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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005217; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006334-RA_Salv SmilChr02G005217 G2-like XP_057792502.1 MP00022 GAGAATCTGT

可能结合的靶基因

9720 个结合位点 6959 个候选靶基因 第 65 / 140 下载 TSV

上一页 65 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005451 Chr01 NC_080387.1:71571755-71571764promoter 内 1469-1478 bp + 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 71563624-71569232(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr03G001465 Chr03 NC_080389.1:17521648-17521657promoter 内 1446-1455 bp + 2546 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 17524203-17528286(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAA
SmilChr01G001588 Chr01 NC_080387.1:29906789-29906798promoter 内 1368-1377 bp + 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 29909422-29911316(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAA
SmilChr01G001019 Chr01 NC_080387.1:21357258-21357267promoter 内 1277-1286 bp + 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 21359982-21363226(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAA
SmilChr03G001449 Chr03 NC_080389.1:17290073-17290082promoter 内 1273-1282 bp + 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 17279033-17287354(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TTAGATTCTC
SmilChr02G001280 Chr02 NC_080388.1:23643157-23643166promoter 内 1185-1194 bp - 2807 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 23639688-23640350(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCG
SmilChr01G003956 Chr01 NC_080387.1:57937591-57937600promoter 内 1179-1188 bp + 2813 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 57940413-57941153(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAA
SmilChr01G005824 Chr01 NC_080387.1:74237339-74237348promoter 内 1133-1142 bp + 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 74240207-74241430(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCG
SmilChr03G003504 Chr03 NC_080389.1:53655965-53655974promoter 内 1067-1076 bp + 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 53647339-53653040(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr02G002350 Chr02 NC_080388.1:41265281-41265290promoter 内 794-803 bp - 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 41268488-41273790(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr03G003042 Chr03 NC_080389.1:47319710-47319719promoter 内 755-764 bp - 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 47322956-47324529(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TTAGATTCTC
SmilChr01G003608 Chr01 NC_080387.1:54640659-54640668promoter 内 691-700 bp + 3301 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 54633004-54637358(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr03G002434 Chr03 NC_080389.1:38671198-38671207promoter 内 683-692 bp - 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 38665392-38667889(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAA
SmilChr02G000691 Chr02 NC_080388.1:11014769-11014778promoter 内 676-685 bp + 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 11010617-11011453(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr02G001016 Chr02 NC_080388.1:17926525-17926534promoter 内 676-685 bp + 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 17922322-17923209(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr01G001871 Chr01 NC_080387.1:33737952-33737961promoter 内 668-677 bp + 3324 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 33733246-33734628(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr01G006062 Chr01 NC_080387.1:76049939-76049948promoter 内 622-631 bp + 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 76053318-76053403(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAA
SmilChr03G002287 Chr03 NC_080389.1:36073515-36073524promoter 内 425-434 bp + 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 36067534-36069948(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr03G004501 Chr03 NC_080389.1:63127220-63127229promoter 内 243-252 bp - 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 63122527-63123471(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCG
SmilChr02G001970 Chr02 NC_080388.1:35659413-35659422promoter 内 44-53 bp - 3948 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 35655041-35655465(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCG
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SmilChr02G001021 Chr02 NC_080388.1:18037462-18037471promoter 内 3911-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 18031757-18037381(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr03G000485 Chr03 NC_080389.1:5175292-5175301promoter 内 3908-3917 bp + 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5175385-5177046(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCG
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SmilChr01G001076 Chr01 NC_080387.1:22170224-22170233promoter 内 3776-3785 bp + 216 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22168311-22170008(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TTAGATTCTC
SmilChr04G000510 Chr04 NC_080390.1:5598974-5598983promoter 内 3687-3696 bp - 305 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5595143-5598669(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAA
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SmilChr02G005047 Chr02 NC_080388.1:72214027-72214036promoter 内 3652-3661 bp - 340 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72214376-72218282(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr03G003680 Chr03 NC_080389.1:55645909-55645918promoter 内 3623-3632 bp - 369 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55638716-55645540(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAA
SmilChr03G000756 Chr03 NC_080389.1:8643713-8643722promoter 内 3619-3628 bp + 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 8641850-8643340(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr02G005448 Chr02 NC_080388.1:74843007-74843016promoter 内 3596-3605 bp + 396 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 74838279-74842611(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr01G001078 Chr01 NC_080387.1:22220051-22220060promoter 内 3590-3599 bp - 402 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22215795-22219649(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCG
SmilChr02G000845 Chr02 NC_080388.1:14346764-14346773promoter 内 3523-3532 bp + 469 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14347242-14350397(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAA
SmilChr03G004249 Chr03 NC_080389.1:60971023-60971032promoter 内 3507-3516 bp + 485 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 60971517-60975668(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTAA
SmilChr03G001644 Chr03 NC_080389.1:21262509-21262518promoter 内 3502-3511 bp - 490 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 21263008-21266767(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr03G001646 Chr03 NC_080389.1:21291951-21291960promoter 内 3493-3502 bp - 499 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 21292459-21296212(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
SmilChr02G002590 Chr02 NC_080388.1:45018746-45018755promoter 内 3491-3500 bp - 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 45019256-45020461(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TTAGATTCTC
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SmilChr02G002821 Chr02 NC_080388.1:48309316-48309325promoter 内 3361-3370 bp + 631 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 48309956-48312817(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCG
SmilChr01G004064 Chr01 NC_080387.1:59058499-59058508promoter 内 3354-3363 bp + 638 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 59050577-59057861(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TTAGATTCTC
SmilChr03G004136 Chr03 NC_080389.1:60215237-60215246promoter 内 3313-3322 bp + 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 60211197-60214558(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CGAGATTCTC
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SmilChr01G002437 Chr01 NC_080387.1:41964070-41964079promoter 内 3257-3266 bp + 735 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41959720-41963335(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 TTAGATTCTC
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SmilChr01G004316 Chr01 NC_080387.1:61349593-61349602promoter 内 3243-3252 bp - 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 61331580-61348844(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCG
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SmilChr03G001574 Chr03 NC_080389.1:19868453-19868462promoter 内 3189-3198 bp + 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 19869265-19870366(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCG
SmilChr03G002623 Chr03 NC_080389.1:41634216-41634225promoter 内 3110-3119 bp - 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41630946-41633334(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTCG