转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 58 / 136 下载 TSV

上一页 58 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000937 Chr05 NC_080391.1:7551830-7551840promoter 内 2399-2409 bp + 1592 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7548860-7550238(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCC
SmilChr04G001557 Chr04 NC_080390.1:25774411-25774421promoter 内 2307-2317 bp + 1684 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 25769628-25772727(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr08G004831 Chr08 NC_080394.1:57586178-57586188promoter 内 2288-2298 bp + 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 57581961-57584475(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr02G004807 Chr02 NC_080388.1:70242043-70242053promoter 内 2248-2258 bp - 1743 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 70236589-70240300(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr01G002077 Chr01 NC_080387.1:36721632-36721642promoter 内 2237-2247 bp - 1754 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 36723396-36724475(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCT
SmilChr03G001960 Chr03 NC_080389.1:28084896-28084906promoter 内 2208-2218 bp - 1783 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 28086689-28096713(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCT
SmilChr02G002095 Chr02 NC_080388.1:37608000-37608010promoter 内 2162-2172 bp + 1829 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 37609839-37610911(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr07G001739 Chr07 NC_080393.1:14760579-14760589promoter 内 2107-2117 bp + 1884 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 14762473-14762545(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr01G002160 Chr01 NC_080387.1:37602498-37602508promoter 内 2086-2096 bp - 1905 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 37604413-37606391(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCT
SmilChr05G003371 Chr05 NC_080391.1:44600715-44600725promoter 内 2084-2094 bp + 1907 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 44593849-44598808(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr07G004738 Chr07 NC_080393.1:60245245-60245255promoter 内 2013-2023 bp + 1978 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 60240955-60243267(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr01G006028 Chr01 NC_080387.1:75840457-75840467promoter 内 1999-2009 bp + 1992 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 75837700-75838465(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr03G000857 Chr03 NC_080389.1:9798600-9798610promoter 内 1996-2006 bp - 1995 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 9789202-9796605(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACG
SmilChr03G000855 Chr03 NC_080389.1:9773092-9773102promoter 内 1989-1999 bp - 2002 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 9768373-9771090(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACG
SmilChr02G004016 Chr02 NC_080388.1:62458776-62458786promoter 内 1910-1920 bp - 2081 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 62454021-62456695(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCC
SmilChr03G000287 Chr03 NC_080389.1:3261485-3261495promoter 内 1895-1905 bp + 2096 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3263591-3264484(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr01G005251 Chr01 NC_080387.1:70033451-70033461promoter 内 1889-1899 bp - 2102 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 70029323-70031349(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCC
SmilChr06G001097 Chr06 NC_080392.1:10975132-10975142promoter 内 1852-1862 bp - 2139 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 10977281-10980415(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCT
SmilChr02G004805 Chr02 NC_080388.1:70242043-70242053promoter 内 1841-1851 bp - 2150 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 70221396-70239893(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr01G005565 Chr01 NC_080387.1:72443517-72443527promoter 内 1716-1726 bp - 2275 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 72445802-72448002(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCC
SmilChr06G000204 Chr06 NC_080392.1:1399909-1399919promoter 内 1704-1714 bp - 2287 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 1395868-1397622(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCC
SmilChr03G002104 Chr03 NC_080389.1:32762764-32762774promoter 内 1686-1696 bp - 2305 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 32760324-32760459(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr07G001466 Chr07 NC_080393.1:11509502-11509512promoter 内 1667-1677 bp + 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 11504561-11507178(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGTT
SmilChr04G004085 Chr04 NC_080390.1:55893402-55893412promoter 内 1666-1676 bp + 2325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 55887282-55891077(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCT
SmilChr02G002456 Chr02 NC_080388.1:42861333-42861343promoter 内 1609-1619 bp - 2382 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 42851946-42858951(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCG
SmilChr06G000924 Chr06 NC_080392.1:8773104-8773114promoter 内 1604-1614 bp + 2387 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 8775501-8781510(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr08G003047 Chr08 NC_080394.1:30614841-30614851promoter 内 1590-1600 bp - 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 30617252-30624199(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCT
SmilChr02G000785 Chr02 NC_080388.1:12904580-12904590promoter 内 1582-1592 bp + 2409 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 12901317-12902171(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCT
SmilChr04G002908 Chr04 NC_080390.1:45338912-45338922promoter 内 1551-1561 bp - 2440 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 45331954-45336472(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGG
SmilChr05G003281 Chr05 NC_080391.1:42742331-42742341promoter 内 1550-1560 bp - 2441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 42738934-42739890(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr02G004034 Chr02 NC_080388.1:62635664-62635674promoter 内 1511-1521 bp - 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 62630314-62633184(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC
SmilChr01G004773 Chr01 NC_080387.1:65920449-65920459promoter 内 1496-1506 bp - 2495 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 65922954-65924552(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr03G000224 Chr03 NC_080389.1:2623266-2623276promoter 内 1480-1490 bp - 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 2625787-2628468(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCT
SmilChr02G000500 Chr02 NC_080388.1:6886221-6886231promoter 内 1470-1480 bp + 2521 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 6882747-6883700(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCC
SmilChr02G002808 Chr02 NC_080388.1:48136977-48136987promoter 内 1468-1478 bp - 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 48139510-48141224(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCT
SmilChr05G003126 Chr05 NC_080391.1:39895179-39895189promoter 内 1431-1441 bp + 2560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 39897749-39898556(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr05G003225 Chr05 NC_080391.1:41399799-41399809promoter 内 1413-1423 bp + 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 41395430-41397221(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCT
SmilChr08G000028 Chr08 NC_080394.1:182833-182843promoter 内 1410-1420 bp + 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 185424-189535(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr08G002447 Chr08 NC_080394.1:23278447-23278457promoter 内 1399-1409 bp - 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 23270443-23275855(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTG
SmilChr03G000286 Chr03 NC_080389.1:3261485-3261495promoter 内 1367-1377 bp + 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3256730-3258861(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCT
SmilChr01G002949 Chr01 NC_080387.1:48358681-48358691promoter 内 1343-1353 bp - 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 48361339-48364998(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCT
SmilChr01G004976 Chr01 NC_080387.1:67829521-67829531promoter 内 1332-1342 bp + 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 67832190-67832949(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr03G003350 Chr03 NC_080389.1:51829677-51829687promoter 内 1256-1266 bp + 2735 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 51832422-51834098(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGTT
SmilChr08G002757 Chr08 NC_080394.1:27232058-27232068promoter 内 1183-1193 bp - 2808 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 27226334-27229250(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCG
SmilChr02G001050 Chr02 NC_080388.1:18724152-18724162promoter 内 1164-1174 bp + 2827 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 18726989-18730100(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCG
SmilChr02G000284 Chr02 NC_080388.1:3639604-3639614promoter 内 1161-1171 bp - 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3635326-3636774(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCG
SmilChr08G002302 Chr08 NC_080394.1:21566879-21566889promoter 内 1147-1157 bp - 2844 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 21563951-21564035(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCC
SmilChr05G003205 Chr05 NC_080391.1:41054005-41054015promoter 内 1024-1034 bp + 2967 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 41046674-41051038(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCC
SmilChr08G004645 Chr08 NC_080394.1:55952337-55952347promoter 内 1006-1016 bp - 2985 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 55955332-55958575(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCT
SmilChr08G003108 Chr08 NC_080394.1:31330819-31330829promoter 内 992-1002 bp - 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 31325721-31327820(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAC