转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 48 / 136 下载 TSV

上一页 48 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002333 Chr06 NC_080392.1:33839536-33839546promoter 内 3529-3539 bp - 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 33840008-33841063(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr01G005159 Chr01 NC_080387.1:69354283-69354293promoter 内 3524-3534 bp - 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 69354760-69355445(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr02G001430 Chr02 NC_080388.1:27007102-27007112promoter 内 3521-3531 bp + 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 27005555-27006632(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr08G000258 Chr08 NC_080394.1:1784345-1784355promoter 内 3510-3520 bp - 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1784836-1785998(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr07G004728 Chr07 NC_080393.1:60158228-60158238promoter 内 3499-3509 bp + 492 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 60157068-60157736(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr02G000758 Chr02 NC_080388.1:12353291-12353301promoter 内 3497-3507 bp + 494 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 12353795-12361407(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr04G002879 Chr04 NC_080390.1:44993158-44993168promoter 内 3155-3165 bp - 836 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 44994004-44997472(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr02G004353 Chr02 NC_080388.1:65801938-65801948promoter 内 2937-2947 bp + 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 65796321-65800884(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGCT
SmilChr01G003690 Chr01 NC_080387.1:55269308-55269318promoter 内 2719-2729 bp + 1272 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 55270590-55273486(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr04G001275 Chr04 NC_080390.1:20291409-20291419promoter 内 2539-2549 bp + 1452 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 20273678-20289957(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGCT
SmilChr02G003759 Chr02 NC_080388.1:59237827-59237837promoter 内 2468-2478 bp - 1523 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59239360-59240873(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr01G004116 Chr01 NC_080387.1:59683318-59683328promoter 内 2316-2326 bp - 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59685003-59686383(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr02G001942 Chr02 NC_080388.1:34972668-34972678promoter 内 2300-2310 bp - 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 34974369-34975761(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr03G002487 Chr03 NC_080389.1:39546384-39546394promoter 内 2261-2271 bp - 1730 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 39548124-39549504(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr08G000259 Chr08 NC_080394.1:1784345-1784355promoter 内 2261-2271 bp - 1730 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1786085-1787465(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr02G001429 Chr02 NC_080388.1:27007102-27007112promoter 内 2260-2270 bp + 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 27003991-27005371(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr01G005158 Chr01 NC_080387.1:69354283-69354293promoter 内 1870-1880 bp - 2121 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 69347310-69352162(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr03G004088 Chr03 NC_080389.1:59781794-59781804promoter 内 1476-1486 bp - 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59775918-59779279(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr02G003530 Chr02 NC_080388.1:56449194-56449204promoter 内 1037-1047 bp + 2954 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 56452158-56455371(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTA
SmilChr02G003584 Chr02 NC_080388.1:57002292-57002302promoter 内 1012-1022 bp + 2979 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 57005281-57007063(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTA
SmilChr07G000227 Chr07 NC_080393.1:1468041-1468051promoter 内 895-905 bp - 3096 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1457496-1464945(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr08G003897 Chr08 NC_080394.1:46292436-46292446promoter 内 830-840 bp - 3161 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 46295607-46295680(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGCT
SmilChr08G002920 Chr08 NC_080394.1:29235639-29235649promoter 内 780-790 bp - 3211 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 29221274-29232428(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTA
SmilChr04G003298 Chr04 NC_080390.1:49697168-49697178promoter 内 751-761 bp + 3240 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 49700418-49706743(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr06G003171 Chr06 NC_080392.1:44658441-44658451promoter 内 662-672 bp - 3329 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 44653486-44655112(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr07G004674 Chr07 NC_080393.1:59685637-59685647promoter 内 598-608 bp + 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59689040-59692958(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTA
SmilChr08G003898 Chr08 NC_080394.1:46292436-46292446promoter 内 586-596 bp - 3405 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 46295851-46295924(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGCT
SmilChr07G004660 Chr07 NC_080393.1:59499734-59499744promoter 内 567-577 bp + 3424 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59503168-59507386(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCA
SmilChr05G001562 Chr05 NC_080391.1:14306649-14306659promoter 内 115-125 bp + 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 14300146-14302773(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTT
SmilChr01G001157 Chr01 NC_080387.1:23520103-23520113promoter 内 3742-3752 bp - 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 23515547-23519854(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGT
SmilChr06G001629 Chr06 NC_080392.1:18230203-18230213promoter 内 1852-1862 bp - 2139 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 18218045-18228064(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGT
SmilChr01G005688 Chr01 NC_080387.1:73172601-73172611promoter 内 2071-2081 bp - 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 73168441-73170681(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGT
SmilChr03G004148 Chr03 NC_080389.1:60307245-60307255promoter 内 1095-1105 bp + 2896 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 60297213-60304349(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTC
SmilChr02G002007 Chr02 NC_080388.1:36205012-36205022promoter 内 1032-1042 bp - 2959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 7 36207981-36211427(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCTGAGCC
SmilChr01G006191 Chr01 NC_080387.1:77526254-77526264promoter 内 1221-1231 bp + 2770 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 4 77517612-77523484(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGA
SmilChr01G006190 Chr01 NC_080387.1:77520167-77520177promoter 内 1175-1185 bp + 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 4 77513390-77517351(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGA
SmilChr07G003556 Chr07 NC_080393.1:41417777-41417787promoter 内 3849-3859 bp - 142 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 41417929-41418651(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGA
SmilChr02G001704 Chr02 NC_080388.1:31342452-31342462promoter 内 3494-3504 bp - 497 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 31342959-31346201(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCC
SmilChr07G003635 Chr07 NC_080393.1:43050457-43050467promoter 内 2780-2790 bp + 1211 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 43043182-43049246(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCC
SmilChr07G003636 Chr07 NC_080393.1:43050457-43050467promoter 内 2703-2713 bp + 1288 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 43051755-43056440(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGC
SmilChr01G004413 Chr01 NC_080387.1:62261886-62261896promoter 内 3806-3816 bp - 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 62262081-62265543(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGA
SmilChr04G001725 Chr04 NC_080390.1:28496714-28496724promoter 内 3712-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 28497003-28503721(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCC
SmilChr04G003179 Chr04 NC_080390.1:48494361-48494371promoter 内 3068-3078 bp + 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 48492374-48493438(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGA
SmilChr05G001507 Chr05 NC_080391.1:13825137-13825147promoter 内 2987-2997 bp + 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 13826151-13826253(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTTCAGCGCC
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SmilChr01G005611 Chr01 NC_080387.1:72652125-72652135promoter 内 2900-2910 bp - 1091 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 72653226-72654251(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGC
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SmilChr05G001488 Chr05 NC_080391.1:13652642-13652652promoter 内 2775-2785 bp + 1216 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 13653868-13654595(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGGA
SmilChr01G001103 Chr01 NC_080387.1:22578163-22578173promoter 内 2296-2306 bp + 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 22569983-22576468(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGC
SmilChr08G004792 Chr08 NC_080394.1:57219488-57219498promoter 内 2245-2255 bp + 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 57221244-57222305(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGGA