转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 60 / 143 下载 TSV

上一页 60 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001366 Chr04 NC_080390.1:22172717-22172728promoter 内 1839-1850 bp + 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 22174879-22175848(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCTC
SmilChr02G001524 Chr02 NC_080388.1:28369977-28369988promoter 内 1755-1766 bp + 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 28372223-28372725(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCGA
SmilChr04G002290 Chr04 NC_080390.1:37187799-37187810promoter 内 1694-1705 bp + 2296 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 37184289-37185503(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCCA
SmilChr01G002375 Chr01 NC_080387.1:40960999-40961010promoter 内 1625-1636 bp + 2365 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 40963375-40970669(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTATA
SmilChr08G003082 Chr08 NC_080394.1:31041526-31041537promoter 内 1409-1420 bp + 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 31044118-31046575(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTATG
SmilChr04G000034 Chr04 NC_080390.1:335559-335570promoter 内 1110-1121 bp + 2880 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 331538-332679(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTT
SmilChr01G003142 Chr01 NC_080387.1:50249901-50249912promoter 内 1102-1113 bp - 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 50252800-50259192(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAGC
SmilChr07G002994 Chr07 NC_080393.1:30652983-30652994promoter 内 984-995 bp + 3006 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 30656000-30657102(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCGA
SmilChr02G005542 Chr02 NC_080388.1:75426124-75426135promoter 内 940-951 bp - 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 75429185-75435963(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTT
SmilChr08G000518 Chr08 NC_080394.1:3763113-3763124promoter 内 924-935 bp - 3066 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 3766190-3767197(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAGC
SmilChr03G002563 Chr03 NC_080389.1:40838025-40838036promoter 内 901-912 bp - 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 40832043-40834936(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCTC
SmilChr06G001558 Chr06 NC_080392.1:16989988-16989999promoter 内 763-774 bp - 3227 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 16984911-16986761(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCAC
SmilChr07G000821 Chr07 NC_080393.1:5790284-5790295promoter 内 704-715 bp - 3286 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 5793581-5795278(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAGC
SmilChr01G005393 Chr01 NC_080387.1:71205618-71205629promoter 内 645-656 bp - 3345 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 71208974-71214212(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTT
SmilChr03G003625 Chr03 NC_080389.1:54919034-54919045promoter 内 599-610 bp + 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 54922436-54923545(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCTC
SmilChr04G001365 Chr04 NC_080390.1:22172717-22172728promoter 内 598-609 bp + 3392 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 22167772-22169325(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCTT
SmilChr07G002746 Chr07 NC_080393.1:26987551-26987562promoter 内 435-446 bp - 3555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 26981319-26983996(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGGG
SmilChr07G003694 Chr07 NC_080393.1:44463914-44463925promoter 内 71-82 bp - 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44467844-44470825(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAGCTGTCCA
SmilChr04G002662 Chr04 NC_080390.1:42028012-42028023promoter 内 66-77 bp - 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 42023639-42024088(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTATG
SmilChr05G001413 Chr05 NC_080391.1:12753282-12753293promoter 内 3734-3745 bp - 256 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 4 12753549-12754367(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGT
SmilChr08G003437 Chr08 NC_080394.1:36660012-36660023promoter 内 323-334 bp - 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 4 36663690-36664259(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAGC
SmilChr07G003402 Chr07 NC_080393.1:36915129-36915140promoter 内 86-97 bp - 3904 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 4 36919044-36924500(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGT
SmilChr05G002064 Chr05 NC_080391.1:21502386-21502397promoter 内 3975-3986 bp + 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 21501875-21502371(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGT
SmilChr02G005094 Chr02 NC_080388.1:72513306-72513317promoter 内 659-670 bp + 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 72516648-72521259(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTATG
SmilChr02G004247 Chr02 NC_080388.1:64655652-64655663promoter 内 586-597 bp - 3404 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 64659067-64663174(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAA
SmilChr05G002564 Chr05 NC_080391.1:28810004-28810015promoter 内 3769-3780 bp + 221 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 28810236-28812665(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTATA
SmilChr05G003482 Chr05 NC_080391.1:46241810-46241821promoter 内 3755-3766 bp - 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 46242056-46242797(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCGA
SmilChr05G004090 Chr05 NC_080391.1:54743798-54743809promoter 内 3689-3700 bp + 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 54744110-54747337(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTA
SmilChr07G004180 Chr07 NC_080393.1:53745095-53745106promoter 内 3649-3660 bp - 341 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 53745447-53747042(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCGA
SmilChr01G003234 Chr01 NC_080387.1:51100027-51100038promoter 内 3624-3635 bp - 366 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 51098630-51099661(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGTT
SmilChr04G004013 Chr04 NC_080390.1:55424739-55424750promoter 内 3591-3602 bp - 399 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 55425149-55427025(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAG
SmilChr06G001318 Chr06 NC_080392.1:13697069-13697080promoter 内 3537-3548 bp - 453 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 13692284-13696616(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGTA
SmilChr02G000593 Chr02 NC_080388.1:8492459-8492470promoter 内 2982-2993 bp + 1008 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 8493478-8565262(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGGT
SmilChr07G004292 Chr07 NC_080393.1:55474723-55474734promoter 内 2841-2852 bp - 1149 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 55475883-55484554(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAA
SmilChr08G002440 Chr08 NC_080394.1:23233799-23233810promoter 内 2796-2807 bp + 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 23228186-23232605(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAGC
SmilChr01G003988 Chr01 NC_080387.1:58307123-58307134promoter 内 2733-2744 bp - 1257 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 58308391-58311924(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAG
SmilChr04G002404 Chr04 NC_080390.1:38575188-38575199promoter 内 2455-2466 bp + 1535 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 38576734-38627026(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGAA
SmilChr05G003483 Chr05 NC_080391.1:46241810-46241821promoter 内 2429-2440 bp - 1561 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 46243382-46243853(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCGA
SmilChr02G000805 Chr02 NC_080388.1:13427177-13427188promoter 内 2133-2144 bp - 1857 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 13425214-13425320(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGGT
SmilChr02G003634 Chr02 NC_080388.1:57687349-57687360promoter 内 1925-1936 bp + 2065 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 57677485-57685284(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCGA
SmilChr02G002088 Chr02 NC_080388.1:37475468-37475479promoter 内 1473-1484 bp - 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 37477996-37482236(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAA
SmilChr04G003439 Chr04 NC_080390.1:50932404-50932415promoter 内 1185-1196 bp - 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 50926055-50929599(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGTT
SmilChr03G000199 Chr03 NC_080389.1:2263526-2263537promoter 内 1180-1191 bp + 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 2266347-2275551(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTATT
SmilChr01G001901 Chr01 NC_080387.1:34121985-34121996promoter 内 910-921 bp - 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 34125076-34129264(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCGA
SmilChr08G000837 Chr08 NC_080394.1:6192704-6192715promoter 内 634-645 bp + 3356 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 6196071-6200182(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTACAGCTGTT
SmilChr03G001823 Chr03 NC_080389.1:24952040-24952051promoter 内 340-351 bp + 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 24946586-24948390(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAGA
SmilChr03G001825 Chr03 NC_080389.1:25003569-25003580promoter 内 3953-3964 bp + 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 25000658-25003532(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCGA
SmilChr07G000330 Chr07 NC_080393.1:2248918-2248929promoter 内 3940-3951 bp - 50 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 2244615-2248868(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGAA
SmilChr02G004246 Chr02 NC_080388.1:64655652-64655663promoter 内 3935-3946 bp - 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 64655718-64657732(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCAA
SmilChr02G001892 Chr02 NC_080388.1:34227474-34227485promoter 内 3747-3758 bp - 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 34227728-34230415(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTAGCTGTCGA