转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002803; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020702-RA_Salv SmilChr07G002803 NAC XP_057777238.1 MP00221 ACACGTAACTT

可能结合的靶基因

9903 个结合位点 7965 个候选靶基因 第 63 / 160 下载 TSV

上一页 63 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004117 Chr01 NC_080387.1:59692148-59692158promoter 内 1566-1576 bp - 2425 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59688754-59689723(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAATTT
SmilChr01G005698 Chr01 NC_080387.1:73241962-73241972promoter 内 1539-1549 bp + 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 73244424-73246790(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAAACT
SmilChr03G000069 Chr03 NC_080389.1:819303-819313promoter 内 1529-1539 bp - 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 821775-824790(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AACATACGTGT
SmilChr04G003742 Chr04 NC_080390.1:53724492-53724502promoter 内 1517-1527 bp - 2474 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 53719059-53722018(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAAACT
SmilChr02G005233 Chr02 NC_080388.1:73536472-73536482promoter 内 1478-1488 bp + 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 73532384-73533959(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CAAATACGTGT
SmilChr05G000711 Chr05 NC_080391.1:5372579-5372589promoter 内 1457-1467 bp + 2534 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 5375123-5377597(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAATAT
SmilChr03G004684 Chr03 NC_080389.1:64252904-64252914promoter 内 1450-1460 bp - 2541 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 64249254-64250363(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAATAT
SmilChr03G003959 Chr03 NC_080389.1:58634494-58634504promoter 内 1449-1459 bp - 2542 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 58637046-58638175(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAATTACGTGG
SmilChr05G003847 Chr05 NC_080391.1:51917556-51917566promoter 内 1413-1423 bp - 2578 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 51907305-51914978(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAATAT
SmilChr04G004127 Chr04 NC_080390.1:56103510-56103520promoter 内 1410-1420 bp + 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 56106101-56108163(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAATAT
SmilChr04G003263 Chr04 NC_080390.1:49362416-49362426promoter 内 1382-1392 bp + 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 49359417-49359807(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ATATTACGTGT
SmilChr02G003244 Chr02 NC_080388.1:53703406-53703416promoter 内 1321-1331 bp - 2670 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 53706086-53708424(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CAAATACGTGT
SmilChr04G003955 Chr04 NC_080390.1:55099020-55099030promoter 内 1274-1284 bp + 2717 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 55101747-55102630(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAATAT
SmilChr05G000205 Chr05 NC_080391.1:1632668-1632678promoter 内 1261-1271 bp + 2730 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1625450-1629938(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGTTTACGTGA
SmilChr01G003365 Chr01 NC_080387.1:52399884-52399894promoter 内 1248-1258 bp + 2743 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 52389794-52397141(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AACATACGTGT
SmilChr04G002100 Chr04 NC_080390.1:33895607-33895617promoter 内 1226-1236 bp + 2765 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 33892421-33892842(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAATTACGTGG
SmilChr03G002304 Chr03 NC_080389.1:36270595-36270605promoter 内 1213-1223 bp - 2778 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 36273383-36273455(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAATTACGTGG
SmilChr03G000678 Chr03 NC_080389.1:7559531-7559541promoter 内 1130-1140 bp - 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7562402-7566253(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ATATTACGTGT
SmilChr03G003571 Chr03 NC_080389.1:54365601-54365611promoter 内 1113-1123 bp - 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54360081-54362723(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAATTT
SmilChr03G003573 Chr03 NC_080389.1:54371659-54371669promoter 内 1113-1123 bp - 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54366137-54368781(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAATTT
SmilChr02G004397 Chr02 NC_080388.1:66323281-66323291promoter 内 1094-1104 bp + 2897 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 66326188-66327944(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAATAT
SmilChr03G003630 Chr03 NC_080389.1:54969918-54969928promoter 内 1081-1091 bp + 2910 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54972838-54974617(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAATTT
SmilChr05G002022 Chr05 NC_080391.1:20968366-20968376promoter 内 1059-1069 bp - 2932 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 20971308-20976091(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AACATACGTGT
SmilChr03G001091 Chr03 NC_080389.1:12609796-12609806promoter 内 998-1008 bp + 2993 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 12612799-12615022(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATGTT
SmilChr04G001120 Chr04 NC_080390.1:16256978-16256988promoter 内 982-992 bp + 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 16252777-16253969(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AACATACGTGT
SmilChr02G002045 Chr02 NC_080388.1:36833647-36833657promoter 内 966-976 bp - 3025 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 36829845-36830622(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAAACT
SmilChr01G003009 Chr01 NC_080387.1:49131327-49131337promoter 内 860-870 bp - 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 49127526-49128196(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAAACT
SmilChr05G001789 Chr05 NC_080391.1:17612024-17612034promoter 内 847-857 bp - 3144 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 17607414-17608880(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTTG
SmilChr05G003218 Chr05 NC_080391.1:41280139-41280149promoter 内 809-819 bp + 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 41283331-41285020(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTTG
SmilChr04G003889 Chr04 NC_080390.1:54690058-54690068promoter 内 796-806 bp - 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54693263-54697665(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CAAATACGTGT
SmilChr01G005156 Chr01 NC_080387.1:69335768-69335778promoter 内 783-793 bp - 3208 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 69327137-69332560(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTTG
SmilChr06G000280 Chr06 NC_080392.1:1933937-1933947promoter 内 767-777 bp + 3224 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1929024-1930713(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CAAATACGTGT
SmilChr02G000411 Chr02 NC_080388.1:5157071-5157081promoter 内 711-721 bp - 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 5160361-5161098(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CAAATACGTGT
SmilChr03G004026 Chr03 NC_080389.1:59241042-59241052promoter 内 635-645 bp + 3356 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59244408-59253458(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAATAT
SmilChr02G000511 Chr02 NC_080388.1:7058876-7058886promoter 内 619-629 bp - 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 7054746-7055504(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAAACT
SmilChr05G002700 Chr05 NC_080391.1:30972371-30972381promoter 内 618-628 bp + 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 30975754-30978266(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAATAT
SmilChr05G000182 Chr05 NC_080391.1:1446445-1446455promoter 内 541-551 bp + 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1449905-1453013(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAATTT
SmilChr01G002706 Chr01 NC_080387.1:45346358-45346368promoter 内 500-510 bp - 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 45324190-45342867(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTTG
SmilChr03G003422 Chr03 NC_080389.1:52556331-52556341promoter 内 384-394 bp - 3607 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 52551948-52552724(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTTG
SmilChr03G001845 Chr03 NC_080389.1:25344828-25344838promoter 内 260-270 bp - 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 25348569-25351888(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AACATACGTGT
SmilChr04G001722 Chr04 NC_080390.1:28487373-28487383promoter 内 220-230 bp - 3771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 28482472-28483602(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAATTT
SmilChr01G002874 Chr01 NC_080387.1:47339212-47339222promoter 内 161-171 bp - 3830 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 47334007-47335382(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATGTT
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SmilChr05G002328 Chr05 NC_080391.1:25133685-25133695promoter 内 3470-3480 bp + 521 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 25134216-25139725(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAATTC
SmilChr03G000328 Chr03 NC_080389.1:3741464-3741474promoter 内 2579-2589 bp + 1412 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 3738629-3740052(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGAATACGTGT
SmilChr03G002264 Chr03 NC_080389.1:35647517-35647527promoter 内 1316-1326 bp - 2675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 35641720-35644842(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCACGTAATTA
SmilChr02G005436 Chr02 NC_080388.1:74767031-74767041promoter 内 1263-1273 bp + 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 74769769-74777238(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCACGTAATTA
SmilChr05G000727 Chr05 NC_080391.1:5554011-5554021promoter 内 1045-1055 bp - 2946 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 3 5556967-5558091(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGAATACGTGT