转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 38 / 143 下载 TSV

上一页 38 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002936 Chr02 NC_080388.1:49881098-49881109promoter 内 2139-2150 bp + 1851 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 49871369-49879247(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAAC
SmilChr06G000736 Chr06 NC_080392.1:6783614-6783625promoter 内 2089-2100 bp + 1901 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 6785526-6792764(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTA
SmilChr07G001859 Chr07 NC_080393.1:16118090-16118101promoter 内 1637-1648 bp - 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 16112381-16115737(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGGA
SmilChr03G001658 Chr03 NC_080389.1:21536327-21536338promoter 内 1578-1589 bp + 2412 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 21533286-21533915(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGC
SmilChr08G001240 Chr08 NC_080394.1:9910138-9910149promoter 内 1491-1502 bp - 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 9912648-9912719(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAT
SmilChr07G003103 Chr07 NC_080393.1:32866886-32866897promoter 内 1271-1282 bp - 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 32861194-32864167(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGGA
SmilChr05G001897 Chr05 NC_080391.1:19267035-19267046promoter 内 1238-1249 bp + 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 19269798-19271538(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGGA
SmilChr03G001281 Chr03 NC_080389.1:14991903-14991914promoter 内 1228-1239 bp - 2762 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 14986288-14989141(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGA
SmilChr06G000243 Chr06 NC_080392.1:1627200-1627211promoter 内 1213-1224 bp + 2777 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 1620473-1624423(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCAC
SmilChr02G005335 Chr02 NC_080388.1:74196184-74196195promoter 内 1197-1208 bp + 2793 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 74191286-74193391(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAAT
SmilChr08G001227 Chr08 NC_080394.1:9910138-9910149promoter 内 1175-1186 bp - 2815 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 9900463-9907323(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTA
SmilChr06G000734 Chr06 NC_080392.1:6783614-6783625promoter 内 1171-1182 bp + 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 6779082-6780795(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAT
SmilChr08G001241 Chr08 NC_080394.1:9910138-9910149promoter 内 1024-1035 bp - 2966 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 9913115-9913186(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAT
SmilChr02G001646 Chr02 NC_080388.1:30544577-30544588promoter 内 817-828 bp - 3173 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 30531452-30541404(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGGA
SmilChr08G001242 Chr08 NC_080394.1:9910138-9910149promoter 内 647-658 bp - 3343 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 9913492-9913563(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAT
SmilChr08G003634 Chr08 NC_080394.1:39660024-39660035promoter 内 534-545 bp + 3456 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 39663491-39663597(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGGA
SmilChr01G004163 Chr01 NC_080387.1:60123422-60123433promoter 内 367-378 bp - 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 60127056-60131519(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCAT
SmilChr01G003732 Chr01 NC_080387.1:55613904-55613915promoter 内 260-271 bp + 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 55607009-55610174(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAAT
SmilChr07G003104 Chr07 NC_080393.1:32866886-32866897promoter 内 257-268 bp - 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 32870630-32872973(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTG
SmilChr07G001304 Chr07 NC_080393.1:10028192-10028203promoter 内 91-102 bp + 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 10019030-10024293(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCAC
SmilChr01G004260 Chr01 NC_080387.1:60859395-60859406promoter 内 3913-3924 bp - 77 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 60859483-60860828(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAAC
SmilChr07G002932 Chr07 NC_080393.1:29672721-29672732promoter 内 3910-3921 bp - 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 29672812-29673326(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGC
SmilChr07G002933 Chr07 NC_080393.1:29683576-29683587promoter 内 3910-3921 bp - 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 29683667-29684181(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGC
SmilChr08G001924 Chr08 NC_080394.1:16780385-16780396promoter 内 3758-3769 bp - 232 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 16778096-16780153(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATA
SmilChr02G003846 Chr02 NC_080388.1:60215839-60215850promoter 内 3620-3631 bp + 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 60211654-60215469(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCAG
SmilChr07G004278 Chr07 NC_080393.1:55320560-55320571promoter 内 3599-3610 bp - 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 55314244-55320169(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAGA
SmilChr01G005006 Chr01 NC_080387.1:68113266-68113277promoter 内 3459-3470 bp - 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 68107762-68112735(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAC
SmilChr01G006065 Chr01 NC_080387.1:76066461-76066472promoter 内 3421-3432 bp - 569 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 76067041-76075726(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCAG
SmilChr01G002846 Chr01 NC_080387.1:47036288-47036299promoter 内 3340-3351 bp + 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 47030507-47035638(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCAT
SmilChr05G000483 Chr05 NC_080391.1:3774622-3774633promoter 内 3288-3299 bp + 702 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 3775335-3777887(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTACAGCTGTG
SmilChr08G002801 Chr08 NC_080394.1:27767857-27767868promoter 内 3266-3277 bp + 724 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 27766093-27767133(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAT
SmilChr01G002948 Chr01 NC_080387.1:48359466-48359477promoter 内 3250-3261 bp - 740 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 48349556-48358726(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATA
SmilChr07G001277 Chr07 NC_080393.1:9818589-9818600promoter 内 3147-3158 bp - 843 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 9814983-9817746(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATA
SmilChr06G000238 Chr06 NC_080392.1:1599406-1599417promoter 内 3047-3058 bp + 943 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 1595862-1598463(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCAC
SmilChr07G004258 Chr07 NC_080393.1:55010147-55010158promoter 内 2963-2974 bp + 1027 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 55011185-55016474(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATA
SmilChr02G003728 Chr02 NC_080388.1:58915380-58915391promoter 内 2937-2948 bp + 1053 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 58906516-58914327(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCAC
SmilChr01G004540 Chr01 NC_080387.1:63545465-63545476promoter 内 2929-2940 bp + 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 63546537-63551510(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATG
SmilChr08G002460 Chr08 NC_080394.1:23428985-23428996promoter 内 2905-2916 bp + 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 23424681-23427900(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAT
SmilChr08G000659 Chr08 NC_080394.1:4894684-4894695promoter 内 2894-2905 bp + 1096 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 4892942-4893588(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAT
SmilChr06G000022 Chr06 NC_080392.1:265861-265872promoter 内 2608-2619 bp + 1382 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 262934-264479(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGC
SmilChr03G003364 Chr03 NC_080389.1:51987351-51987362promoter 内 2598-2609 bp + 1392 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 51988754-51991630(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAGA
SmilChr04G003612 Chr04 NC_080390.1:52617021-52617032promoter 内 2273-2284 bp - 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 52606022-52615304(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCAC
SmilChr07G002525 Chr07 NC_080393.1:23926715-23926726promoter 内 2185-2196 bp + 1805 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 23928531-23929852(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCTA
SmilChr07G002550 Chr07 NC_080393.1:24199472-24199483promoter 内 2141-2152 bp - 1849 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 24196424-24197623(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCTA
SmilChr01G002949 Chr01 NC_080387.1:48359466-48359477promoter 内 2128-2139 bp - 1862 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 48361339-48364998(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCAT
SmilChr02G005482 Chr02 NC_080388.1:75033613-75033624promoter 内 2073-2084 bp - 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 75029459-75031696(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATA
SmilChr08G000390 Chr08 NC_080394.1:2737203-2737214promoter 内 2043-2054 bp + 1947 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 2731599-2735256(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCAT
SmilChr04G000712 Chr04 NC_080390.1:8315652-8315663promoter 内 1992-2003 bp - 1998 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 8308949-8313654(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCTA
SmilChr08G003224 Chr08 NC_080394.1:33107078-33107089promoter 内 1967-1978 bp + 2023 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 33109112-33110901(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTATG
SmilChr01G001046 Chr01 NC_080387.1:21732441-21732452promoter 内 1909-1920 bp - 2081 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 1 21720347-21730360(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCGA