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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 45 / 139 下载 TSV

上一页 45 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002675 Chr01 NC_080387.1:44964218-44964229promoter 内 1246-1257 bp - 2744 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 44960668-44961474(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTGACGTCGC
SmilChr01G000276 Chr01 NC_080387.1:5463067-5463078promoter 内 128-139 bp - 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 5466940-5467395(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGATGA
SmilChr03G000730 Chr03 NC_080389.1:8215364-8215375promoter 内 3680-3691 bp + 310 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 8212387-8215054(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCAGCT
SmilChr02G000543 Chr02 NC_080388.1:7496613-7496624promoter 内 3609-3620 bp + 381 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 7493156-7496232(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGTC
SmilChr01G003075 Chr01 NC_080387.1:49591863-49591874promoter 内 3605-3616 bp + 385 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 49592259-49597744(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
SmilChr04G001757 Chr04 NC_080390.1:28895412-28895423promoter 内 3319-3330 bp + 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 28893823-28894741(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGAG
SmilChr03G000584 Chr03 NC_080389.1:6506126-6506137promoter 内 3269-3280 bp - 721 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 6504695-6505405(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGAG
SmilChr01G001726 Chr01 NC_080387.1:31797997-31798008promoter 内 3030-3041 bp - 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 31794900-31797037(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTCACGTGGC
SmilChr01G000246 Chr01 NC_080387.1:4585212-4585223promoter 内 2900-2911 bp + 1090 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 4586313-4590263(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTCGC
SmilChr03G001488 Chr03 NC_080389.1:17951298-17951309promoter 内 2855-2866 bp + 1135 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 17948018-17950163(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGGTG
SmilChr04G002300 Chr04 NC_080390.1:37246209-37246220promoter 内 2787-2798 bp + 1203 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 37247423-37251776(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACCGACGTGGT
SmilChr04G000287 Chr04 NC_080390.1:2661758-2661769promoter 内 2492-2503 bp + 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 2663267-2664339(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTGACGTCGC
SmilChr01G005137 Chr01 NC_080387.1:69158790-69158801promoter 内 1971-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 69160820-69162997(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTGACGTCGC
SmilChr01G005136 Chr01 NC_080387.1:69158790-69158801promoter 内 1761-1772 bp + 2229 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 69154295-69156561(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGGT
SmilChr02G004087 Chr02 NC_080388.1:63147016-63147027promoter 内 1684-1695 bp - 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 63149333-63150023(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCGG
SmilChr02G001981 Chr02 NC_080388.1:35753387-35753398promoter 内 1508-1519 bp - 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 35748952-35750905(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCATCACGTGGC
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SmilChr02G002463 Chr02 NC_080388.1:42973860-42973871promoter 内 800-811 bp - 3190 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 42965984-42970670(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGAGACGTGGG
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SmilChr03G001826 Chr03 NC_080389.1:25014591-25014602promoter 内 597-608 bp - 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 25017995-25018642(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCGG
SmilChr01G002113 Chr01 NC_080387.1:37169574-37169585promoter 内 485-496 bp + 3505 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 37165997-37166069(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCGG
SmilChr01G002112 Chr01 NC_080387.1:37169574-37169585promoter 内 387-398 bp + 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 37163586-37165971(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCGG
SmilChr02G000544 Chr02 NC_080388.1:7496613-7496624promoter 内 288-299 bp + 3702 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 7500326-7500844(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTCGC
SmilChr01G005791 Chr01 NC_080387.1:74007264-74007275promoter 内 267-278 bp - 3723 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 74010998-74014919(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCGG
SmilChr02G000136 Chr02 NC_080388.1:1856655-1856666promoter 内 206-217 bp + 3784 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 1851809-1852871(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCGG
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SmilChr01G003569 Chr01 NC_080387.1:54261287-54261298promoter 内 172-183 bp + 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 54255327-54257469(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCGG
SmilChr04G001434 Chr04 NC_080390.1:23400537-23400548promoter 内 18-29 bp + 3972 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 23386135-23396565(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCACGTCAGCC
SmilChr01G001402 Chr01 NC_080387.1:27591000-27591011promoter 内 3964-3975 bp + 26 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 27589426-27590974(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGAG
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SmilChr03G002368 Chr03 NC_080389.1:37316673-37316684promoter 内 3937-3948 bp - 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 37315730-37316620(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACCGACGTGGT
SmilChr01G000882 Chr01 NC_080387.1:18765844-18765855promoter 内 3862-3873 bp + 128 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 18762721-18765716(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGTG
SmilChr03G000882 Chr03 NC_080389.1:10016212-10016223promoter 内 3828-3839 bp - 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 10011657-10016050(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCTGACGTCGC
SmilChr01G003528 Chr01 NC_080387.1:53916268-53916279promoter 内 3824-3835 bp - 166 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 53913710-53916102(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCATCACGTGGC
SmilChr01G003472 Chr01 NC_080387.1:53257609-53257620promoter 内 3818-3829 bp - 172 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 53255097-53257437(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCATCACGTGGC
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SmilChr03G004124 Chr03 NC_080389.1:60092123-60092134promoter 内 3539-3550 bp + 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 60088942-60091672(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACGTCAGGT
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SmilChr03G004609 Chr03 NC_080389.1:63826106-63826117promoter 内 3424-3435 bp - 566 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63826683-63836556(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGGT
SmilChr02G003842 Chr02 NC_080388.1:60154501-60154512promoter 内 3393-3404 bp - 597 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 60149380-60153904(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACCGACGTGGA
SmilChr03G004610 Chr03 NC_080389.1:63832198-63832209promoter 内 3240-3251 bp - 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63829153-63831448(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCGACGTGGA
SmilChr03G004605 Chr03 NC_080389.1:63813014-63813025promoter 内 3234-3245 bp - 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63811265-63812258(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCGACGTGGA
SmilChr03G004603 Chr03 NC_080389.1:63806591-63806602promoter 内 3222-3233 bp - 768 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63807370-63815364(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGGT
SmilChr04G000303 Chr04 NC_080390.1:2796084-2796095promoter 内 3108-3119 bp + 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 2794178-2795202(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGGAC
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SmilChr03G004608 Chr03 NC_080389.1:63826106-63826117promoter 内 2918-2929 bp - 1072 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63824041-63825034(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCGACGTGGA