTCTAC
SmilChr01G002605 Chr01 NC_080387.1:44245372-44245384promoter 内 2935-2947 bp + 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 44246438-44247302(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAATAGATAAGG
SmilChr01G004771 Chr01 NC_080387.1:65889812-65889824promoter 内 2796-2808 bp + 1193 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 65882451-65888619(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCCAAT
SmilChr02G004141 Chr02 NC_080388.1:63734017-63734029promoter 内 2641-2653 bp + 1348 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 63731730-63732669(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATAT
SmilChr02G005246 Chr02 NC_080388.1:73611350-73611362promoter 内 2636-2648 bp - 1353 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 73608614-73609997(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGAGTGGATAAGC
SmilChr02G003319 Chr02 NC_080388.1:54457358-54457370promoter 内 2606-2618 bp + 1383 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54453435-54455975(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATAT
SmilChr02G001221 Chr02 NC_080388.1:22409261-22409273promoter 内 2448-2460 bp + 1541 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 22404995-22407720(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAGTT
SmilChr02G001310 Chr02 NC_080388.1:24338426-24338438promoter 内 2425-2437 bp - 1564 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 24340002-24340595(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTACA
SmilChr01G002788 Chr01 NC_080387.1:46353414-46353426promoter 内 2417-2429 bp + 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 46347565-46351842(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATAT
SmilChr02G004045 Chr02 NC_080388.1:62761825-62761837promoter 内 2368-2380 bp - 1621 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 62756637-62760204(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AACTTGGATAAGG
SmilChr02G001359 Chr02 NC_080388.1:25418144-25418156promoter 内 2259-2271 bp + 1730 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 25413893-25416414(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGGAAG
SmilChr02G000455 Chr02 NC_080388.1:6095300-6095312promoter 内 2127-2139 bp + 1862 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 6086635-6093438(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAAGTT
SmilChr01G001472 Chr01 NC_080387.1:28492286-28492298promoter 内 1960-1972 bp - 2029 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 28487620-28490257(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AACTTGGATAAGG
SmilChr02G003011 Chr02 NC_080388.1:50762775-50762787promoter 内 1836-1848 bp - 2153 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 50759571-50760622(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTGGCGGATAAGG
SmilChr03G001359 Chr03 NC_080389.1:15960878-15960890promoter 内 1836-1848 bp + 2153 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 15956471-15958725(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATTCA
SmilChr02G001536 Chr02 NC_080388.1:28601263-28601275promoter 内 1763-1775 bp - 2226 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 28603501-28604426(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATCA
SmilChr02G001533 Chr02 NC_080388.1:28601263-28601275promoter 内 1751-1763 bp - 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 28598548-28599025(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGATTGGATAAGA
SmilChr02G001731 Chr02 NC_080388.1:31802193-31802205promoter 内 1701-1713 bp + 2288 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 31799366-31799905(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTCAAG
SmilChr02G001293 Chr02 NC_080388.1:23820092-23820104promoter 内 1633-1645 bp + 2356 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 23815193-23817736(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTTACC
SmilChr01G002260 Chr01 NC_080387.1:39398788-39398800promoter 内 1588-1600 bp + 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 39392484-39396387(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATAT
SmilChr01G001268 Chr01 NC_080387.1:25353253-25353265promoter 内 1323-1335 bp + 2666 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 25355931-25363173(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTATGGATAAGA
SmilChr02G003176 Chr02 NC_080388.1:52885575-52885587promoter 内 1274-1286 bp + 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 52888302-52888943(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTGGCGGATAAGG
SmilChr01G002290 Chr01 NC_080387.1:39740157-39740169promoter 内 1265-1277 bp + 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 39735727-39737433(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATAT
SmilChr01G005130 Chr01 NC_080387.1:69100500-69100512promoter 内 1249-1261 bp + 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 69096784-69097760(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAGTGC
SmilChr02G001309 Chr02 NC_080388.1:24338426-24338438promoter 内 1154-1166 bp - 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 24321846-24335591(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTAAAGATAAGG
SmilChr02G003318 Chr02 NC_080388.1:54457358-54457370promoter 内 1045-1057 bp + 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54453435-54454414(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATAT
SmilChr01G000100 Chr01 NC_080387.1:1811962-1811974promoter 内 1029-1041 bp - 2960 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 1806014-1809002(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATATAAGATAAGG
SmilChr01G000099 Chr01 NC_080387.1:1803212-1803224promoter 内 1028-1040 bp - 2961 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 1797263-1800251(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATATAAGATAAGG
SmilChr02G001311 Chr02 NC_080388.1:24338426-24338438promoter 内 849-861 bp - 3140 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 24341578-24343361(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTACA
SmilChr02G004240 Chr02 NC_080388.1:64586104-64586116promoter 内 776-788 bp - 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 64589329-64596205(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATTGG
SmilChr02G005245 Chr02 NC_080388.1:73611350-73611362promoter 内 631-643 bp - 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 73605015-73607992(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGAGTGGATAAGC