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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 67 / 134 下载 TSV

上一页 67 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005414 Chr02 NC_080388.1:74606444-74606456promoter 内 1260-1272 bp + 2729 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 74609185-74610719(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACAGCGGATAAGA
SmilChr03G000145 Chr03 NC_080389.1:1584075-1584087promoter 内 1031-1043 bp + 2958 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 1587045-1589941(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATGAGATAAGG
SmilChr03G001987 Chr03 NC_080389.1:29126418-29126430promoter 内 692-704 bp - 3297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 29109433-29123121(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAATGGGATAAGA
SmilChr02G005403 Chr02 NC_080388.1:74570252-74570264promoter 内 475-487 bp + 3514 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 74573778-74575362(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACAGCGGATAAGA
SmilChr02G004428 Chr02 NC_080388.1:66632796-66632808promoter 内 347-359 bp + 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 66636450-66640662(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGATGAGATAAGG
SmilChr02G000703 Chr02 NC_080388.1:11247085-11247097promoter 内 296-308 bp - 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 11234694-11243392(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTCAGGATAAGC
SmilChr01G005989 Chr01 NC_080387.1:75499918-75499930promoter 内 231-243 bp - 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 75503688-75506182(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGATCA
SmilChr01G000626 Chr01 NC_080387.1:14046751-14046763promoter 内 225-237 bp - 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 14042541-14042987(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTATGGATAACG
SmilChr03G000622 Chr03 NC_080389.1:6866097-6866109promoter 内 188-200 bp + 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 6861170-6862296(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCATTTA
SmilChr02G004582 Chr02 NC_080388.1:68300870-68300882promoter 内 184-196 bp - 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 68304687-68310878(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATTGG
SmilChr02G004689 Chr02 NC_080388.1:69207792-69207804promoter 内 3867-3879 bp - 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 69207208-69207670(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAATGGGATAAGA
SmilChr02G000599 Chr02 NC_080388.1:8642198-8642210promoter 内 3746-3758 bp + 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8642453-8644900(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGACCAGATAAGG
SmilChr01G003259 Chr01 NC_080387.1:51293165-51293177promoter 内 3600-3612 bp + 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 51293566-51296314(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAGAGATAAGG
SmilChr03G000626 Chr03 NC_080389.1:6944955-6944967promoter 内 3595-3607 bp + 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 6936230-6944561(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCATTTA
SmilChr03G001170 Chr03 NC_080389.1:13458851-13458863promoter 内 3580-3592 bp - 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 13459272-13460810(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCATTTA
SmilChr02G002020 Chr02 NC_080388.1:36429929-36429941promoter 内 3575-3587 bp - 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36426847-36429515(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAGAGATAAGG
SmilChr02G000644 Chr02 NC_080388.1:9725591-9725603promoter 内 3466-3478 bp + 523 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 9724364-9725068(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACGGT
SmilChr02G003212 Chr02 NC_080388.1:53304984-53304996promoter 内 3456-3468 bp + 533 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 53302853-53304451(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCATTG
SmilChr02G002945 Chr02 NC_080388.1:49967589-49967601promoter 内 3450-3462 bp - 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49966577-49967050(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAGACGGATAAGG
SmilChr01G002719 Chr01 NC_080387.1:45468573-45468585promoter 内 3435-3447 bp + 554 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 45469139-45471381(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAGAGATAAGG
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SmilChr01G001695 Chr01 NC_080387.1:31203351-31203363promoter 内 3373-3385 bp + 616 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 31201668-31202735(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCAATTG
SmilChr01G002765 Chr01 NC_080387.1:46051244-46051256promoter 内 3356-3368 bp - 633 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 46045836-46050611(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATGAGATAAGG
SmilChr02G002946 Chr02 NC_080388.1:49991595-49991607promoter 内 3356-3368 bp + 633 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49990033-49990962(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGATCA
SmilChr03G000979 Chr03 NC_080389.1:11071957-11071969promoter 内 3293-3305 bp - 696 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 11072665-11074347(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCATTG
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SmilChr02G005151 Chr02 NC_080388.1:72887608-72887620promoter 内 3194-3206 bp + 795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 72886312-72886813(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTTTG
SmilChr02G003700 Chr02 NC_080388.1:58463745-58463757promoter 内 3146-3158 bp + 843 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 58464600-58468207(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAAAGAGATAAGG
SmilChr01G004024 Chr01 NC_080387.1:58649701-58649713promoter 内 3145-3157 bp + 844 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 58648182-58648857(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCATATA
SmilChr03G000048 Chr03 NC_080389.1:501836-501848promoter 内 3002-3014 bp + 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 502835-504501(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAGGAAGATAAGG
SmilChr01G005853 Chr01 NC_080387.1:74481933-74481945promoter 内 2993-3005 bp + 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 74482941-74485901(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAATGGATAATG
SmilChr02G001407 Chr02 NC_080388.1:26705078-26705090promoter 内 2899-2911 bp - 1090 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 26706180-26709397(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAACTAT
SmilChr02G004579 Chr02 NC_080388.1:68288486-68288498promoter 内 2846-2858 bp + 1143 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 68276587-68287343(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCATTG
SmilChr01G002989 Chr01 NC_080387.1:48824396-48824408promoter 内 2843-2855 bp - 1146 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 48818132-48823250(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGATGAGATAAGG
SmilChr02G000657 Chr02 NC_080388.1:9984996-9985008promoter 内 2837-2849 bp + 1152 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 9981181-9983844(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTCAC
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SmilChr03G002346 Chr03 NC_080389.1:36993125-36993137promoter 内 2677-2689 bp - 1312 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36987825-36991813(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTCTAGATAAGG
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SmilChr01G003510 Chr01 NC_080387.1:53687412-53687424promoter 内 2633-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 53688780-53692422(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCATTG
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SmilChr01G005361 Chr01 NC_080387.1:70843767-70843779promoter 内 2541-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 70840324-70842319(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTGATGATAAGG
SmilChr02G003299 Chr02 NC_080388.1:54279918-54279930promoter 内 2485-2497 bp + 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 54252125-54278414(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATAGG
SmilChr01G003451 Chr01 NC_080387.1:53070266-53070278promoter 内 2460-2472 bp - 1529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 53071807-53075069(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCATTG
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SmilChr02G005148 Chr02 NC_080388.1:72875363-72875375promoter 内 2261-2273 bp + 1728 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 72873195-72873635(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTTTG