转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 56 / 143 下载 TSV

上一页 56 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000247 Chr01 NC_080387.1:4651053-4651064promoter 内 3242-3253 bp - 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 4649148-4650305(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr01G000292 Chr01 NC_080387.1:5709466-5709477promoter 内 3236-3247 bp - 754 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 5706918-5708712(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr02G001048 Chr02 NC_080388.1:18540325-18540336promoter 内 3236-3247 bp + 754 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 18541090-18542998(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr02G001548 Chr02 NC_080388.1:28774236-28774247promoter 内 3144-3155 bp - 846 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 28775093-28778230(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCGC
SmilChr05G003011 Chr05 NC_080391.1:37338825-37338836promoter 内 3142-3153 bp - 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 37337077-37337977(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr04G001069 Chr04 NC_080390.1:15358000-15358011promoter 内 3032-3043 bp - 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 15354434-15357042(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTT
SmilChr04G001104 Chr04 NC_080390.1:15809781-15809792promoter 内 2876-2887 bp - 1114 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 15806728-15808667(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr04G000408 Chr04 NC_080390.1:4259722-4259733promoter 内 2801-2812 bp - 1189 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 4260922-4284704(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAT
SmilChr04G002895 Chr04 NC_080390.1:45178783-45178794promoter 内 2758-2769 bp + 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 45174462-45177551(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAAT
SmilChr02G001984 Chr02 NC_080388.1:35782948-35782959promoter 内 2659-2670 bp - 1331 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 35779820-35781617(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTCCAGCTGTG
SmilChr07G000530 Chr07 NC_080393.1:3683398-3683409promoter 内 2463-2474 bp + 1527 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 3684936-3686594(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr01G000406 Chr01 NC_080387.1:8244008-8244019promoter 内 2457-2468 bp + 1533 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8245552-8246573(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTCCAGCTGTG
SmilChr03G004202 Chr03 NC_080389.1:60644690-60644701promoter 内 2394-2405 bp + 1596 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 60638345-60643094(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAT
SmilChr03G004203 Chr03 NC_080389.1:60644690-60644701promoter 内 2388-2399 bp + 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 60641507-60643088(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAT
SmilChr05G003010 Chr05 NC_080391.1:37338825-37338836promoter 内 2234-2245 bp - 1756 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 37335707-37337069(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr01G005418 Chr01 NC_080387.1:71387329-71387340promoter 内 2222-2233 bp + 1768 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 71389108-71390183(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr04G000402 Chr04 NC_080390.1:4194220-4194231promoter 内 2195-2206 bp - 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 4196026-4201934(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAT
SmilChr07G000528 Chr07 NC_080393.1:3683398-3683409promoter 内 2044-2055 bp + 1946 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 3679464-3681452(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr04G001314 Chr04 NC_080390.1:21004768-21004779promoter 内 1999-2010 bp + 1991 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 21002259-21002777(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr08G001556 Chr08 NC_080394.1:12776342-12776353promoter 内 1972-1983 bp - 2018 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 12769949-12774324(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTAGA
SmilChr07G001120 Chr07 NC_080393.1:8332121-8332132promoter 内 1923-1934 bp - 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8329205-8330054(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr02G001932 Chr02 NC_080388.1:34737160-34737171promoter 内 1848-1859 bp - 2142 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34739313-34740095(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr04G001703 Chr04 NC_080390.1:28167588-28167599promoter 内 1772-1783 bp - 2218 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 28169817-28170251(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr04G000978 Chr04 NC_080390.1:13174815-13174826promoter 内 1736-1747 bp - 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 13177080-13178379(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr02G001120 Chr02 NC_080388.1:20209048-20209059promoter 内 1684-1695 bp - 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 20204191-20206742(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr03G002019 Chr03 NC_080389.1:30226451-30226462promoter 内 1684-1695 bp - 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 30221594-30224145(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr06G002395 Chr06 NC_080392.1:34736121-34736132promoter 内 1666-1677 bp - 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34738456-34738914(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCCA
SmilChr01G000621 Chr01 NC_080387.1:13738698-13738709promoter 内 1623-1634 bp + 2367 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 13734991-13736331(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr04G001705 Chr04 NC_080390.1:28183544-28183555promoter 内 1608-1619 bp - 2382 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 28185937-28189670(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr01G001145 Chr01 NC_080387.1:23411612-23411623promoter 内 1564-1575 bp + 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 23414049-23416919(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr03G001684 Chr03 NC_080389.1:22219754-22219765promoter 内 1518-1529 bp - 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 22222237-22223700(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr01G000982 Chr01 NC_080387.1:20789554-20789565promoter 内 1517-1528 bp + 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 20792038-20795706(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr06G002393 Chr06 NC_080392.1:34723947-34723958promoter 内 1503-1514 bp - 2487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34726445-34727200(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCCA
SmilChr03G001128 Chr03 NC_080389.1:13032847-13032858promoter 内 1498-1509 bp + 2492 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 13035350-13046051(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCAT
SmilChr05G004212 Chr05 NC_080391.1:56007961-56007972promoter 内 1493-1504 bp + 2497 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 56010469-56012328(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAC
SmilChr03G004668 Chr03 NC_080389.1:64145229-64145240promoter 内 1483-1494 bp + 2507 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 64147747-64151428(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAC
SmilChr01G006140 Chr01 NC_080387.1:76915798-76915809promoter 内 1475-1486 bp - 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 76909055-76913283(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTAGA
SmilChr08G001918 Chr08 NC_080394.1:16714540-16714551promoter 内 1433-1444 bp - 2557 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 16705200-16711983(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGAG
SmilChr05G000958 Chr05 NC_080391.1:7727805-7727816promoter 内 1315-1326 bp - 2675 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 7730491-7734929(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCAT
SmilChr02G000435 Chr02 NC_080388.1:5670914-5670925promoter 内 1291-1302 bp - 2699 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 5673624-5676683(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr01G003514 Chr01 NC_080387.1:53749170-53749181promoter 内 1238-1249 bp - 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 53751933-53757502(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr08G003046 Chr08 NC_080394.1:30610065-30610076promoter 内 1237-1248 bp + 2753 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 30612829-30613604(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAC
SmilChr01G005333 Chr01 NC_080387.1:70533404-70533415promoter 内 1217-1228 bp - 2773 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 70536188-70538055(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCAT
SmilChr02G002218 Chr02 NC_080388.1:39428773-39428784promoter 内 1205-1216 bp - 2785 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 39421720-39425988(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAC
SmilChr05G002292 Chr05 NC_080391.1:24756380-24756391promoter 内 1157-1168 bp - 2833 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 24759224-24762489(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCAT
SmilChr06G002396 Chr06 NC_080392.1:34736121-34736132promoter 内 1155-1166 bp - 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34738967-34740218(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCCA
SmilChr05G000003 Chr05 NC_080391.1:11934-11945promoter 内 1074-1085 bp + 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 3422-9018(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT
SmilChr01G003779 Chr01 NC_080387.1:56187962-56187973promoter 内 1003-1014 bp - 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 56182250-56184975(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAT
SmilChr03G000038 Chr03 NC_080389.1:455922-455933promoter 内 906-917 bp + 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 459017-461513(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTT
SmilChr08G003669 Chr08 NC_080394.1:40581635-40581646promoter 内 906-917 bp + 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 40578449-40578551(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTT