转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 62 / 149 下载 TSV

上一页 62 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000022 Chr06 NC_080392.1:265862-265872promoter 内 2608-2618 bp - 1383 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 262934-264479(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr02G005042 Chr02 NC_080388.1:72146766-72146776promoter 内 2606-2616 bp + 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 72142577-72145381(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAG
SmilChr07G003078 Chr07 NC_080393.1:32415712-32415722promoter 内 2600-2610 bp + 1391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32417113-32418853(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr04G002165 Chr04 NC_080390.1:34923655-34923665promoter 内 2584-2594 bp - 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34925072-34927779(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr02G004113 Chr02 NC_080388.1:63425282-63425292promoter 内 2579-2589 bp + 1412 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 63426704-63431794(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAA
SmilChr07G001594 Chr07 NC_080393.1:13221910-13221920promoter 内 2555-2565 bp + 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 13217975-13220474(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr07G002593 Chr07 NC_080393.1:24932486-24932496promoter 内 2516-2526 bp - 1475 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 24927043-24931011(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAA
SmilChr02G001195 Chr02 NC_080388.1:21985739-21985749promoter 内 2514-2524 bp + 1477 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 21987226-21988501(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr07G001730 Chr07 NC_080393.1:14718438-14718448promoter 内 2432-2442 bp - 1559 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 14720007-14720834(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGT
SmilChr03G004022 Chr03 NC_080389.1:59190863-59190873promoter 内 2403-2413 bp + 1588 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 59192461-59197626(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAA
SmilChr02G002607 Chr02 NC_080388.1:45239177-45239187promoter 内 2320-2330 bp + 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 45236292-45237506(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr03G003336 Chr03 NC_080389.1:51628853-51628863promoter 内 2274-2284 bp - 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 51624445-51627136(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGGGCTGTCA
SmilChr01G001758 Chr01 NC_080387.1:32296284-32296294promoter 内 2264-2274 bp + 1727 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32292214-32294557(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr07G002741 Chr07 NC_080393.1:26937984-26937994promoter 内 2264-2274 bp + 1727 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 26934749-26936257(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGT
SmilChr03G001659 Chr03 NC_080389.1:21536328-21536338promoter 内 2226-2236 bp - 1765 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 21534010-21534563(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr02G000555 Chr02 NC_080388.1:7814860-7814870promoter 内 2222-2232 bp + 1769 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 7816639-7818312(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCC
SmilChr06G000005 Chr06 NC_080392.1:148976-148986promoter 内 2182-2192 bp - 1809 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 150795-152295(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGA
SmilChr02G001122 Chr02 NC_080388.1:20267707-20267717promoter 内 2181-2191 bp + 1810 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 20269527-20272752(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAA
SmilChr01G004403 Chr01 NC_080387.1:62145499-62145509promoter 内 2153-2163 bp - 1838 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 62138438-62143661(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr04G002472 Chr04 NC_080390.1:39525147-39525157promoter 内 2141-2151 bp - 1850 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 39527007-39527561(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr02G000793 Chr02 NC_080388.1:13082611-13082621promoter 内 2068-2078 bp - 1923 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 13079223-13080688(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCGAGCTGTCT
SmilChr05G001743 Chr05 NC_080391.1:16892886-16892896promoter 内 2056-2066 bp + 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 16887824-16890951(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATG
SmilChr06G001443 Chr06 NC_080392.1:15265290-15265300promoter 内 2048-2058 bp - 1943 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 15261107-15263347(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr03G003771 Chr03 NC_080389.1:56849463-56849473promoter 内 2009-2019 bp - 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 56851455-56857112(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr04G000771 Chr04 NC_080390.1:9485547-9485557promoter 内 1972-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 9478174-9483528(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGA
SmilChr01G004253 Chr01 NC_080387.1:60821720-60821730promoter 内 1952-1962 bp - 2039 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 60823769-60824749(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGA
SmilChr04G002371 Chr04 NC_080390.1:38208901-38208911promoter 内 1907-1917 bp - 2084 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 38201250-38206817(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr07G001262 Chr07 NC_080393.1:9711452-9711462promoter 内 1889-1899 bp - 2102 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 9707670-9709350(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAA
SmilChr01G001356 Chr01 NC_080387.1:26825412-26825422promoter 内 1856-1866 bp + 2135 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 26827557-26828300(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr04G003359 Chr04 NC_080390.1:50188224-50188234promoter 内 1781-1791 bp - 2210 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 50190444-50193928(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGA
SmilChr01G005038 Chr01 NC_080387.1:68333439-68333449promoter 内 1771-1781 bp + 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 68327239-68331219(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr02G001524 Chr02 NC_080388.1:28369978-28369988promoter 内 1756-1766 bp - 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 28372223-28372725(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGA
SmilChr06G000024 Chr06 NC_080392.1:265862-265872promoter 内 1753-1763 bp - 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 268110-270508(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGA
SmilChr07G001477 Chr07 NC_080393.1:11620791-11620801promoter 内 1748-1758 bp + 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 11623044-11628360(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr04G003289 Chr04 NC_080390.1:49576364-49576374promoter 内 1746-1756 bp - 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 49571951-49574119(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr03G000084 Chr03 NC_080389.1:976602-976612promoter 内 1743-1753 bp + 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 973231-974354(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAT
SmilChr06G002612 Chr06 NC_080392.1:37568925-37568935promoter 内 1672-1682 bp + 2319 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 37565396-37566606(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCGA
SmilChr06G002395 Chr06 NC_080392.1:34736121-34736131promoter 内 1666-1676 bp + 2325 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34738456-34738914(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCC
SmilChr01G003046 Chr01 NC_080387.1:49440965-49440975promoter 内 1640-1650 bp - 2351 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 49443326-49448527(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCGC
SmilChr07G001859 Chr07 NC_080393.1:16118090-16118100promoter 内 1638-1648 bp + 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 16112381-16115737(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGA
SmilChr04G000965 Chr04 NC_080390.1:12893749-12893759promoter 内 1627-1637 bp + 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 12890777-12891385(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGA
SmilChr01G003753 Chr01 NC_080387.1:55908370-55908380promoter 内 1622-1632 bp + 2369 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 55910749-55913422(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCGAGCTGTCT
SmilChr05G002620 Chr05 NC_080391.1:29511601-29511611promoter 内 1605-1615 bp + 2386 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 29513997-29514527(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCA
SmilChr01G005713 Chr01 NC_080387.1:73347956-73347966promoter 内 1595-1605 bp + 2396 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 73341651-73345560(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTT
SmilChr03G001658 Chr03 NC_080389.1:21536328-21536338promoter 内 1578-1588 bp - 2413 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 21533286-21533915(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCG
SmilChr04G000811 Chr04 NC_080390.1:10129519-10129529promoter 内 1562-1572 bp - 2429 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 10131958-10141812(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGT
SmilChr03G003286 Chr03 NC_080389.1:50932349-50932359promoter 内 1530-1540 bp - 2461 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 50934820-50935836(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGGA
SmilChr06G002393 Chr06 NC_080392.1:34723947-34723957promoter 内 1503-1513 bp + 2488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34726445-34727200(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTCC
SmilChr03G000146 Chr03 NC_080389.1:1610287-1610297promoter 内 1485-1495 bp - 2506 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 1602765-1607781(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCA
SmilChr01G005334 Chr01 NC_080387.1:70546605-70546615promoter 内 1475-1485 bp - 2516 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 70542168-70544089(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGGGCTGTCA