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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 45 / 163 下载 TSV

上一页 45 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001168 Chr02 NC_080388.1:21447872-21447884promoter 内 1268-1280 bp + 2721 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 21441617-21445151(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACACA
SmilChr07G003404 Chr07 NC_080393.1:36961061-36961073promoter 内 1194-1206 bp + 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 36954811-36958266(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACTTG
SmilChr03G000842 Chr03 NC_080389.1:9609759-9609771promoter 内 1091-1103 bp - 2898 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 9612669-9613799(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACATC
SmilChr07G002852 Chr07 NC_080393.1:28679925-28679937promoter 内 1088-1100 bp - 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 28673727-28677024(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAGTTGACTTTG
SmilChr08G002218 Chr08 NC_080394.1:20183989-20184001promoter 内 1080-1092 bp + 2909 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 20176867-20181080(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAAGTCAACGTA
SmilChr07G001950 Chr07 NC_080393.1:16975410-16975422promoter 内 1068-1080 bp - 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 16978343-16979840(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAGGTCAACGCA
SmilChr06G002689 Chr06 NC_080392.1:38819289-38819301promoter 内 990-1002 bp - 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 38814854-38816290(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAGGTTGACTTTT
SmilChr03G004294 Chr03 NC_080389.1:61344098-61344110promoter 内 986-998 bp - 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 61347113-61350884(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACAGTCAACGAT
SmilChr03G003476 Chr03 NC_080389.1:53309559-53309571promoter 内 930-942 bp - 3059 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 53300558-53306500(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGCGTTGACCTCC
SmilChr08G000199 Chr08 NC_080394.1:1339154-1339166promoter 内 927-939 bp + 3062 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 1332625-1336092(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACTTG
SmilChr03G001906 Chr03 NC_080389.1:26650817-26650829promoter 内 895-907 bp - 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 26653923-26662440(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGTAGTCAACGGG
SmilChr05G000160 Chr05 NC_080391.1:1316855-1316867promoter 内 856-868 bp - 3133 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 1277552-1313722(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACGTTGACCTGG
SmilChr06G000931 Chr06 NC_080392.1:8835653-8835665promoter 内 841-853 bp - 3148 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 8830083-8832505(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGTGTTGACTTTA
SmilChr01G001091 Chr01 NC_080387.1:22360234-22360246promoter 内 814-826 bp - 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 22363421-22371155(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACTGT
SmilChr01G001016 Chr01 NC_080387.1:21333099-21333111promoter 内 746-758 bp + 3243 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 21322126-21329856(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACTGT
SmilChr07G000441 Chr07 NC_080393.1:3089486-3089498promoter 内 739-751 bp + 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 3083628-3086236(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAAAGTCAACACC
SmilChr02G005195 Chr02 NC_080388.1:73208557-73208569promoter 内 696-708 bp + 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 73211862-73215804(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACGTTGACCTGG
SmilChr02G000158 Chr02 NC_080388.1:2037599-2037611promoter 内 658-670 bp - 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2040942-2043017(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CATGGTCAACGGA
SmilChr07G001576 Chr07 NC_080393.1:13000096-13000108promoter 内 656-668 bp + 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 12991271-12996763(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGTAGTCAACGGG
SmilChr08G001041 Chr08 NC_080394.1:7932462-7932474promoter 内 557-569 bp + 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 7935906-7940189(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TACGTTGACTTCA
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SmilChr03G004535 Chr03 NC_080389.1:63391467-63391479promoter 内 417-429 bp - 3572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 63378561-63387895(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACGTTGACTGTT
SmilChr08G001002 Chr08 NC_080394.1:7535516-7535528promoter 内 256-268 bp + 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 7539261-7543538(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TACGTTGACTTCA
SmilChr07G004330 Chr07 NC_080393.1:55858510-55858522promoter 内 146-158 bp - 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 55862365-55863222(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACTAGTCAACGGA
SmilChr05G000411 Chr05 NC_080391.1:3117506-3117518promoter 内 2431-2443 bp + 1558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 3119076-3121405(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACTCCG
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SmilChr04G000549 Chr04 NC_080390.1:6135205-6135217promoter 内 3762-3774 bp - 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 6135444-6138217(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACTTA
SmilChr07G003399 Chr07 NC_080393.1:36889270-36889282promoter 内 3383-3395 bp + 606 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 36889888-36894654(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACTCCG
SmilChr04G003377 Chr04 NC_080390.1:50330294-50330306promoter 内 3033-3045 bp - 956 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 50327168-50329338(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAGTTGACTTAT
SmilChr05G001070 Chr05 NC_080391.1:8828057-8828069promoter 内 2812-2824 bp + 1177 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 8829246-8829569(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTAGTTGACTTTG
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SmilChr02G004204 Chr02 NC_080388.1:64313229-64313241promoter 内 2429-2441 bp - 1560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 64311523-64311669(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTCGTTGACTTGA
SmilChr05G000990 Chr05 NC_080391.1:8046565-8046577promoter 内 2339-2351 bp - 1650 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 8042929-8044915(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAAGTTGACTTTG
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SmilChr06G002309 Chr06 NC_080392.1:33364797-33364809promoter 内 2263-2275 bp - 1726 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 33366535-33374544(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACTTA
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SmilChr08G000155 Chr08 NC_080394.1:1027019-1027031promoter 内 2164-2176 bp - 1825 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 1028856-1031092(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAATGCC
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SmilChr02G004201 Chr02 NC_080388.1:64313229-64313241promoter 内 1724-1736 bp - 2265 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 64310854-64310964(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTCGTTGACTTGA
SmilChr01G000797 Chr01 NC_080387.1:17239576-17239588promoter 内 1445-1457 bp - 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 17235549-17237032(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTACC
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SmilChr02G001735 Chr02 NC_080388.1:31893601-31893613promoter 内 554-566 bp + 3435 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 31887148-31890166(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAATGCC
SmilChr06G000177 Chr06 NC_080392.1:1237472-1237484promoter 内 374-386 bp + 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 1241099-1243151(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACCTAT