转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 41 / 139 下载 TSV

上一页 41 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003604 Chr02 NC_080388.1:57297868-57297879promoter 内 1999-2010 bp + 1991 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 57284584-57295877(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCA
SmilChr02G003691 Chr02 NC_080388.1:58330583-58330594promoter 内 1980-1991 bp - 2010 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 58325837-58328573(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGTGACGTGTG
SmilChr01G004617 Chr01 NC_080387.1:64157872-64157883promoter 内 1908-1919 bp + 2082 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 64159965-64160930(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGCGACGTGGC
SmilChr04G000736 Chr04 NC_080390.1:8827100-8827111promoter 内 1535-1546 bp - 2455 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 8821774-8824645(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr02G004665 Chr02 NC_080388.1:69031394-69031405promoter 内 1489-1500 bp + 2501 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 69033906-69034451(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAGCGACGTGGC
SmilChr02G001358 Chr02 NC_080388.1:25405972-25405983promoter 内 1487-1498 bp - 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 25400788-25403469(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr04G001804 Chr04 NC_080390.1:29524325-29524336promoter 内 1445-1456 bp - 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 29526881-29529868(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCACCC
SmilChr03G000074 Chr03 NC_080389.1:911861-911872promoter 内 1231-1242 bp + 2759 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 914631-920110(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr02G003945 Chr02 NC_080388.1:61597767-61597778promoter 内 1093-1104 bp - 2897 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 61591200-61594870(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr01G003984 Chr01 NC_080387.1:58286560-58286571promoter 内 3912-3923 bp - 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 58283943-58286482(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr03G001248 Chr03 NC_080389.1:14377862-14377873promoter 内 3912-3923 bp - 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 14377951-14385049(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACA
SmilChr01G004526 Chr01 NC_080387.1:63451845-63451856promoter 内 3909-3920 bp - 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 63451937-63461276(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCA
SmilChr04G000869 Chr04 NC_080390.1:11193872-11193883promoter 内 3806-3817 bp + 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10980515-11193688(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCA
SmilChr04G002706 Chr04 NC_080390.1:42665694-42665705promoter 内 3771-3782 bp + 219 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 42665924-42668713(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCACGACGTGGC
SmilChr03G002126 Chr03 NC_080389.1:33115508-33115519promoter 内 3764-3775 bp + 226 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 33115745-33116689(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCGCGACGTGGG
SmilChr02G002004 Chr02 NC_080388.1:36187229-36187240promoter 内 3699-3710 bp - 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 36187531-36187691(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGCTC
SmilChr03G003303 Chr03 NC_080389.1:51219159-51219170promoter 内 3672-3683 bp + 318 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 51217388-51218841(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCACGTCAGCT
SmilChr04G002218 Chr04 NC_080390.1:35863834-35863845promoter 内 3433-3444 bp + 557 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 35864402-35865376(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr04G001527 Chr04 NC_080390.1:25198343-25198354promoter 内 3376-3387 bp - 614 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 25196647-25197729(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCTCGACGTGGC
SmilChr04G003807 Chr04 NC_080390.1:54248839-54248850promoter 内 3332-3343 bp + 658 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 54243606-54248181(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGCGA
SmilChr03G000446 Chr03 NC_080389.1:4790180-4790191promoter 内 3165-3176 bp + 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 4785436-4789355(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCA
SmilChr02G003972 Chr02 NC_080388.1:61898535-61898546promoter 内 3074-3085 bp - 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 61899462-61904948(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCA
SmilChr01G003985 Chr01 NC_080387.1:58286560-58286571promoter 内 2980-2991 bp - 1010 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 58287581-58288554(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCA
SmilChr04G003332 Chr04 NC_080390.1:50026063-50026074promoter 内 2914-2925 bp + 1076 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 50023489-50024987(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCA
SmilChr02G003506 Chr02 NC_080388.1:56247259-56247270promoter 内 2853-2864 bp + 1137 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 56244107-56246122(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCA
SmilChr01G000320 Chr01 NC_080387.1:6291845-6291856promoter 内 2820-2831 bp + 1170 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6293026-6293592(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGGA
SmilChr01G000321 Chr01 NC_080387.1:6296929-6296940promoter 内 2820-2831 bp + 1170 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6298110-6298676(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGGA
SmilChr02G003558 Chr02 NC_080388.1:56750140-56750151promoter 内 2812-2823 bp + 1178 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 56746991-56748962(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCATCA
SmilChr03G000889 Chr03 NC_080389.1:10164034-10164045promoter 内 2811-2822 bp + 1179 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10157737-10162855(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCA
SmilChr01G005509 Chr01 NC_080387.1:71947223-71947234promoter 内 2789-2800 bp + 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 71948435-71949956(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGGA
SmilChr01G000129 Chr01 NC_080387.1:2192344-2192355promoter 内 2743-2754 bp - 1247 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2188602-2191097(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGGA
SmilChr03G002701 Chr03 NC_080389.1:42971937-42971948promoter 内 2718-2729 bp + 1272 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 42973220-42973996(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGGA
SmilChr03G000890 Chr03 NC_080389.1:10164034-10164045promoter 内 2686-2697 bp + 1304 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10165349-10166841(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr01G004367 Chr01 NC_080387.1:61854400-61854411promoter 内 2639-2650 bp + 1351 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 61851179-61853049(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCACGTCAGCT
SmilChr01G004591 Chr01 NC_080387.1:63919580-63919591promoter 内 2518-2529 bp - 1472 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 63914506-63918108(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr04G003359 Chr04 NC_080390.1:50188941-50188952promoter 内 2498-2509 bp - 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 50190444-50193928(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACA
SmilChr01G001077 Chr01 NC_080387.1:22194121-22194132promoter 内 2283-2294 bp + 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 22195839-22202144(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGGA
SmilChr01G004592 Chr01 NC_080387.1:63919580-63919591promoter 内 2146-2157 bp - 1844 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 63921435-63922453(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCA
SmilChr01G000130 Chr01 NC_080387.1:2192344-2192355promoter 内 2137-2148 bp - 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2194208-2196236(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAACA
SmilChr02G001969 Chr02 NC_080388.1:35630510-35630521promoter 内 2003-2014 bp - 1987 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 35626482-35628523(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGGA
SmilChr01G002692 Chr01 NC_080387.1:45165358-45165369promoter 内 1992-2003 bp - 1998 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 45162758-45163360(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCTCGACGTGGC
SmilChr03G000812 Chr03 NC_080389.1:9295619-9295630promoter 内 1789-1800 bp - 2201 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 9297831-9300286(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAACA
SmilChr02G002438 Chr02 NC_080388.1:42582008-42582019promoter 内 1755-1766 bp + 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 42584254-42587485(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGTGACGTGTG
SmilChr01G003784 Chr01 NC_080387.1:56224178-56224189promoter 内 1258-1269 bp - 2732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 56219347-56221446(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr03G001089 Chr03 NC_080389.1:12589784-12589795promoter 内 1174-1185 bp - 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 12583704-12586968(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr01G004525 Chr01 NC_080387.1:63451845-63451856promoter 内 1108-1119 bp - 2882 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 63446682-63448963(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGT
SmilChr01G003983 Chr01 NC_080387.1:58286560-58286571promoter 内 917-928 bp - 3073 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 58281499-58283487(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr01G003412 Chr01 NC_080387.1:52776761-52776772promoter 内 909-920 bp + 3081 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 52779853-52783945(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGT
SmilChr02G001269 Chr02 NC_080388.1:23250490-23250501promoter 内 879-890 bp - 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 23246512-23247379(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr03G000447 Chr03 NC_080389.1:4796926-4796937promoter 内 808-819 bp + 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 4792703-4793744(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGTGC