转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 66 / 138 下载 TSV

上一页 66 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001713 Chr02 NC_080388.1:31519850-31519862promoter 内 3896-3908 bp - 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 31519955-31524235(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAAACC
SmilChr01G004104 Chr01 NC_080387.1:59552215-59552227promoter 内 3866-3878 bp - 123 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 59542606-59552092(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTGTT
SmilChr02G002645 Chr02 NC_080388.1:45843079-45843091promoter 内 3847-3859 bp + 142 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 45839201-45842937(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAAGTCAACAAT
SmilChr03G002616 Chr03 NC_080389.1:41567504-41567516promoter 内 3833-3845 bp + 156 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 41563902-41567348(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTAAGTCAACATC
SmilChr03G003665 Chr03 NC_080389.1:55496073-55496085promoter 内 3828-3840 bp + 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55493349-55495912(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACAAA
SmilChr03G004120 Chr03 NC_080389.1:60072789-60072801promoter 内 3813-3825 bp + 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60070425-60072613(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCAGTCAACTGT
SmilChr01G000670 Chr01 NC_080387.1:14835932-14835944promoter 内 3795-3807 bp + 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14835325-14835738(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAAGTCAACTAC
SmilChr01G000548 Chr01 NC_080387.1:11346964-11346976promoter 内 3787-3799 bp - 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 11347178-11347583(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAAGTCAACTAC
SmilChr01G005195 Chr01 NC_080387.1:69635743-69635755promoter 内 3727-3739 bp + 262 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 69636017-69645047(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGGTTGACTTCA
SmilChr01G004137 Chr01 NC_080387.1:59883749-59883761promoter 内 3722-3734 bp - 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 59881414-59883482(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTTTT
SmilChr03G001623 Chr03 NC_080389.1:20827586-20827598promoter 内 3666-3678 bp - 323 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 20825715-20827263(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTATA
SmilChr01G002878 Chr01 NC_080387.1:47380697-47380709promoter 内 3592-3604 bp + 397 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 47381106-47389482(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTAGTTGACTTGT
SmilChr02G000112 Chr02 NC_080388.1:1427838-1427850promoter 内 3544-3556 bp - 445 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 1426595-1427393(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATGTTGACTTAA
SmilChr01G002073 Chr01 NC_080387.1:36634182-36634194promoter 内 3449-3461 bp + 540 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36630279-36633642(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACAGTCAACAAA
SmilChr01G000349 Chr01 NC_080387.1:7167081-7167093promoter 内 3368-3380 bp + 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 7167714-7170836(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTATA
SmilChr01G002110 Chr01 NC_080387.1:37155740-37155752promoter 内 3367-3379 bp - 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 37152762-37155118(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGGGTTGACTACA
SmilChr02G002816 Chr02 NC_080388.1:48272359-48272371promoter 内 3365-3377 bp + 624 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 48266258-48271735(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCAGTCAACAAA
SmilChr03G004020 Chr03 NC_080389.1:59184139-59184151promoter 内 3297-3309 bp - 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 59184843-59189099(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTCAGTCAACTGT
SmilChr02G002173 Chr02 NC_080388.1:38957320-38957332promoter 内 3230-3242 bp + 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38956013-38956561(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAAAAGC
SmilChr01G003566 Chr01 NC_080387.1:54244531-54244543promoter 内 3182-3194 bp - 807 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 54242166-54243724(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTATA
SmilChr01G003815 Chr01 NC_080387.1:56525156-56525168promoter 内 3141-3153 bp + 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 56522984-56524308(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAAAAGC
SmilChr01G002758 Chr01 NC_080387.1:45923858-45923870promoter 内 2839-2851 bp - 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 45921453-45922708(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTTGA
SmilChr01G001519 Chr01 NC_080387.1:29109134-29109146promoter 内 2768-2780 bp + 1221 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 29104984-29107913(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATAGTCAACTCT
SmilChr01G005393 Chr01 NC_080387.1:71207713-71207725promoter 内 2740-2752 bp - 1249 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 71208974-71214212(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCGAGTCAACACC
SmilChr03G002214 Chr03 NC_080389.1:34896500-34896512promoter 内 2707-2719 bp - 1282 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 34897794-34899346(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGAGTCAACACC
SmilChr02G000854 Chr02 NC_080388.1:14549337-14549349promoter 内 2629-2641 bp + 1360 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14546214-14547977(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTAGTCAACATG
SmilChr02G002547 Chr02 NC_080388.1:44321278-44321290promoter 内 2587-2599 bp - 1402 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 44322692-44324379(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAAGTCAACAAA
SmilChr01G002237 Chr01 NC_080387.1:38915614-38915626promoter 内 2582-2594 bp + 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38917033-38919220(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCGGTTGACTCAT
SmilChr01G002847 Chr01 NC_080387.1:47039893-47039905promoter 内 2558-2570 bp - 1431 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 47035908-47038462(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTTTT
SmilChr02G005443 Chr02 NC_080388.1:74805480-74805492promoter 内 2458-2470 bp - 1531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 74807023-74811315(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGAGTCAACCGA
SmilChr02G001385 Chr02 NC_080388.1:26357691-26357703promoter 内 2393-2405 bp - 1596 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 26353016-26356095(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGGTTTGACTATG
SmilChr01G004634 Chr01 NC_080387.1:64358662-64358674promoter 内 2366-2378 bp + 1623 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 64360297-64367470(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CGTGTTGACTTGC
SmilChr02G000007 Chr02 NC_080388.1:63682-63694promoter 内 2332-2344 bp - 1657 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60632-62025(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTAGTTGACTGTG
SmilChr03G000569 Chr03 NC_080389.1:6197176-6197188promoter 内 2322-2334 bp - 1667 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 6198855-6199947(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAAGTCAACAAT
SmilChr01G002796 Chr01 NC_080387.1:46454103-46454115promoter 内 2262-2274 bp - 1727 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 46455842-46458021(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TCAAGTCAACAAT
SmilChr02G003140 Chr02 NC_080388.1:52402697-52402709promoter 内 2223-2235 bp - 1766 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 52395274-52400931(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTTTT
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