转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G003267; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00018221-RA_Salv SmilChr08G003267 MYB XP_057779249.1 MP00406 AAAAAATTAGGTAAA

可能结合的靶基因

9917 个结合位点 7839 个候选靶基因 第 63 / 157 下载 TSV

上一页 63 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002901 Chr02 NC_080388.1:49302684-49302698promoter 内 1007-1021 bp + 2980 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 49292824-49299704(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTGCCTAATTTTTG
SmilChr05G000532 Chr05 NC_080391.1:4076624-4076638promoter 内 892-906 bp - 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 4072232-4073529(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATTAATTAGGTCCC
SmilChr01G003354 Chr01 NC_080387.1:52298404-52298418promoter 内 389-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 52291283-52294806(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCACCTAATATACT
SmilChr02G004511 Chr02 NC_080388.1:67643474-67643488promoter 内 343-357 bp + 3644 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 67638530-67639830(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TAGACCTAATATACT
SmilChr03G000744 Chr03 NC_080389.1:8486530-8486544promoter 内 279-293 bp + 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 8480356-8482822(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AACACCTAATTTATG
SmilChr02G001646 Chr02 NC_080388.1:30545144-30545158promoter 内 247-261 bp + 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 30531452-30541404(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CACACCTAATTTGTG
SmilChr03G004454 Chr03 NC_080389.1:62659316-62659330promoter 内 223-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 62654128-62655552(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTGCCTAATTTTTG
SmilChr03G000757 Chr03 NC_080389.1:8640836-8640850promoter 内 171-185 bp - 3816 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 8644666-8646235(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ACAACCTAATTTTTG
SmilChr02G004793 Chr02 NC_080388.1:70131633-70131647promoter 内 3983-3997 bp + 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 70129818-70131629(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATAACCTAATTTTCT
SmilChr02G004536 Chr02 NC_080388.1:67938993-67939007promoter 内 3953-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 67930185-67938959(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATGACCTAATATTCG
SmilChr02G000710 Chr02 NC_080388.1:11457060-11457074promoter 内 3952-3966 bp + 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 11455871-11457025(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AGTACCTAATTTGCA
SmilChr04G002956 Chr04 NC_080390.1:45904137-45904151promoter 内 3873-3887 bp - 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 45904265-45908564(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CGTACCTAACAATAA
SmilChr01G000540 Chr01 NC_080387.1:11112796-11112810promoter 内 3866-3880 bp - 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 11112931-11117794(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTGACCTAATTAAGG
SmilChr01G004098 Chr01 NC_080387.1:59439830-59439844promoter 内 3823-3837 bp + 164 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 59440008-59447385(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CAAAAATTAGGTTGT
SmilChr04G003594 Chr04 NC_080390.1:52368925-52368939promoter 内 3755-3769 bp - 232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52369171-52376162(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATACCTAATAAAAT
SmilChr01G000762 Chr01 NC_080387.1:16678203-16678217promoter 内 3741-3755 bp - 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 16676500-16677957(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CATAATTTAGGTAAA
SmilChr02G004941 Chr02 NC_080388.1:72349893-72349907promoter 内 3709-3723 bp - 278 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 71365587-72349615(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GAGAAATTAGGTTCG
SmilChr05G001917 Chr05 NC_080391.1:19430636-19430650promoter 内 3698-3712 bp + 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 19430939-19433423(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGAAAATTAGGTTAC
SmilChr03G002237 Chr03 NC_080389.1:35251791-35251805promoter 内 3637-3651 bp + 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 35249368-35251441(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATCACCTAATTTGTT
SmilChr02G004304 Chr02 NC_080388.1:65423916-65423930promoter 内 3615-3629 bp - 372 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 65424302-65430699(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CTGACCTAATAATGT
SmilChr03G004707 Chr03 NC_080389.1:64344354-64344368promoter 内 3604-3618 bp - 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 64344751-64348496(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CTAACCTAATTTTAA
SmilChr02G005313 Chr02 NC_080388.1:74018431-74018445promoter 内 3601-3615 bp + 386 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 74015848-74018045(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTGCCTAATTTTTG
SmilChr01G002938 Chr01 NC_080387.1:48157947-48157961promoter 内 3578-3592 bp + 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 48158370-48164782(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TACTAGTTAGGTAGC
SmilChr05G000579 Chr05 NC_080391.1:4353247-4353261promoter 内 3560-3574 bp - 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 4353688-4357366(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATCACCTAATTTGTT
SmilChr04G002608 Chr04 NC_080390.1:41492970-41492984promoter 内 3553-3567 bp - 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 41491702-41492536(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATAAAATTAGGCATA
SmilChr04G002421 Chr04 NC_080390.1:38846414-38846428promoter 内 3347-3361 bp - 640 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 38838648-38845774(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCAAATTAGGTCAA
SmilChr03G004154 Chr03 NC_080389.1:60336440-60336454promoter 内 3328-3342 bp + 659 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 60330852-60335781(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AAGACCTAATATTTA
SmilChr02G000711 Chr02 NC_080388.1:11457060-11457074promoter 内 3289-3303 bp + 698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 11457772-11472778(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TGCAAATTAGGTACT
SmilChr03G004155 Chr03 NC_080389.1:60336440-60336454promoter 内 3272-3286 bp + 715 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 60337169-60341245(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TAAATATTAGGTCTT
SmilChr02G000180 Chr02 NC_080388.1:2299867-2299881promoter 内 3178-3192 bp + 809 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 2300690-2304986(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCAAAATTAGGTTAG
SmilChr02G000177 Chr02 NC_080388.1:2265791-2265805promoter 内 3029-3043 bp - 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 2266763-2270938(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGTACCTAACTTGAG
SmilChr03G002432 Chr03 NC_080389.1:38625262-38625276promoter 内 3003-3017 bp - 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 38626260-38630452(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGTACCTAACTTGAG
SmilChr05G003535 Chr05 NC_080391.1:47216794-47216808promoter 内 2822-2836 bp - 1165 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 47217973-47221756(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGTACCTAACTTGAG
SmilChr01G002629 Chr01 NC_080387.1:44594033-44594047promoter 内 2808-2822 bp + 1179 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 44595226-44600028(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CAAAAATTAGGCAAT
SmilChr03G003685 Chr03 NC_080389.1:55709178-55709192promoter 内 2800-2814 bp - 1187 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 55707074-55707991(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CAAAAATTAGGCAAT
SmilChr01G003466 Chr01 NC_080387.1:53227132-53227146promoter 内 2740-2754 bp - 1247 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 53228393-53230198(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTGACCTAATTAAAG
SmilChr05G001672 Chr05 NC_080391.1:15852819-15852833promoter 内 2690-2704 bp - 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 15854130-15855545(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTGCCTAATTTTTG
SmilChr03G001223 Chr03 NC_080389.1:14096527-14096541promoter 内 2649-2663 bp - 1338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 14097879-14100533(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CTGACCTAATTAACA
SmilChr01G000462 Chr01 NC_080387.1:9472640-9472654promoter 内 2584-2598 bp + 1403 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 9461883-9471237(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CACACCTAATTTAGG
SmilChr05G002708 Chr05 NC_080391.1:31128282-31128296promoter 内 2537-2551 bp + 1450 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 31123141-31126832(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGTACCTAACTTGAG
SmilChr01G005294 Chr01 NC_080387.1:70265520-70265534promoter 内 2526-2540 bp - 1461 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 70266995-70270703(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGTACCTAACTTGAG
SmilChr02G003570 Chr02 NC_080388.1:56865173-56865187promoter 内 2459-2473 bp - 1528 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 56866715-56870048(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGTACCTAACTTGAG
SmilChr04G003859 Chr04 NC_080390.1:54530189-54530203promoter 内 2422-2436 bp - 1565 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 54526297-54528624(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATATATTAGGTCCA
SmilChr05G002414 Chr05 NC_080391.1:26674831-26674845promoter 内 2417-2431 bp - 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 26676415-26679935(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGTACCTAACTTGAG
SmilChr02G001401 Chr02 NC_080388.1:26594803-26594817promoter 内 2407-2421 bp - 1580 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 26591744-26593223(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CAATTATTAGGTCCA
SmilChr01G000012 Chr01 NC_080387.1:276194-276208promoter 内 2392-2406 bp + 1595 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 271082-274599(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGTACCTAACTTGAG
SmilChr01G000926 Chr01 NC_080387.1:19643137-19643151promoter 内 2381-2395 bp - 1606 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 19638550-19641531(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CAAAAATTAGGCAAT
SmilChr02G001032 Chr02 NC_080388.1:18263340-18263354promoter 内 2349-2363 bp - 1638 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 18264992-18268102(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGTACCTAACTTGAG
SmilChr03G001079 Chr03 NC_080389.1:12478999-12479013promoter 内 2316-2330 bp + 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 12480684-12481652(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TAGAAATTAGGTTGA
SmilChr03G001242 Chr03 NC_080389.1:14314491-14314505promoter 内 2264-2278 bp + 1723 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 14309318-14312768(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GGTACCTAACTTGAG