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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 46 / 149 下载 TSV

上一页 46 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004280 Chr02 NC_080388.1:64991685-64991699promoter 内 3619-3633 bp + 368 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 64989756-64991317(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAAAGGATAAGAAT
SmilChr02G004733 Chr02 NC_080388.1:69565642-69565656promoter 内 3557-3571 bp + 430 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69561938-69565212(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATTAGGATAAGAAA
SmilChr01G004658 Chr01 NC_080387.1:64668111-64668125promoter 内 3539-3553 bp - 448 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 64666724-64667663(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CTTCTTATCCATTTT
SmilChr01G000936 Chr01 NC_080387.1:19836020-19836034promoter 内 3458-3472 bp - 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 19836563-19837390(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAAAGGATAAGAAT
SmilChr01G005304 Chr01 NC_080387.1:70309694-70309708promoter 内 3392-3406 bp - 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 70307271-70309099(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAACTTATCCACTCG
SmilChr01G005231 Chr01 NC_080387.1:69900978-69900992promoter 内 3386-3400 bp + 601 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69901593-69901665(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATCTCATCCATAAT
SmilChr03G000222 Chr03 NC_080389.1:2596170-2596184promoter 内 3337-3351 bp - 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 2596834-2607793(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTATAGGATAAGAAT
SmilChr04G003959 Chr04 NC_080390.1:55121676-55121690promoter 内 3311-3325 bp - 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55118334-55121000(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATACTTATCCATTTG
SmilChr02G004676 Chr02 NC_080388.1:69107283-69107297promoter 内 3272-3286 bp - 715 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69108012-69110559(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTATAGGATAAGATC
SmilChr03G000583 Chr03 NC_080389.1:6501681-6501695promoter 内 3222-3236 bp + 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 6500139-6500916(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTGTGGATAAGAAA
SmilChr02G004660 Chr02 NC_080388.1:69002088-69002102promoter 内 3158-3172 bp - 829 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69002931-69006333(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GCAAAGGATAAGATT
SmilChr04G003582 Chr04 NC_080390.1:52239532-52239546promoter 内 3145-3159 bp - 842 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52240388-52242144(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAATAGGATAAGGAC
SmilChr02G002337 Chr02 NC_080388.1:41069255-41069269promoter 内 3059-3073 bp + 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41070197-41071776(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCTTATCCTATAA
SmilChr01G003591 Chr01 NC_080387.1:54457595-54457609promoter 内 3054-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54458542-54509308(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTATGGATAAAGAT
SmilChr01G003592 Chr01 NC_080387.1:54457595-54457609promoter 内 3042-3056 bp - 945 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54458554-54462410(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTATGGATAAAGAT
SmilChr02G002362 Chr02 NC_080388.1:41399431-41399445promoter 内 3035-3049 bp - 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41400397-41402231(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATGGATAAGAAG
SmilChr02G002036 Chr02 NC_080388.1:36635290-36635304promoter 内 3006-3020 bp + 981 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 36632453-36634309(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CCTGTGGATAAGATA
SmilChr01G004319 Chr01 NC_080387.1:61366402-61366416promoter 内 2977-2991 bp - 1010 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 61367426-61371693(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAAAGGATAAGAAT
SmilChr02G003163 Chr02 NC_080388.1:52670150-52670164promoter 内 2976-2990 bp - 1011 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52666333-52669139(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATTTT
SmilChr04G000396 Chr04 NC_080390.1:4105843-4105857promoter 内 2752-2766 bp - 1235 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4107092-4109949(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGAATGGATAAGAAA
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SmilChr01G003093 Chr01 NC_080387.1:49750704-49750718promoter 内 2591-2605 bp + 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 49745754-49749308(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATGGATAAAATT
SmilChr02G005422 Chr02 NC_080388.1:74684753-74684767promoter 内 2531-2545 bp + 1456 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 74681555-74683297(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAATTGGATAATACT
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SmilChr01G001930 Chr01 NC_080387.1:34474007-34474021promoter 内 2412-2426 bp - 1575 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34471363-34472432(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATTATCCAAATG
SmilChr02G003730 Chr02 NC_080388.1:58936530-58936544promoter 内 2355-2369 bp - 1632 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 58929601-58934898(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAACTTATCCTTAAG
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SmilChr01G002464 Chr01 NC_080387.1:42340453-42340467promoter 内 2274-2288 bp - 1713 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 42337723-42338740(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATTATCCAAATG
SmilChr01G002569 Chr01 NC_080387.1:43789679-43789693promoter 内 2263-2277 bp + 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 43783503-43787955(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGAATGGATAAGAAA
SmilChr02G003500 Chr02 NC_080388.1:56212586-56212600promoter 内 2202-2216 bp + 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56206043-56210801(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTATGGATAATTTT
SmilChr04G000052 Chr04 NC_080390.1:460505-460519promoter 内 2161-2175 bp - 1826 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 462345-464873(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAATTGGATAAGAAG
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SmilChr02G003799 Chr02 NC_080388.1:59622620-59622634promoter 内 2118-2132 bp + 1869 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 59619165-59620751(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAACTGGATAAGAAT
SmilChr01G005647 Chr01 NC_080387.1:72874937-72874951promoter 内 1981-1995 bp + 2006 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72869032-72872931(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTGTGGATAAGAAA
SmilChr04G002239 Chr04 NC_080390.1:36154592-36154606promoter 内 1937-1951 bp + 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 36156656-36164001(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CACTTTATCCACAAA
SmilChr03G000824 Chr03 NC_080389.1:9436836-9436850promoter 内 1911-1925 bp + 2076 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9427890-9434760(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTAAGGATAAGATA
SmilChr02G003554 Chr02 NC_080388.1:56724630-56724644promoter 内 1903-1917 bp + 2084 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56717584-56722546(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTATGGATAATTTT
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SmilChr02G003023 Chr02 NC_080388.1:50913424-50913438promoter 内 1762-1776 bp + 2225 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50915663-50918547(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATTTT
SmilChr01G003726 Chr01 NC_080387.1:55578975-55578989promoter 内 1737-1751 bp - 2250 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55575070-55576725(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCTTATCCTTTAT
SmilChr03G002578 Chr03 NC_080389.1:40995585-40995599promoter 内 1679-1693 bp - 2308 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 40997907-40999995(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAATACT
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SmilChr01G002260 Chr01 NC_080387.1:39398788-39398802promoter 内 1586-1600 bp - 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 39392484-39396387(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTTATCTTATAT
SmilChr01G003667 Chr01 NC_080387.1:55096453-55096467promoter 内 1557-1571 bp - 2430 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55090903-55094023(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATTTT
SmilChr01G000171 Chr01 NC_080387.1:2817744-2817758promoter 内 1537-1551 bp + 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 2814620-2815294(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATATAGGATAAGGAC
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SmilChr02G002338 Chr02 NC_080388.1:41069255-41069269promoter 内 1431-1445 bp + 2556 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41071825-41072379(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCTTATCCTATAA
SmilChr04G003470 Chr04 NC_080390.1:51169195-51169209promoter 内 1380-1394 bp + 2607 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 51171816-51172821(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTATTATCCATAAA