转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 57 / 139 下载 TSV

上一页 57 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000204 Chr04 NC_080390.1:1821336-1821347promoter 内 2669-2680 bp + 1321 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1818353-1820015(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAGAG
SmilChr01G002635 Chr01 NC_080387.1:44633886-44633897promoter 内 2660-2671 bp - 1330 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 44635227-44639956(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAGAG
SmilChr02G001776 Chr02 NC_080388.1:32534806-32534817promoter 内 2635-2646 bp + 1355 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 32536172-32538199(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACACGTGGC
SmilChr04G003216 Chr04 NC_080390.1:48988379-48988390promoter 内 2413-2424 bp - 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48989967-48992451(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCGC
SmilChr01G002534 Chr01 NC_080387.1:43362146-43362157promoter 内 2397-2408 bp + 1593 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 43343102-43360553(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGAT
SmilChr01G005075 Chr01 NC_080387.1:68659086-68659097promoter 内 2266-2277 bp - 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 68627921-68657362(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTGTG
SmilChr04G003463 Chr04 NC_080390.1:51108671-51108682promoter 内 1828-1839 bp - 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51110844-51121902(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAGTG
SmilChr02G001084 Chr02 NC_080388.1:19423747-19423758promoter 内 1696-1707 bp + 2294 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 19417826-19421453(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAGTC
SmilChr01G001536 Chr01 NC_080387.1:29388178-29388189promoter 内 1684-1695 bp + 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 29390495-29392866(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACACGTGGC
SmilChr02G003230 Chr02 NC_080388.1:53573170-53573181promoter 内 1609-1620 bp - 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53575562-53577213(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTGGA
SmilChr05G000142 Chr05 NC_080391.1:1144341-1144352promoter 内 1480-1491 bp - 2510 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1146862-1150361(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAGGG
SmilChr03G004590 Chr03 NC_080389.1:63735865-63735876promoter 内 1383-1394 bp - 2607 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 63738483-63741036(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCGC
SmilChr02G000612 Chr02 NC_080388.1:8934173-8934184promoter 内 1357-1368 bp + 2633 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 8936817-8943434(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACTGACGTGTG
SmilChr02G000470 Chr02 NC_080388.1:6349201-6349212promoter 内 1287-1298 bp + 2703 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6351915-6354749(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACAGACGTGGC
SmilChr02G005009 Chr02 NC_080388.1:71902209-71902220promoter 内 1226-1237 bp - 2764 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 71896415-71899445(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCTGACGTGTA
SmilChr02G003094 Chr02 NC_080388.1:51817293-51817304promoter 内 1113-1124 bp + 2877 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51820181-51822612(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACACGTGGC
SmilChr01G002699 Chr01 NC_080387.1:45258359-45258370promoter 内 1096-1107 bp + 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45261264-45263971(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTGTG
SmilChr03G001878 Chr03 NC_080389.1:26065421-26065432promoter 内 1039-1050 bp + 2951 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 26068383-26069999(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCTGACGTGTG
SmilChr02G002649 Chr02 NC_080388.1:45897730-45897741promoter 内 972-983 bp + 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45900759-45903568(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCAGACGTGGG
SmilChr04G002440 Chr04 NC_080390.1:39079671-39079682promoter 内 968-979 bp - 3022 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39082704-39084685(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAGTG
SmilChr01G003069 Chr01 NC_080387.1:49535573-49535584promoter 内 830-841 bp + 3160 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 49531191-49532413(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCGC
SmilChr01G004758 Chr01 NC_080387.1:65787033-65787044promoter 内 730-741 bp - 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 65780273-65783773(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCAGACGTGGA
SmilChr03G003485 Chr03 NC_080389.1:53434515-53434526promoter 内 564-575 bp + 3426 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53425898-53431089(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCGC
SmilChr02G004747 Chr02 NC_080388.1:69683073-69683084promoter 内 530-541 bp - 3460 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 69674212-69679613(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCGGACGTGGC
SmilChr04G003001 Chr04 NC_080390.1:46404956-46404967promoter 内 508-519 bp + 3482 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 46408449-46422261(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACACGTGGC
SmilChr04G003215 Chr04 NC_080390.1:48988379-48988390promoter 内 452-463 bp - 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48970628-48984841(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACACGTGGC
SmilChr03G003765 Chr03 NC_080389.1:56786613-56786624promoter 内 382-393 bp + 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56790232-56794537(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACACGTGGC
SmilChr01G004760 Chr01 NC_080387.1:65787033-65787044promoter 内 335-346 bp - 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 65790699-65793386(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGGA
SmilChr02G003844 Chr02 NC_080388.1:60187269-60187280promoter 内 311-322 bp + 3679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 60179763-60183590(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCCGCT
SmilChr05G000141 Chr05 NC_080391.1:1144341-1144352promoter 内 298-309 bp - 3692 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1131390-1140649(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCTGACGTGTA
SmilChr04G003726 Chr04 NC_080390.1:53598135-53598146promoter 内 286-297 bp + 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53590583-53594431(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAGAG
SmilChr04G001372 Chr04 NC_080390.1:22312277-22312288promoter 内 259-270 bp + 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 22316019-22316921(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACACGTGGC
SmilChr02G004500 Chr02 NC_080388.1:67500471-67500482promoter 内 236-247 bp + 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 67504236-67504990(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGACACGTGGC
SmilChr02G000931 Chr02 NC_080388.1:16231205-16231216promoter 内 235-246 bp + 3755 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 16234971-16238879(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCAGACGTGGA
SmilChr01G001201 Chr01 NC_080387.1:24210350-24210361promoter 内 220-231 bp - 3770 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 24214131-24217214(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCGC
SmilChr02G000375 Chr02 NC_080388.1:4752697-4752708promoter 内 154-165 bp + 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4745987-4748861(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCGC
SmilChr01G003604 Chr01 NC_080387.1:54584848-54584859promoter 内 2674-2685 bp + 1316 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 54580869-54583532(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTTCC
SmilChr02G003001 Chr02 NC_080388.1:50677538-50677549promoter 内 2553-2564 bp - 1437 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 50678986-50681683(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTTCC
SmilChr03G000107 Chr03 NC_080389.1:1193765-1193776promoter 内 640-651 bp - 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 1188256-1190415(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGTAGC
SmilChr01G003232 Chr01 NC_080387.1:51092174-51092185promoter 内 3937-3948 bp - 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 51088112-51092121(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGACACGTGGC
SmilChr04G003242 Chr04 NC_080390.1:49202995-49203006promoter 内 3921-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 49203075-49209290(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTACACGTGGC
SmilChr04G003338 Chr04 NC_080390.1:50052341-50052352promoter 内 3921-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 50052421-50058572(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTACACGTGGC
SmilChr02G003979 Chr02 NC_080388.1:62055100-62055111promoter 内 3584-3595 bp + 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 62055517-62057055(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTTTCACGTGGC
SmilChr02G001361 Chr02 NC_080388.1:25509075-25509086promoter 内 3454-3465 bp - 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 25509622-25511800(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCAACGTCAGCC
SmilChr01G002905 Chr01 NC_080387.1:47753438-47753449promoter 内 3399-3410 bp - 591 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 47750657-47752847(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGTACACGTGGC
SmilChr01G000055 Chr01 NC_080387.1:860484-860495promoter 内 3043-3054 bp + 947 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 861442-864013(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGACACGTGGC
SmilChr01G003689 Chr01 NC_080387.1:55270767-55270778promoter 内 3018-3029 bp - 972 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 55267026-55269795(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGACACGTGGC
SmilChr01G001032 Chr01 NC_080387.1:21478390-21478401promoter 内 2808-2819 bp - 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 21476350-21477208(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGGGGC
SmilChr03G000850 Chr03 NC_080389.1:9690774-9690785promoter 内 2807-2818 bp - 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 9688500-9689591(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGGGGC
SmilChr03G002033 Chr03 NC_080389.1:30520324-30520335promoter 内 2802-2813 bp + 1188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 30521523-30522614(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGGGGC