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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001269; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019281-RA_Salv SmilChr05G001269 G2-like XP_057765199.1 MP00252 AAAAGAATATTCC

可能结合的靶基因

9780 个结合位点 6478 个候选靶基因 第 44 / 130 下载 TSV

上一页 44 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001176 Chr03 NC_080389.1:13518709-13518721promoter 内 713-725 bp + 3276 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 13521997-13523176(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGAGAATATTTT
SmilChr01G003611 Chr01 NC_080387.1:54656577-54656589promoter 内 311-323 bp - 3678 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 54660267-54661448(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGATATTCTAAT
SmilChr02G004404 Chr02 NC_080388.1:66379466-66379478promoter 内 287-299 bp + 3702 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 66373233-66375764(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCCTGT
SmilChr02G003784 Chr02 NC_080388.1:59513412-59513424promoter 内 3894-3906 bp + 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 59511130-59513317(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTTAG
SmilChr02G005213 Chr02 NC_080388.1:73339318-73339330promoter 内 3892-3904 bp - 97 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 73339427-73341167(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTAAT
SmilChr02G003813 Chr02 NC_080388.1:59756042-59756054promoter 内 3882-3894 bp + 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 59753881-59755935(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTTAG
SmilChr01G000009 Chr01 NC_080387.1:194626-194638promoter 内 3867-3879 bp - 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 194760-197696(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTATC
SmilChr02G002664 Chr02 NC_080388.1:46137344-46137356promoter 内 3867-3879 bp + 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 46134287-46137222(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTATC
SmilChr02G005568 Chr02 NC_080388.1:75583072-75583084promoter 内 3853-3865 bp - 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 75583220-75584946(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTCTT
SmilChr02G003429 Chr02 NC_080388.1:55511361-55511373promoter 内 3806-3818 bp + 183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 55511556-55513279(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTCGAATATTCA
SmilChr01G003338 Chr01 NC_080387.1:52122006-52122018promoter 内 3787-3799 bp - 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 52122220-52124536(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGATATTCTAAG
SmilChr03G000290 Chr03 NC_080389.1:3304055-3304067promoter 内 3734-3746 bp - 255 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3300698-3303800(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATCGAATATTCA
SmilChr01G005431 Chr01 NC_080387.1:71469617-71469629promoter 内 3659-3671 bp - 330 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 71469959-71473519(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTAAT
SmilChr03G000293 Chr03 NC_080389.1:3359461-3359473promoter 内 3584-3596 bp - 405 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3357796-3359056(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATCGAATATTCA
SmilChr03G001352 Chr03 NC_080389.1:15779850-15779862promoter 内 3552-3564 bp + 437 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 15780299-15782533(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATCGAATATTCA
SmilChr02G001308 Chr02 NC_080388.1:24322433-24322445promoter 内 3513-3525 bp + 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 24321407-24321957(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCCCGT
SmilChr01G002819 Chr01 NC_080387.1:46756467-46756479promoter 内 3477-3489 bp + 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 46755197-46755955(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAATATTCTGTT
SmilChr02G002845 Chr02 NC_080388.1:48593811-48593823promoter 内 3473-3485 bp + 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 48594339-48599625(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAGGAATATTTG
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SmilChr03G000226 Chr03 NC_080389.1:2681923-2681935promoter 内 3457-3469 bp + 532 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 2682467-2685145(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATCGAATATTCA
SmilChr03G000299 Chr03 NC_080389.1:3412549-3412561promoter 内 3453-3465 bp - 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3410844-3412013(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATCGAATATTCA
SmilChr01G005430 Chr01 NC_080387.1:71469617-71469629promoter 内 3380-3392 bp - 609 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 71464347-71469008(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATTAGAATATACT
SmilChr02G005057 Chr02 NC_080388.1:72277098-72277110promoter 内 3287-3299 bp + 702 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 72277812-72279187(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTCGAATATTCA
SmilChr02G000485 Chr02 NC_080388.1:6617581-6617593promoter 内 3230-3242 bp - 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 6613893-6616822(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAAGAATATTCA
SmilChr02G005603 Chr02 NC_080388.1:75735445-75735457promoter 内 3093-3105 bp + 896 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 75736353-75739430(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATAGAATATTCA
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SmilChr02G002738 Chr02 NC_080388.1:47316053-47316065promoter 内 2887-2899 bp + 1102 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 47313509-47314951(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTCTT
SmilChr02G005109 Chr02 NC_080388.1:72600323-72600335promoter 内 2507-2519 bp - 1482 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 72597857-72598841(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGAGAATATTTT
SmilChr01G003507 Chr01 NC_080387.1:53646112-53646124promoter 内 2498-2510 bp - 1491 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 53647615-53653795(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGATATTCTAAT
SmilChr01G005306 Chr01 NC_080387.1:70323253-70323265promoter 内 2471-2483 bp - 1518 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 70324783-70325698(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTCTT
SmilChr02G003970 Chr02 NC_080388.1:61878572-61878584promoter 内 2404-2416 bp + 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 61876547-61876987(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGTATATTCTTGA
SmilChr02G005204 Chr02 NC_080388.1:73295044-73295056promoter 内 2395-2407 bp - 1594 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 73290936-73293450(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATTAGAATATACT
SmilChr03G001156 Chr03 NC_080389.1:13346976-13346988promoter 内 2316-2328 bp - 1673 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 13343876-13345303(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATCGAATATTCA
SmilChr01G001148 Chr01 NC_080387.1:23441285-23441297promoter 内 2184-2196 bp + 1805 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 23443102-23449748(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGTAGAATATACG
SmilChr03G000298 Chr03 NC_080389.1:3412549-3412561promoter 内 2174-2186 bp - 1815 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3409304-3410734(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GATCGAATATTCA
SmilChr01G003023 Chr01 NC_080387.1:49283083-49283095promoter 内 2120-2132 bp - 1869 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 49276093-49281214(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CGACGAATATTCA
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SmilChr01G002261 Chr01 NC_080387.1:39423937-39423949promoter 内 1713-1725 bp + 2276 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 39417632-39421661(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTAAT
SmilChr02G001312 Chr02 NC_080388.1:24350205-24350217promoter 内 1450-1462 bp - 2539 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 24346163-24347666(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATTAGAATATACT
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SmilChr03G000444 Chr03 NC_080389.1:4767145-4767157promoter 内 878-890 bp - 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 4760496-4764034(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGAGAATATTTT
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SmilChr01G003849 Chr01 NC_080387.1:56790270-56790282promoter 内 869-881 bp + 3120 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56793402-56795438(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAGAGAATATTTT