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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 38 / 149 下载 TSV

上一页 38 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002640 Chr02 NC_080388.1:45795664-45795678promoter 内 620-634 bp + 3367 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 45799045-45801818(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCTTATCCTCTCT
SmilChr03G000994 Chr03 NC_080389.1:11311107-11311121promoter 内 604-618 bp + 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 11306232-11307724(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCTGGATAAGCTT
SmilChr02G002595 Chr02 NC_080388.1:45097250-45097264promoter 内 589-603 bp + 3398 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 45100662-45103349(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCTTATCCTCTCT
SmilChr03G002572 Chr03 NC_080389.1:40900934-40900948promoter 内 579-593 bp - 3408 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 40904356-40905561(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAATATA
SmilChr01G000483 Chr01 NC_080387.1:9894876-9894890promoter 内 529-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 9898348-9899628(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATGGATAAGAAC
SmilChr02G001093 Chr02 NC_080388.1:19694935-19694949promoter 内 438-452 bp - 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 19698498-19699654(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCTGGATAAGCTT
SmilChr04G001583 Chr04 NC_080390.1:26323488-26323502promoter 内 427-441 bp + 3560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 26318550-26319928(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCTGGATAAGCTT
SmilChr03G000038 Chr03 NC_080389.1:455431-455445promoter 内 415-429 bp - 3572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 459017-461513(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTTTGGATAAGCTG
SmilChr01G006022 Chr01 NC_080387.1:75809397-75809411promoter 内 282-296 bp + 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 75800542-75805692(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGTTTAGATAAGGTG
SmilChr02G001412 Chr02 NC_080388.1:26760868-26760882promoter 内 240-254 bp + 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 26752421-26757121(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTACGGATAAGGAC
SmilChr01G005660 Chr01 NC_080387.1:72937596-72937610promoter 内 166-180 bp - 3821 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72941431-72945167(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CTTGTGGATAAAGCT
SmilChr03G002585 Chr03 NC_080389.1:41111067-41111081promoter 内 155-169 bp - 3832 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 41114913-41117680(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTAGTGGATAATATT
SmilChr01G003435 Chr01 NC_080387.1:52971449-52971463promoter 内 147-161 bp + 3840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52975303-52976891(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTCCTTATCCGTAAT
SmilChr04G001939 Chr04 NC_080390.1:31507207-31507221promoter 内 107-121 bp + 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 31501114-31503327(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTATTGGATAAGTTA
SmilChr01G000105 Chr01 NC_080387.1:1843478-1843492promoter 内 54-68 bp + 3933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 1837296-1839545(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTACGGATAAGGAC
SmilChr04G002065 Chr04 NC_080390.1:33378152-33378166promoter 内 3400-3414 bp - 587 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 33375366-33377565(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATTTA
SmilChr02G004876 Chr02 NC_080388.1:70843351-70843365promoter 内 2821-2835 bp - 1166 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 70840325-70842185(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGCATTATCCAAATT
SmilChr02G004679 Chr02 NC_080388.1:69135733-69135747promoter 内 1389-1403 bp - 2598 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 69130958-69133135(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CAGCTTATCCATTTG
SmilChr02G001345 Chr02 NC_080388.1:25132238-25132252promoter 内 3960-3974 bp + 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 25132279-25135345(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGCCCTATCCATTAT
SmilChr02G001346 Chr02 NC_080388.1:25141162-25141176promoter 内 3956-3970 bp + 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 25141207-25144288(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGCCCTATCCATTAT
SmilChr01G005851 Chr01 NC_080387.1:74445569-74445583promoter 内 3808-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 74442519-74445390(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CATTTGGATAATGAA
SmilChr02G003172 Chr02 NC_080388.1:52824664-52824678promoter 内 3634-3648 bp + 353 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 52825031-52826664(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATTTA
SmilChr03G002627 Chr03 NC_080389.1:41681633-41681647promoter 内 3590-3604 bp - 397 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 41679789-41681236(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGGCTTATCCAAACA
SmilChr01G005050 Chr01 NC_080387.1:68447217-68447231promoter 内 3404-3418 bp + 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 68447814-68451121(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATTATCCAAAAC
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SmilChr04G003529 Chr04 NC_080390.1:51656606-51656620promoter 内 3238-3252 bp + 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 51653252-51655857(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTAAGGATAAGGAA
SmilChr04G000895 Chr04 NC_080390.1:11510943-11510957promoter 内 3026-3040 bp + 961 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 11509075-11509982(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAATGGATAAAGAT
SmilChr01G000428 Chr01 NC_080387.1:8581353-8581367promoter 内 3000-3014 bp - 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 8572479-8580366(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATTTA
SmilChr01G002004 Chr01 NC_080387.1:35545431-35545445promoter 内 2983-2997 bp - 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 35540745-35544427(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TACCTTATCTACACA
SmilChr02G003442 Chr02 NC_080388.1:55700632-55700646promoter 内 2948-2962 bp + 1039 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 55696078-55699593(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAGAGGATAAGGCA
SmilChr03G004168 Chr03 NC_080389.1:60440808-60440822promoter 内 2896-2910 bp + 1091 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 60438161-60439717(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAAATGGATAAAATT
SmilChr02G000161 Chr02 NC_080388.1:2111437-2111451promoter 内 2893-2907 bp + 1094 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 2107167-2110343(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTGGATAAGGGG
SmilChr01G002162 Chr01 NC_080387.1:37628461-37628475promoter 内 2795-2809 bp + 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 37629667-37631655(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCTTACA
SmilChr01G001275 Chr01 NC_080387.1:25487927-25487941promoter 内 2639-2653 bp + 1348 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 25486495-25486579(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAGTGGATAACATT
SmilChr03G004742 Chr03 NC_080389.1:64549638-64549652promoter 内 2532-2546 bp + 1455 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 64542658-64548183(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAAGAGGATAAGGCG
SmilChr02G001306 Chr02 NC_080388.1:24258179-24258193promoter 内 2378-2392 bp + 1609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 24254933-24256570(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTAGTGGATAAAATT
SmilChr01G004403 Chr01 NC_080387.1:62145638-62145652promoter 内 2010-2024 bp + 1977 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 62138438-62143661(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTTTGGATAAGTAT
SmilChr02G003912 Chr02 NC_080388.1:61215677-61215691promoter 内 1993-2007 bp - 1994 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 61206599-61213683(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCAAAAG
SmilChr03G004744 Chr03 NC_080389.1:64549638-64549652promoter 内 1968-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 64551671-64552520(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CGCCTTATCCTCTTC
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SmilChr04G000894 Chr04 NC_080390.1:11510943-11510957promoter 内 1866-1880 bp + 2121 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 11506315-11508822(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAATGGATAAAGAT
SmilChr04G003906 Chr04 NC_080390.1:54821023-54821037promoter 内 1824-1838 bp + 2163 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 54815526-54818860(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAATGCC
SmilChr03G002644 Chr03 NC_080389.1:42065480-42065494promoter 内 1651-1665 bp + 2336 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 42061571-42063144(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CAATTGGATAAGAAC
SmilChr03G004125 Chr03 NC_080389.1:60092390-60092404promoter 内 1643-1657 bp + 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 60094748-60095865(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGCATTATCCACAAC
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SmilChr04G002588 Chr04 NC_080390.1:41292193-41292207promoter 内 268-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 41295926-41299896(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATTATCCAAATC