转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 52 / 136 下载 TSV

上一页 52 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G004153 Chr07 NC_080393.1:53390896-53390906promoter 内 2807-2817 bp - 1184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 53388582-53389712(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGTA
SmilChr04G003818 Chr04 NC_080390.1:54334521-54334531promoter 内 2677-2687 bp - 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 54329480-54333207(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr07G002351 Chr07 NC_080393.1:21831726-21831736promoter 内 2634-2644 bp - 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 21833093-21833993(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr01G001122 Chr01 NC_080387.1:22831393-22831403promoter 内 2468-2478 bp - 1523 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 22832926-22840584(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr01G003632 Chr01 NC_080387.1:54840405-54840415promoter 内 2424-2434 bp - 1567 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 54841982-54845695(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr03G004051 Chr03 NC_080389.1:59474477-59474487promoter 内 2378-2388 bp - 1613 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 59467771-59472864(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr06G001729 Chr06 NC_080392.1:19913326-19913336promoter 内 2023-2033 bp + 1968 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 19915304-19915375(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr06G002051 Chr06 NC_080392.1:26933268-26933278promoter 内 1754-1764 bp - 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 26929816-26931031(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr04G002135 Chr04 NC_080390.1:34335084-34335094promoter 内 1652-1662 bp - 2339 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 34337433-34340075(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr06G002355 Chr06 NC_080392.1:34290822-34290832promoter 内 42-52 bp + 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 34286768-34286873(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr04G003819 Chr04 NC_080390.1:54334521-54334531promoter 内 30-40 bp - 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 54338492-54342182(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr08G003733 Chr08 NC_080394.1:42176174-42176184promoter 内 21-31 bp - 3970 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 42180154-42180259(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr03G003723 Chr03 NC_080389.1:56251029-56251039promoter 内 3857-3867 bp + 134 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 56248694-56250895(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr06G002891 Chr06 NC_080392.1:41763860-41763870promoter 内 3855-3865 bp + 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 41761342-41763724(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGGCTGAGCA
SmilChr06G001985 Chr06 NC_080392.1:25292436-25292446promoter 内 3705-3715 bp - 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 25282543-25292150(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr03G001917 Chr03 NC_080389.1:26868276-26868286promoter 内 3596-3606 bp - 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 26862241-26867881(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCG
SmilChr07G002648 Chr07 NC_080393.1:25657665-25657675promoter 内 3539-3549 bp - 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 25658127-25658568(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr06G002155 Chr06 NC_080392.1:29374562-29374572promoter 内 3531-3541 bp - 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 29375032-29375817(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr05G000951 Chr05 NC_080391.1:7677407-7677417promoter 内 3529-3539 bp + 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 7677879-7681288(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr01G001707 Chr01 NC_080387.1:31502917-31502927promoter 内 3507-3517 bp - 484 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 31496041-31502433(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr08G002705 Chr08 NC_080394.1:26631876-26631886promoter 内 3490-3500 bp + 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 26632387-26652460(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr03G002127 Chr03 NC_080389.1:33127010-33127020promoter 内 3414-3424 bp + 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 33123457-33126433(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr01G001151 Chr01 NC_080387.1:23464486-23464496promoter 内 3385-3395 bp + 606 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 23465102-23468493(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr06G002102 Chr06 NC_080392.1:28073783-28073793promoter 内 3327-3337 bp - 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 28074457-28078233(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGGCTGAGCA
SmilChr02G004343 Chr02 NC_080388.1:65692773-65692783promoter 内 3297-3307 bp + 694 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 65693477-65704341(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr01G004408 Chr01 NC_080387.1:62173557-62173567promoter 内 3212-3222 bp - 779 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 62174346-62175450(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr07G000393 Chr07 NC_080393.1:2650530-2650540promoter 内 3204-3214 bp - 787 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 2648052-2649743(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr01G000264 Chr01 NC_080387.1:5097873-5097883promoter 内 3175-3185 bp + 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 5088159-5097057(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGGCTGAGCA
SmilChr03G000160 Chr03 NC_080389.1:1769810-1769820promoter 内 3155-3165 bp + 836 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 1770656-1771579(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr05G003415 Chr05 NC_080391.1:45363808-45363818promoter 内 3140-3150 bp + 851 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 45364669-45371631(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr08G003689 Chr08 NC_080394.1:41207346-41207356promoter 内 3125-3135 bp + 866 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 41203466-41206480(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGC
SmilChr05G004148 Chr05 NC_080391.1:55409585-55409595promoter 内 3078-3088 bp + 913 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 55408094-55408672(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr07G000594 Chr07 NC_080393.1:4060965-4060975promoter 内 3028-3038 bp - 963 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 4056473-4060002(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCACAGCGCG
SmilChr04G001175 Chr04 NC_080390.1:17642552-17642562promoter 内 3014-3024 bp + 977 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 17643539-17643883(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr07G000555 Chr07 NC_080393.1:3832607-3832617promoter 内 2966-2976 bp - 1025 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 3823636-3831582(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr01G003788 Chr01 NC_080387.1:56267766-56267776promoter 内 2860-2870 bp + 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 56263367-56266635(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
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SmilChr05G002574 Chr05 NC_080391.1:28944671-28944681promoter 内 2620-2630 bp - 1371 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 28942701-28943300(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCCCAGCGCG
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SmilChr01G003052 Chr01 NC_080387.1:49473764-49473774promoter 内 2477-2487 bp + 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 49470488-49472250(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
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SmilChr07G000915 Chr07 NC_080393.1:6539365-6539375promoter 内 2074-2084 bp + 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 6531613-6537448(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
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SmilChr01G003056 Chr01 NC_080387.1:49473764-49473774promoter 内 1933-1943 bp + 2058 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 49471634-49471706(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr01G003055 Chr01 NC_080387.1:49473764-49473774promoter 内 1713-1723 bp + 2278 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 49471408-49471486(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr04G002393 Chr04 NC_080390.1:38447201-38447211promoter 内 1628-1638 bp - 2363 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 38442411-38444838(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTTCAGCGCG
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SmilChr05G002440 Chr05 NC_080391.1:26897430-26897440promoter 内 1535-1545 bp - 2456 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 26899896-26901729(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGGCTGAGCA
SmilChr08G001075 Chr08 NC_080394.1:8271307-8271317promoter 内 1473-1483 bp - 2518 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 8273835-8275136(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr08G002707 Chr08 NC_080394.1:26631876-26631886promoter 内 1409-1419 bp + 2582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 26634468-26639253(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT