转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 66 / 137 下载 TSV

上一页 66 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003761 Chr02 NC_080388.1:59288398-59288412promoter 内 2530-2544 bp + 1457 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 59289869-59293995(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGAAACTT
SmilChr04G000273 Chr04 NC_080390.1:2529033-2529047promoter 内 2381-2395 bp + 1606 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 2517537-2527427(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCGGCCACGTGGCT
SmilChr07G001007 Chr07 NC_080393.1:7328825-7328839promoter 内 2180-2194 bp + 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 7330646-7332974(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTCCACGTCAGCGGA
SmilChr01G005904 Chr01 NC_080387.1:74923250-74923264promoter 内 2015-2029 bp - 1972 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 74919083-74921278(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGACACGTCATCCAA
SmilChr01G005912 Chr01 NC_080387.1:74967977-74967991promoter 内 1929-1943 bp - 2058 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 74964568-74965919(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGACACGTCATCCAA
SmilChr08G000818 Chr08 NC_080394.1:6040196-6040210promoter 内 1740-1754 bp - 2247 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 6033185-6037949(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGTTGCC
SmilChr07G004076 Chr07 NC_080393.1:52218941-52218955promoter 内 1476-1490 bp + 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 52213855-52216430(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGTGGTGACGTGTAA
SmilChr08G002326 Chr08 NC_080394.1:21930519-21930533promoter 内 1428-1442 bp + 2559 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 21933092-21934625(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGCCGAA
SmilChr06G000559 Chr06 NC_080392.1:4773648-4773662promoter 内 1245-1259 bp + 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 4776404-4777609(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGGCCGG
SmilChr01G002538 Chr01 NC_080387.1:43444521-43444535promoter 内 1218-1232 bp + 2769 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 43439739-43441752(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCTAGCCACGTGGCG
SmilChr03G002104 Chr03 NC_080389.1:32763881-32763895promoter 内 565-579 bp - 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 32760324-32760459(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGCTCCA
SmilChr08G004963 Chr08 NC_080394.1:58437770-58437784promoter 内 565-579 bp + 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 58441206-58443127(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCATTTCG
SmilChr08G003922 Chr08 NC_080394.1:46709616-46709630promoter 内 507-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 46713110-46713215(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGATCAGACGTGGCT
SmilChr01G005911 Chr01 NC_080387.1:74967977-74967991promoter 内 482-496 bp - 3505 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 74963277-74964472(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGACACGTCATCCAA
SmilChr03G003262 Chr03 NC_080389.1:50537769-50537783promoter 内 20-34 bp - 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 50541750-50544835(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CACGAACACGTGGCA
SmilChr01G003643 Chr01 NC_080387.1:54923407-54923421promoter 内 3978-3992 bp - 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 54923430-54924421(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTGTAACACGTGGCA
SmilChr07G000069 Chr07 NC_080393.1:327032-327046promoter 内 3931-3945 bp - 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 323572-326976(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGACACGTCATCCAA
SmilChr08G000819 Chr08 NC_080394.1:6040196-6040210promoter 内 3928-3942 bp - 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 6040269-6041373(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCAACGACGTGGCA
SmilChr07G002091 Chr07 NC_080393.1:19024849-19024863promoter 内 3902-3916 bp - 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 19022989-19024764(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGATCTGA
SmilChr04G003485 Chr04 NC_080390.1:51304390-51304404promoter 内 3893-3907 bp + 94 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51304498-51308761(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGATACC
SmilChr08G001485 Chr08 NC_080394.1:11960578-11960592promoter 内 3881-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 11960698-11963284(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTGGCTGACGTGGAT
SmilChr01G000799 Chr01 NC_080387.1:17281155-17281169promoter 内 3839-3853 bp + 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 17278698-17281007(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAGTCTACGTGGCA
SmilChr03G002664 Chr03 NC_080389.1:42300046-42300060promoter 内 3826-3840 bp - 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 42300221-42301075(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TATGCCTACGTGGCT
SmilChr04G002308 Chr04 NC_080390.1:37385614-37385628promoter 内 3824-3838 bp - 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 37381808-37385451(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGAGAC
SmilChr01G001636 Chr01 NC_080387.1:30405823-30405837promoter 内 3819-3833 bp + 168 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30406005-30409798(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGACGAAT
SmilChr01G000754 Chr01 NC_080387.1:16623386-16623400promoter 内 3781-3795 bp - 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 16616861-16623180(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGACTCC
SmilChr01G000800 Chr01 NC_080387.1:17281155-17281169promoter 内 3781-3795 bp + 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 17281375-17287044(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGACTCC
SmilChr05G000691 Chr05 NC_080391.1:5231206-5231220promoter 内 3762-3776 bp + 225 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5231445-5234476(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGAGTTGG
SmilChr08G000447 Chr08 NC_080394.1:3187111-3187125promoter 内 3744-3758 bp - 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3184483-3186868(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGAAATAT
SmilChr03G004672 Chr03 NC_080389.1:64170637-64170651promoter 内 3701-3715 bp - 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 64170937-64175344(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TATTATTACGTGGCA
SmilChr01G005876 Chr01 NC_080387.1:74708745-74708759promoter 内 3594-3608 bp - 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 74707107-74708352(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCTTAACC
SmilChr04G000794 Chr04 NC_080390.1:9813155-9813169promoter 内 3573-3587 bp + 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 9813583-9816042(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGACACGTCACACAC
SmilChr06G002808 Chr06 NC_080392.1:40782286-40782300promoter 内 3573-3587 bp + 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 40782714-40783768(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTGAGTATT
SmilChr06G000695 Chr06 NC_080392.1:6168796-6168810promoter 内 3565-3579 bp - 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 6169232-6171275(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATAACAGACGTGGCA
SmilChr02G002489 Chr02 NC_080388.1:43302558-43302572promoter 内 3444-3458 bp - 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 43301248-43302015(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTATCCCAT
SmilChr03G002212 Chr03 NC_080389.1:34872914-34872928promoter 内 3429-3443 bp + 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 34871400-34872356(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTAGTTGACGTGGAA
SmilChr01G000702 Chr01 NC_080387.1:15746742-15746756promoter 内 3403-3417 bp - 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 15745337-15746158(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCTGCACC
SmilChr01G005583 Chr01 NC_080387.1:72529091-72529105promoter 内 3282-3296 bp - 705 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 72527807-72528386(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCGGCGCC
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SmilChr03G000801 Chr03 NC_080389.1:9177005-9177019promoter 内 3152-3166 bp - 835 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 9176064-9176170(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGAAATTA
SmilChr01G004399 Chr01 NC_080387.1:62122343-62122357promoter 内 2881-2895 bp - 1106 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 62123463-62125691(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACGTGACACGTGGCA
SmilChr05G002061 Chr05 NC_080391.1:21482138-21482152promoter 内 2871-2885 bp + 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 21475153-21481022(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTCGTCACGTGGCG
SmilChr08G000106 Chr08 NC_080394.1:654933-654947promoter 内 2824-2838 bp - 1163 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 648931-653770(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTAACCCCA
SmilChr06G001735 Chr06 NC_080392.1:20017021-20017035promoter 内 2765-2779 bp - 1222 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 20011098-20015799(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCATAACT
SmilChr05G001541 Chr05 NC_080391.1:14118435-14118449promoter 内 2630-2644 bp + 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 14119806-14124876(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCATATTC
SmilChr08G002034 Chr08 NC_080394.1:18123985-18123999promoter 内 2628-2642 bp - 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 18118717-18122626(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTATTCATT
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SmilChr08G000376 Chr08 NC_080394.1:2620058-2620072promoter 内 2545-2559 bp + 1442 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2621514-2622773(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCATTTCG
SmilChr08G003792 Chr08 NC_080394.1:43826975-43826989promoter 内 2517-2531 bp - 1470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 43828459-43829330(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CCCTCTGACGTGGCC
SmilChr08G003793 Chr08 NC_080394.1:43833693-43833707promoter 内 2516-2530 bp + 1471 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 43831351-43832222(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CCCTCTGACGTGGCC