转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 47 / 136 下载 TSV

上一页 47 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003211 Chr04 NC_080390.1:48956838-48956848promoter 内 181-191 bp - 3810 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 48949281-48953028(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTC
SmilChr08G002138 Chr08 NC_080394.1:19258636-19258646promoter 内 162-172 bp + 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 19251668-19254807(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGGT
SmilChr03G002838 Chr03 NC_080389.1:44917421-44917431promoter 内 147-157 bp + 3844 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 44921275-44922526(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTC
SmilChr02G002598 Chr02 NC_080388.1:45116255-45116265promoter 内 144-154 bp + 3847 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 45120112-45120184(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGA
SmilChr02G000069 Chr02 NC_080388.1:879409-879419promoter 内 40-50 bp + 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 883370-884867(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGA
SmilChr04G002049 Chr04 NC_080390.1:33214930-33214940promoter 内 2030-2040 bp - 1961 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 4 33216901-33217485(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCG
SmilChr06G000368 Chr06 NC_080392.1:2849848-2849858promoter 内 3393-3403 bp + 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 2846631-2849250(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCG
SmilChr07G001125 Chr07 NC_080393.1:8434022-8434032promoter 内 1896-1906 bp - 2095 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 8436127-8437492(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCG
SmilChr02G000715 Chr02 NC_080388.1:11521979-11521989promoter 内 1834-1844 bp + 2157 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 11516826-11519822(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAG
SmilChr01G000639 Chr01 NC_080387.1:14366307-14366317promoter 内 1728-1738 bp + 2263 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 14368580-14375203(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAG
SmilChr03G001379 Chr03 NC_080389.1:16312744-16312754promoter 内 1640-1650 bp - 2351 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 16315105-16317328(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAG
SmilChr08G001904 Chr08 NC_080394.1:16533820-16533830promoter 内 986-996 bp - 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 16528662-16530815(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAG
SmilChr05G003714 Chr05 NC_080391.1:50254445-50254455promoter 内 655-665 bp - 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 50257791-50263352(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAG
SmilChr02G000344 Chr02 NC_080388.1:4498523-4498533promoter 内 417-427 bp - 3574 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 4492434-4494949(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAG
SmilChr07G000332 Chr07 NC_080393.1:2257529-2257539promoter 内 356-366 bp + 3635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 2251040-2253894(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCCCTGAGCC
SmilChr08G000650 Chr08 NC_080394.1:4838288-4838298promoter 内 3888-3898 bp + 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4835401-4838185(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCCCTGAGCC
SmilChr07G000333 Chr07 NC_080393.1:2257529-2257539promoter 内 2907-2917 bp + 1084 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 2254969-2256445(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCCCTGAGCC
SmilChr04G000915 Chr04 NC_080390.1:11907234-11907244promoter 内 2484-2494 bp + 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 11903946-11905727(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCCCTGAGCC
SmilChr01G005283 Chr01 NC_080387.1:70209711-70209721promoter 内 2351-2361 bp - 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 70211361-70212134(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCG
SmilChr04G001106 Chr04 NC_080390.1:15842332-15842342promoter 内 2217-2227 bp + 1774 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 15838118-15840558(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCCCTGAGCC
SmilChr03G004007 Chr03 NC_080389.1:59082726-59082736promoter 内 2195-2205 bp - 1796 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 59084532-59085631(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCCCTGAGCC
SmilChr04G001056 Chr04 NC_080390.1:15077753-15077763promoter 内 2165-2175 bp - 1826 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 15079589-15090553(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCCCTGAGCC
SmilChr02G004954 Chr02 NC_080388.1:71495859-71495869promoter 内 1892-1902 bp - 2099 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 71491638-71493760(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAG
SmilChr01G003364 Chr01 NC_080387.1:52390423-52390433promoter 内 1520-1530 bp - 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 52385154-52387952(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGGC
SmilChr03G001577 Chr03 NC_080389.1:19941726-19941736promoter 内 1334-1344 bp - 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 19930203-19939069(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAG
SmilChr08G003981 Chr08 NC_080394.1:47959825-47959835promoter 内 1135-1145 bp + 2856 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 47962691-47964264(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAG
SmilChr05G003028 Chr05 NC_080391.1:37890955-37890965promoter 内 1049-1059 bp - 2942 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 37893907-37895207(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGC
SmilChr01G003112 Chr01 NC_080387.1:49923817-49923827promoter 内 1020-1030 bp + 2971 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 49926798-49930025(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCG
SmilChr06G001624 Chr06 NC_080392.1:18096397-18096407promoter 内 979-989 bp + 3012 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 18090383-18093385(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGC
SmilChr04G003952 Chr04 NC_080390.1:55085484-55085494promoter 内 958-968 bp + 3033 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 55080439-55082451(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAG
SmilChr01G004751 Chr01 NC_080387.1:65689484-65689494promoter 内 933-943 bp + 3058 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 65684443-65686426(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGC
SmilChr01G005266 Chr01 NC_080387.1:70115006-70115016promoter 内 747-757 bp - 3244 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 70118260-70118942(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCG
SmilChr07G004463 Chr07 NC_080393.1:57222932-57222942promoter 内 725-735 bp - 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 57217973-57219666(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCG
SmilChr03G002535 Chr03 NC_080389.1:40421661-40421671promoter 内 622-632 bp - 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 40425040-40425946(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGC
SmilChr07G001642 Chr07 NC_080393.1:13844833-13844843promoter 内 470-480 bp + 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 13840293-13841312(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCCCTGAGCC
SmilChr06G000698 Chr06 NC_080392.1:6208878-6208888promoter 内 384-394 bp - 3607 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 6212495-6216121(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGC
SmilChr08G000651 Chr08 NC_080394.1:4838288-4838298promoter 内 289-299 bp + 3702 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4842000-4846180(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGGC
SmilChr07G001661 Chr07 NC_080393.1:14065297-14065307promoter 内 214-224 bp + 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 14060765-14061520(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCCCTGAGCC
SmilChr01G003083 Chr01 NC_080387.1:49672667-49672677promoter 内 135-145 bp - 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 49665340-49668811(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCG
SmilChr01G005284 Chr01 NC_080387.1:70209711-70209721promoter 内 100-110 bp - 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 70213612-70214342(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCG
SmilChr01G002762 Chr01 NC_080387.1:46023562-46023572promoter 内 71-81 bp - 3920 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 46027492-46030826(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCG
SmilChr04G001276 Chr04 NC_080390.1:20291409-20291419promoter 内 3715-3725 bp + 276 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 20291695-20292501(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTA
SmilChr03G003406 Chr03 NC_080389.1:52413401-52413411promoter 内 3690-3700 bp - 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 52407989-52413100(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr06G002332 Chr06 NC_080392.1:33839536-33839546promoter 内 3428-3438 bp - 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 33818395-33838973(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr08G000257 Chr08 NC_080394.1:1784345-1784355promoter 内 3163-3173 bp - 828 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1777540-1783517(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr05G002100 Chr05 NC_080391.1:21971828-21971838promoter 内 3121-3131 bp - 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 21966500-21970958(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr01G004115 Chr01 NC_080387.1:59683318-59683328promoter 内 3740-3750 bp - 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59683579-59684819(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr04G000533 Chr04 NC_080390.1:5907585-5907595promoter 内 3675-3685 bp + 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 5907911-5921541(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTA
SmilChr08G004906 Chr08 NC_080394.1:58051366-58051376promoter 内 3649-3659 bp - 342 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 58049968-58051024(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr03G003407 Chr03 NC_080389.1:52413401-52413411promoter 内 3560-3570 bp - 431 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 52413842-52414897(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT