Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003805; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020790-RA_Salv SmilChr04G003805 MIKC_MADS XP_057805691.1 MP00315 TTTCCAAAAAAGGAAAAAA

可能结合的靶基因

9567 个结合位点 7291 个候选靶基因 第 44 / 146 下载 TSV

上一页 44 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G003184 Chr08 NC_080394.1:32568521-32568539promoter 内 3915-3933 bp + 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 32567777-32568453(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 AATTTTCCTATTTAGGCAA
SmilChr06G002968 Chr06 NC_080392.1:42509632-42509650promoter 内 3828-3846 bp + 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 42509805-42513346(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCTAAAAAGGAAACGG
SmilChr03G004686 Chr03 NC_080389.1:64259493-64259511promoter 内 3754-3772 bp + 229 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 64259740-64261677(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCTGAAAAAGAAAAAA
SmilChr08G003197 Chr08 NC_080394.1:32794543-32794561promoter 内 3741-3759 bp - 242 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 32792532-32794301(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATCCCAAAAATGGAAAAAA
SmilChr01G001835 Chr01 NC_080387.1:33288236-33288254promoter 内 2936-2954 bp - 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 33283408-33287189(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCCAAAAAGGGAATAA
SmilChr07G000297 Chr07 NC_080393.1:1961634-1961652promoter 内 1341-1359 bp - 2642 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 1955468-1958992(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCTAAAAAGGAAACGG
SmilChr07G000298 Chr07 NC_080393.1:1961634-1961652promoter 内 1104-1122 bp - 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 1964531-1966297(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CCGTTTCCTTTTTAGGAAA
SmilChr08G000361 Chr08 NC_080394.1:2494860-2494878promoter 内 442-460 bp - 3541 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 2498419-2504484(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTTTTCCAATTAGGGCAA
SmilChr08G000363 Chr08 NC_080394.1:2505061-2505079promoter 内 170-188 bp - 3813 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 2508892-2510434(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTTTTCCAATTAGGGCAA
SmilChr01G005799 Chr01 NC_080387.1:74065016-74065034promoter 内 3934-3952 bp + 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 74065083-74068284(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCTTAAAAAGAAAAAA
SmilChr01G002438 Chr01 NC_080387.1:41967428-41967446promoter 内 3865-3883 bp - 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 41963510-41967310(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCAAAACCGGAAAAGA
SmilChr05G002524 Chr05 NC_080391.1:28085339-28085357promoter 内 3805-3823 bp - 178 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 28085535-28090191(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTCATTCCATTTTTGGTAA
SmilChr01G001944 Chr01 NC_080387.1:34629368-34629386promoter 内 3764-3782 bp + 219 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 34622560-34629149(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTTTTCCTATTTTAGAAA
SmilChr05G003836 Chr05 NC_080391.1:51811674-51811692promoter 内 3764-3782 bp + 219 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 51811911-51812653(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCAAAAACAGAAATAT
SmilChr06G000151 Chr06 NC_080392.1:1059377-1059395promoter 内 3748-3766 bp - 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 1053337-1059142(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACTCAAAAAGGAAAGAG
SmilChr02G000256 Chr02 NC_080388.1:3289783-3289801promoter 内 3746-3764 bp - 237 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 3290038-3292845(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CCGTTTCCTTTTTAGGAAA
SmilChr07G002671 Chr07 NC_080393.1:25991339-25991357promoter 内 3692-3710 bp + 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 25989038-25991048(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTCTTTCCTTTTTGAGTAA
SmilChr08G003185 Chr08 NC_080394.1:32568521-32568539promoter 内 3652-3670 bp + 331 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 32568870-32568941(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCTAAATAGGAAAATT
SmilChr03G002735 Chr03 NC_080389.1:43485705-43485723promoter 内 3520-3538 bp - 463 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 43486186-43490448(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTTTTCCATTTTGAGAAT
SmilChr03G002751 Chr03 NC_080389.1:43736666-43736684promoter 内 3449-3467 bp - 534 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 43737218-43741245(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTTTTCCATTTTGAGAAT
SmilChr01G002880 Chr01 NC_080387.1:47424362-47424380promoter 内 3365-3383 bp - 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 47423642-47423744(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACTCAAAAAGGAAAGAG
SmilChr02G000255 Chr02 NC_080388.1:3289783-3289801promoter 内 3028-3046 bp - 955 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 3285444-3288828(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCTAAAAAGGAAACGG
SmilChr05G000571 Chr05 NC_080391.1:4299045-4299063promoter 内 2912-2930 bp - 1071 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 4297118-4297974(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACTCAAAAAGGAAAGAG
SmilChr03G002536 Chr03 NC_080389.1:40426474-40426492promoter 内 2734-2752 bp - 1249 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 40427741-40428405(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 AACTTTCCTTTTTTGGTCA
SmilChr02G001948 Chr02 NC_080388.1:35118139-35118157promoter 内 2480-2498 bp - 1503 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 35119660-35126823(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTCTTTCCTTTTTGAGTAA
SmilChr04G000094 Chr04 NC_080390.1:853495-853513promoter 内 2456-2474 bp + 1527 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 855040-857530(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TGTCCAAAAAAGGAAAGTT
SmilChr01G000696 Chr01 NC_080387.1:15593385-15593403promoter 内 2174-2192 bp + 1809 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 15595212-15597503(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCTAAAAAGGAAACGG
SmilChr07G000167 Chr07 NC_080393.1:1015474-1015492promoter 内 2043-2061 bp + 1940 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 1017432-1025739(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TAACCCAAAAAGGAAAATG
SmilChr04G003465 Chr04 NC_080390.1:51134507-51134525promoter 内 1588-1606 bp - 2395 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 51136920-51144915(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 AACTTTCCTTTTTTGGTCA
SmilChr01G003942 Chr01 NC_080387.1:57758271-57758289promoter 内 1570-1588 bp + 2413 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 57754694-57755858(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTCTTTCCTTTTTGAGTAA
SmilChr01G002454 Chr01 NC_080387.1:42144892-42144910promoter 内 1385-1403 bp + 2598 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 42141328-42142294(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTCTTTCCTTTTTGAGTAA
SmilChr04G000966 Chr04 NC_080390.1:12958378-12958396promoter 内 1130-1148 bp + 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 12961249-12964204(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TAACCCAAAAAGGAAAGTG
SmilChr04G002329 Chr04 NC_080390.1:37596579-37596597promoter 内 949-967 bp + 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 37599631-37604073(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATACCAAAAATGGAATAAA
SmilChr08G004473 Chr08 NC_080394.1:54366574-54366592promoter 内 937-955 bp + 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 54361769-54363528(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTCGTTCCTTTTTTGGTAA
SmilChr07G002670 Chr07 NC_080393.1:25991339-25991357promoter 内 890-908 bp + 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 25986201-25988246(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTCTTTCCTTTTTGAGTAA
SmilChr02G004400 Chr02 NC_080388.1:66347663-66347681promoter 内 704-722 bp - 3279 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 66341746-66344384(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCAAAAAAAGAAATGA
SmilChr03G003456 Chr03 NC_080389.1:52933172-52933190promoter 内 405-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 52936768-52944705(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTGCCAAAAAAGGAAAATA
SmilChr01G002257 Chr01 NC_080387.1:39334555-39334573promoter 内 360-378 bp - 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 39327723-39330932(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TAACCCAAAAAGGAAAGTG
SmilChr07G004557 Chr07 NC_080393.1:58307704-58307722promoter 内 200-218 bp + 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 58300178-58303921(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TAGTTTCCTTTTCTGGAAT
SmilChr01G002137 Chr01 NC_080387.1:37355250-37355268promoter 内 186-204 bp + 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 37346822-37351453(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 AATTTTCCATTTTTGGATT
SmilChr02G001813 Chr02 NC_080388.1:32968845-32968863promoter 内 1871-1889 bp - 2112 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 32970975-32982329(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ACCTTACTATTTTTGGAAA
SmilChr07G002903 Chr07 NC_080393.1:29416660-29416678promoter 内 3656-3674 bp - 327 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 29417005-29422041(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCTATTTTTGGTAA
SmilChr01G003578 Chr01 NC_080387.1:54364085-54364103promoter 内 2313-2331 bp - 1670 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 54365773-54368215(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCTATTTTTGGTAA
SmilChr01G003577 Chr01 NC_080387.1:54364085-54364103promoter 内 1385-1403 bp - 2598 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 54360728-54361487(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAATAGAAATGA
SmilChr08G004119 Chr08 NC_080394.1:50045527-50045545promoter 内 304-322 bp - 3679 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 50037269-50041848(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAATAGAAATGA
SmilChr02G001131 Chr02 NC_080388.1:20456716-20456734promoter 内 3851-3869 bp - 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 20456866-20457752(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CCATTTCCTTTTTGGGAAA
SmilChr07G001399 Chr07 NC_080393.1:10869439-10869457promoter 内 3836-3854 bp + 147 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 10869604-10872537(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAATAGAAATGA
SmilChr05G003909 Chr05 NC_080391.1:52815709-52815727promoter 内 3784-3802 bp - 199 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 52815926-52820891(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCTATTTTTGGTAA
SmilChr07G003893 Chr07 NC_080393.1:48785779-48785797promoter 内 3591-3609 bp - 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 48783201-48785387(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCTAAAAAAGGAAACGT
SmilChr01G005691 Chr01 NC_080387.1:73187872-73187890promoter 内 3420-3438 bp + 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 73186048-73187309(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCTATTTTTGGTAA