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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001961; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001298-RA_Salv SmilChr05G001961 MIKC_MADS XP_057766054.1 MP00077 TTCCAAAAATGGAAA

可能结合的靶基因

9815 个结合位点 6125 个候选靶基因 第 43 / 123 下载 TSV

上一页 43 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001691 Chr02 NC_080388.1:31188842-31188856promoter 内 3783-3797 bp + 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 31185986-31188638(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCCATTTTTAGTA
SmilChr01G005711 Chr01 NC_080387.1:73331221-73331235promoter 内 3644-3658 bp - 343 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 73331578-73334536(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCCATTTTTAGTA
SmilChr02G004932 Chr02 NC_080388.1:71315563-71315577promoter 内 3632-3646 bp - 355 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 71313833-71315208(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GTCCAAAAATAGATA
SmilChr03G000141 Chr03 NC_080389.1:1546388-1546402promoter 内 3507-3521 bp - 480 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 1537730-1545908(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TACTAAAAATGGATA
SmilChr02G000120 Chr02 NC_080388.1:1604841-1604855promoter 内 3388-3402 bp + 599 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 1603431-1604242(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCTATTTTTGGAC
SmilChr01G003671 Chr01 NC_080387.1:55156149-55156163promoter 内 3216-3230 bp + 771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 55153174-55155378(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCCATTTTTAGTA
SmilChr02G004975 Chr02 NC_080388.1:71639139-71639153promoter 内 3177-3191 bp - 810 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 71632567-71638329(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TACTAAAAATGGATA
SmilChr02G001291 Chr02 NC_080388.1:23731365-23731379promoter 内 3054-3068 bp + 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 23726053-23730432(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCTATTTTTGGAC
SmilChr02G004573 Chr02 NC_080388.1:68233261-68233275promoter 内 2739-2753 bp + 1248 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 68234523-68238842(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CTCCAAAAAAAGATA
SmilChr02G005168 Chr02 NC_080388.1:73006234-73006248promoter 内 2710-2724 bp - 1277 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 73007525-73013228(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCCATTTTTAGTA
SmilChr02G003852 Chr02 NC_080388.1:60292431-60292445promoter 内 2280-2294 bp - 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 60290627-60290724(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TACTAAAAATGGATA
SmilChr01G002251 Chr01 NC_080387.1:39130333-39130347promoter 内 2216-2230 bp - 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 39132118-39133736(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCCATTTTTAGTA
SmilChr02G000380 Chr02 NC_080388.1:4774052-4774066promoter 内 2210-2224 bp + 1777 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4770260-4772275(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCCATTTTTAGTA
SmilChr01G001685 Chr01 NC_080387.1:31083583-31083597promoter 内 2092-2106 bp + 1895 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 31080667-31081688(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTGCCATTTTTGTTC
SmilChr01G001035 Chr01 NC_080387.1:21500776-21500790promoter 内 1878-1892 bp + 2109 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 21502899-21503822(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTCCAAATGGGGCCA
SmilChr03G000354 Chr03 NC_080389.1:3972864-3972878promoter 内 1378-1392 bp + 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3969357-3970255(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCCATTTTTAGTA
SmilChr01G002714 Chr01 NC_080387.1:45401253-45401267promoter 内 1182-1196 bp + 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45393416-45398448(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCCATTTTTAGTA
SmilChr01G001126 Chr01 NC_080387.1:22866443-22866457promoter 内 1132-1146 bp - 2855 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 22861750-22863588(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTCCAAAAGTGACAA
SmilChr01G000452 Chr01 NC_080387.1:9192227-9192241promoter 内 1131-1145 bp + 2856 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 9195097-9197295(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTCCAAAAGTGACAA
SmilChr01G000489 Chr01 NC_080387.1:9958733-9958747promoter 内 1126-1140 bp - 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 9953698-9955872(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTCCAAAAGTGACAA
SmilChr01G000655 Chr01 NC_080387.1:14569124-14569138promoter 内 1124-1138 bp + 2863 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 14572001-14574106(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTCCAAAAGTGACAA
SmilChr02G001616 Chr02 NC_080388.1:30103458-30103472promoter 内 1030-1044 bp + 2957 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 30099530-30100501(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 ATACCATTTTTGGAG
SmilChr01G000197 Chr01 NC_080387.1:3387533-3387547promoter 内 881-895 bp - 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 3383132-3384427(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTCCAAAAGTGACAA
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SmilChr02G005167 Chr02 NC_080388.1:73006234-73006248promoter 内 628-642 bp - 3359 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 72999379-73002875(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TACTAAAAATGGATA
SmilChr01G002262 Chr01 NC_080387.1:39437178-39437192promoter 内 410-424 bp + 3577 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 39429772-39433601(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTTTCACTTTTGGAT
SmilChr02G003626 Chr02 NC_080388.1:57589850-57589864promoter 内 209-223 bp + 3778 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 57593642-57595039(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 AACCTAAAATGGATA
SmilChr01G001903 Chr01 NC_080387.1:34134223-34134237promoter 内 85-99 bp - 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 34138139-34140145(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTACCATTTTCGGTG
SmilChr02G003643 Chr02 NC_080388.1:57773688-57773702promoter 内 3791-3805 bp - 196 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 57773898-57775283(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTGCTATTTTTGTAT
SmilChr01G005299 Chr01 NC_080387.1:70291218-70291232promoter 内 3709-3723 bp + 278 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 70289908-70290940(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTTCTAATTTTGGAC
SmilChr01G000553 Chr01 NC_080387.1:11511037-11511051promoter 内 2624-2638 bp + 1363 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 11505769-11509674(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTTCCATTTTCAGAT
SmilChr01G003700 Chr01 NC_080387.1:55385867-55385881promoter 内 1810-1824 bp - 2177 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 55374162-55383690(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTCCAAATCAGGCAA
SmilChr01G004865 Chr01 NC_080387.1:66776198-66776212promoter 内 1158-1172 bp - 2829 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 66779041-66790422(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTTTCTCTTTTGGAA
SmilChr01G003273 Chr01 NC_080387.1:51442969-51442983promoter 内 926-940 bp - 3061 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 51433922-51439908(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GACCCAAAATGGAAT
SmilChr01G005692 Chr01 NC_080387.1:73202044-73202058promoter 内 418-432 bp + 3569 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 73197240-73198475(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CATCCATTTTGGGAT
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SmilChr01G001793 Chr01 NC_080387.1:32788414-32788428promoter 内 3626-3640 bp - 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 32788789-32792051(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 GTACCTCTTTTGGAT
SmilChr02G001682 Chr02 NC_080388.1:31059803-31059817promoter 内 3582-3596 bp - 405 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 31060222-31061972(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TATCCATTTCTGGAT
SmilChr02G002501 Chr02 NC_080388.1:43462797-43462811promoter 内 3305-3319 bp + 682 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 43460472-43462115(-) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TTTCCATATTTAGCT
SmilChr02G004937 Chr02 NC_080388.1:71337778-71337792promoter 内 3277-3291 bp + 710 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 71338502-71341737(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 TACTCTAAATGGAAA
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SmilChr01G000749 Chr01 NC_080387.1:16567514-16567528promoter 内 2435-2449 bp + 1552 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 16569080-16570541(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 ATCCAAAAGAGGTAC
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SmilChr02G002822 Chr02 NC_080388.1:48334223-48334237promoter 内 1699-1713 bp + 2288 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 48336525-48342033(+) SMil_00001298-RA_Salv MP00077 CACTAAAAATGGTAA