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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G002277; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003292-RA_Salv SmilChr05G002277 ERF XP_057809665.1 MP00452 TCTTTGCCGACATCA

可能结合的靶基因

7783 个结合位点 6671 个候选靶基因 第 59 / 134 下载 TSV

上一页 59 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002873 Chr02 NC_080388.1:48975160-48975174promoter 内 1177-1191 bp + 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 48969672-48972350(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGCCCAAT
SmilChr07G001103 Chr07 NC_080393.1:8135059-8135073promoter 内 1161-1175 bp + 2826 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8129002-8132233(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCTTGTCGGCGCAGA
SmilChr05G002055 Chr05 NC_080391.1:21411237-21411251promoter 内 1158-1172 bp - 2829 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 21407872-21408408(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTGTTACCGACATTA
SmilChr02G002779 Chr02 NC_080388.1:47876272-47876286promoter 内 990-1004 bp - 2997 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 47879283-47889343(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGTCAATA
SmilChr07G001735 Chr07 NC_080393.1:14734723-14734737promoter 内 983-997 bp - 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 14737741-14750976(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTGTGTCGGCAGCCA
SmilChr04G004181 Chr04 NC_080390.1:56382359-56382373promoter 内 953-967 bp + 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56385407-56394503(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCATGACCGACATTC
SmilChr02G003475 Chr02 NC_080388.1:56050090-56050104promoter 内 910-924 bp + 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56053181-56053732(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCTTGGCCGACACAC
SmilChr02G005000 Chr02 NC_080388.1:71811110-71811124promoter 内 909-923 bp - 3078 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 71814202-71816017(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAATGTCGGCTGCCA
SmilChr04G001249 Chr04 NC_080390.1:19661020-19661034promoter 内 888-902 bp + 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 19656504-19657921(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGATGTCGGTCCACT
SmilChr02G003785 Chr02 NC_080388.1:59520342-59520356promoter 内 828-842 bp + 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 59514201-59517183(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCTTGTCGGCAAGCA
SmilChr02G002278 Chr02 NC_080388.1:40265232-40265246promoter 内 766-780 bp - 3221 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 40268467-40269588(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGAAGTCGGCAAAGC
SmilChr07G004308 Chr07 NC_080393.1:55667629-55667643promoter 内 727-741 bp - 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 55660369-55664369(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATTTTGCCGACGTAG
SmilChr02G002987 Chr02 NC_080388.1:50500020-50500034promoter 内 693-707 bp - 3294 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 50503328-50506990(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGCCCAAT
SmilChr01G005985 Chr01 NC_080387.1:75487568-75487582promoter 内 687-701 bp + 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 75482810-75484268(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGTTGTCGGCAAGTT
SmilChr01G002351 Chr01 NC_080387.1:40652926-40652940promoter 内 557-571 bp - 3430 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 40644255-40649496(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAGTGGCCGACACAC
SmilChr07G002560 Chr07 NC_080393.1:24350628-24350642promoter 内 541-555 bp - 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 24344487-24347182(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTGCAACCGACATTG
SmilChr04G000169 Chr04 NC_080390.1:1517369-1517383promoter 内 499-513 bp + 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 1506288-1513881(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AAATGTCGGTGGAAC
SmilChr01G001012 Chr01 NC_080387.1:21295153-21295167promoter 内 345-359 bp + 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 21288277-21291511(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCTTGTCGGCGCAGA
SmilChr05G003647 Chr05 NC_080391.1:48903973-48903987promoter 内 345-359 bp + 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 48907629-48912151(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTTTGGCCGACACAA
SmilChr03G003216 Chr03 NC_080389.1:49794709-49794723promoter 内 339-353 bp + 3648 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 49798371-49799583(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TATACACCGACATGC
SmilChr03G002587 Chr03 NC_080389.1:41161695-41161709promoter 内 262-276 bp + 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 41165434-41170176(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATCCTGCCGACGTCT
SmilChr06G001064 Chr06 NC_080392.1:10513294-10513308promoter 内 240-254 bp + 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 10503850-10509547(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGTGGTCGGCAGCGG
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SmilChr03G002586 Chr03 NC_080389.1:41131657-41131671promoter 内 227-241 bp + 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 41135431-41140133(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATCCTGCCGACGTCT
SmilChr08G002706 Chr08 NC_080394.1:26630554-26630568promoter 内 222-236 bp + 3765 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 26634333-26634406(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TAGATACCGACATCC
SmilChr05G001236 Chr05 NC_080391.1:10481727-10481741promoter 内 119-133 bp + 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 10474775-10477859(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTATGTCGGCCTTAC
SmilChr05G004233 Chr05 NC_080391.1:56158935-56158949promoter 内 110-124 bp - 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56146778-56155058(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCCGTGCCGACAAGC
SmilChr08G002707 Chr08 NC_080394.1:26630554-26630568promoter 内 87-101 bp + 3900 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 26634468-26639253(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TAGATACCGACATCC
SmilChr02G002784 Chr02 NC_080388.1:47916881-47916895promoter 内 82-96 bp - 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 47920800-47924013(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGTGGTCGGCAGCGG
SmilChr01G004626 Chr01 NC_080387.1:64320147-64320161promoter 内 76-90 bp - 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 64304875-64316236(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGTGGGCCGACATAA
SmilChr03G000898 Chr03 NC_080389.1:10267538-10267552promoter 内 69-83 bp - 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 10261530-10263620(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCCCTGCCGACTCCG
SmilChr03G000954 Chr03 NC_080389.1:10797002-10797016promoter 内 3429-3443 bp + 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 10795517-10796444(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCAGGTCGGCAGGTG
SmilChr03G000955 Chr03 NC_080389.1:10799987-10800001promoter 内 3313-3327 bp + 674 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 10800675-10809519(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CACCTGCCGACCTGC
SmilChr05G001134 Chr05 NC_080391.1:9471696-9471710promoter 内 3281-3295 bp + 706 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 3 9472416-9475494(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCGCTGCCGACGCCA
SmilChr04G003062 Chr04 NC_080390.1:47181337-47181351promoter 内 3735-3749 bp - 252 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 47181603-47182541(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGTTGTCGGCGCTGC
SmilChr07G004651 Chr07 NC_080393.1:59336792-59336806promoter 内 3374-3388 bp - 613 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 59326854-59336179(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCGATGCCGACGCCG
SmilChr07G003235 Chr07 NC_080393.1:34319338-34319352promoter 内 3311-3325 bp - 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 34314041-34318662(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCGCTGCCGACGCCA
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SmilChr01G002776 Chr01 NC_080387.1:46202081-46202095promoter 内 3895-3909 bp + 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 46202187-46210470(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGTCTACCGACATAT
SmilChr08G001188 Chr08 NC_080394.1:9515994-9516008promoter 内 3895-3909 bp - 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 9514897-9515902(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAGATACCGACATTG