转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 58 / 138 下载 TSV

上一页 58 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002888 Chr03 NC_080389.1:45548261-45548273promoter 内 2167-2179 bp + 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45550095-45553642(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGAGTTGACTATC
SmilChr03G000126 Chr03 NC_080389.1:1379773-1379785promoter 内 2074-2086 bp + 1915 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1375998-1377858(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAGAGTCAACACT
SmilChr02G004349 Chr02 NC_080388.1:65755848-65755860promoter 内 2052-2064 bp + 1937 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 65757797-65760619(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGGTTGACTGGA
SmilChr01G002754 Chr01 NC_080387.1:45860997-45861009promoter 内 2048-2060 bp + 1941 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 45857557-45859056(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAACCAA
SmilChr03G000844 Chr03 NC_080389.1:9634733-9634745promoter 内 1874-1886 bp + 2115 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9631854-9632618(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTAGTCAAAGGG
SmilChr02G004482 Chr02 NC_080388.1:67296836-67296848promoter 内 1808-1820 bp + 2181 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 67293477-67294655(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTCAGTCAACCTT
SmilChr01G002944 Chr01 NC_080387.1:48222810-48222822promoter 内 1795-1807 bp + 2194 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48218939-48220616(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAACAAC
SmilChr02G000657 Chr02 NC_080388.1:9986148-9986160promoter 内 1685-1697 bp - 2304 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9981181-9983844(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGGTTGACTAAC
SmilChr02G000708 Chr02 NC_080388.1:11398346-11398358promoter 内 1681-1693 bp + 2308 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11393227-11396038(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCAGTCAACAGT
SmilChr01G004256 Chr01 NC_080387.1:60832234-60832246promoter 内 1560-1572 bp + 2429 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 60834675-60835611(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGGTTGACTTGA
SmilChr01G004442 Chr01 NC_080387.1:62540170-62540182promoter 内 1494-1506 bp - 2495 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 62542677-62543327(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAGAGTCAACACT
SmilChr01G001512 Chr01 NC_080387.1:28951203-28951215promoter 内 1249-1261 bp + 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 28946670-28948463(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACGAGTCAACCCG
SmilChr02G002255 Chr02 NC_080388.1:39979184-39979196promoter 内 1243-1255 bp + 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39981942-39983388(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGGTTGACTTAC
SmilChr03G000365 Chr03 NC_080389.1:4087591-4087603promoter 内 1184-1196 bp - 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4083602-4084786(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGTTGACTATT
SmilChr03G004472 Chr03 NC_080389.1:62818630-62818642promoter 内 1072-1084 bp - 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 62821559-62829024(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAACATA
SmilChr02G004861 Chr02 NC_080388.1:70742329-70742341promoter 内 1026-1038 bp + 2963 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 70745304-70746864(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGTGTTGACTCTG
SmilChr03G002714 Chr03 NC_080389.1:43102731-43102743promoter 内 1021-1033 bp - 2968 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 43097783-43099763(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGGTTGACTAAC
SmilChr02G000358 Chr02 NC_080388.1:4612727-4612739promoter 内 846-858 bp + 3143 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4615882-4618242(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTGTTGACTGAA
SmilChr01G006120 Chr01 NC_080387.1:76731500-76731512promoter 内 842-854 bp + 3147 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 76734659-76756527(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCTTTGACTAAA
SmilChr02G003485 Chr02 NC_080388.1:56120339-56120351promoter 内 815-827 bp - 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56115171-56117165(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTGGTTGACTTCG
SmilChr01G005062 Chr01 NC_080387.1:68525707-68525719promoter 内 788-800 bp + 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 68528920-68531209(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAAGTTGACTAGG
SmilChr03G003535 Chr03 NC_080389.1:53964898-53964910promoter 内 726-738 bp - 3263 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53951902-53961635(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCTTTGACTAGC
SmilChr03G002544 Chr03 NC_080389.1:40617315-40617327promoter 内 721-733 bp - 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40620595-40622823(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAGAGTCAACCCG
SmilChr03G002611 Chr03 NC_080389.1:41526449-41526461promoter 内 613-625 bp - 3376 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 41521309-41523073(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTGGTTGACTTCT
SmilChr03G003120 Chr03 NC_080389.1:48364868-48364880promoter 内 609-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48360971-48361488(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCTAGTCAAACCC
SmilChr01G000970 Chr01 NC_080387.1:20562637-20562649promoter 内 440-452 bp - 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 20552989-20559088(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGGGTTGACTGAA
SmilChr02G003208 Chr02 NC_080388.1:53237708-53237720promoter 内 422-434 bp - 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53241287-53244838(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCCAGTCAACCAA
SmilChr03G004189 Chr03 NC_080389.1:60566195-60566207promoter 内 369-381 bp + 3620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 60569827-60572512(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CACTTTGACTATA
SmilChr02G004857 Chr02 NC_080388.1:70721466-70721478promoter 内 314-326 bp - 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 70711405-70717791(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTGTTGACTTTA
SmilChr02G004981 Chr02 NC_080388.1:71691908-71691920promoter 内 261-273 bp + 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 71695648-71700824(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCTTTGACTATC
SmilChr02G001771 Chr02 NC_080388.1:32481139-32481151promoter 内 154-166 bp + 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 32472307-32477304(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGAAGTCAACCAC
SmilChr03G004504 Chr03 NC_080389.1:63156945-63156957promoter 内 120-132 bp + 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 63150076-63153076(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAAGTCAACCAA
SmilChr03G004508 Chr03 NC_080389.1:63179935-63179947promoter 内 98-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 63170609-63176044(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAAGTCAACCAA
SmilChr02G004212 Chr02 NC_080388.1:64382327-64382339promoter 内 2260-2272 bp + 1729 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 64377780-64380598(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCAAGTCAACTCA
SmilChr03G003500 Chr03 NC_080389.1:53615744-53615756promoter 内 1878-1890 bp + 2111 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 53617867-53619696(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGAGTTGACTGTC
SmilChr01G005302 Chr01 NC_080387.1:70302538-70302550promoter 内 3664-3676 bp - 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 70302875-70303435(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAACATT
SmilChr02G001675 Chr02 NC_080388.1:31002685-31002697promoter 内 3648-3660 bp + 341 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 30999605-31002344(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAACTCA
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SmilChr02G002090 Chr02 NC_080388.1:37493792-37493804promoter 内 3417-3429 bp - 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 37487786-37493220(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGGTTGACTTCG
SmilChr03G001398 Chr03 NC_080389.1:16600615-16600627promoter 内 3279-3291 bp - 710 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 16601337-16604106(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAAAGTCAACTGC
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SmilChr02G001337 Chr02 NC_080388.1:24865389-24865401promoter 内 1818-1830 bp - 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 24861850-24863218(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGTTGACTGTG
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SmilChr03G001666 Chr03 NC_080389.1:21675319-21675331promoter 内 3882-3894 bp - 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 21673326-21675212(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGAGTTGACTGTC
SmilChr01G004579 Chr01 NC_080387.1:63845548-63845560promoter 内 3788-3800 bp + 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 63843623-63845347(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCAGTCAACAAC
SmilChr03G001350 Chr03 NC_080389.1:15738241-15738253promoter 内 3276-3288 bp - 713 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 15738966-15739708(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACAAC
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