转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 69 / 136 下载 TSV

上一页 69 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002017 Chr01 NC_080387.1:35748830-35748840promoter 内 1385-1395 bp - 2606 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 35745559-35746224(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCTG
SmilChr04G002284 Chr04 NC_080390.1:37095029-37095039promoter 内 1213-1223 bp + 2778 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 37089830-37092251(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGG
SmilChr04G000133 Chr04 NC_080390.1:1153518-1153528promoter 内 1053-1063 bp + 2938 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 1144833-1150580(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGG
SmilChr03G001464 Chr03 NC_080389.1:17504739-17504749promoter 内 995-1005 bp - 2996 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 17499893-17501743(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGA
SmilChr06G002734 Chr06 NC_080392.1:39567365-39567375promoter 内 986-996 bp + 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 39562681-39564360(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGG
SmilChr08G003266 Chr08 NC_080394.1:33679808-33679818promoter 内 955-965 bp + 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 33675222-33676772(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGG
SmilChr01G003579 Chr01 NC_080387.1:54366518-54366528promoter 内 948-958 bp - 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 54369571-54371350(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGG
SmilChr08G000156 Chr08 NC_080394.1:1038912-1038922promoter 内 872-882 bp - 3119 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 1034472-1035793(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGA
SmilChr02G004075 Chr02 NC_080388.1:63045533-63045543promoter 内 784-794 bp - 3207 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 63048750-63053190(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCC
SmilChr03G002055 Chr03 NC_080389.1:31268586-31268596promoter 内 631-641 bp - 3360 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 31271956-31272420(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCC
SmilChr05G000186 Chr05 NC_080391.1:1501076-1501086promoter 内 621-631 bp - 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 1493467-1497706(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGA
SmilChr05G000189 Chr05 NC_080391.1:1501076-1501086promoter 内 530-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 1504547-1509463(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGTT
SmilChr01G000850 Chr01 NC_080387.1:18374317-18374327promoter 内 415-425 bp - 3576 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 18377903-18379460(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGG
SmilChr03G003476 Chr03 NC_080389.1:53310130-53310140promoter 内 361-371 bp - 3630 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 53300558-53306500(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGA
SmilChr02G001562 Chr02 NC_080388.1:28889270-28889280promoter 内 238-248 bp + 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 28893033-28895362(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGAG
SmilChr04G003535 Chr04 NC_080390.1:51718100-51718110promoter 内 3011-3021 bp - 980 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 51714983-51717120(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTA
SmilChr03G002204 Chr03 NC_080389.1:34685590-34685600promoter 内 485-495 bp - 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 34689106-34692549(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGT
SmilChr08G003505 Chr08 NC_080394.1:37592040-37592050promoter 内 3901-3911 bp - 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 37592140-37593162(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGT
SmilChr01G000718 Chr01 NC_080387.1:16069263-16069273promoter 内 3731-3741 bp + 260 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 16068089-16069003(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGT
SmilChr02G001745 Chr02 NC_080388.1:32037292-32037302promoter 内 2658-2668 bp - 1333 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 32038635-32039596(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGT
SmilChr01G003849 Chr01 NC_080387.1:56791993-56792003promoter 内 2592-2602 bp - 1399 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 56793402-56795438(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGT
SmilChr07G004392 Chr07 NC_080393.1:56510402-56510412promoter 内 1170-1180 bp + 2821 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 56513233-56516082(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTA
SmilChr03G003922 Chr03 NC_080389.1:58313398-58313408promoter 内 93-103 bp - 3898 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 58308734-58309500(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTA
SmilChr02G001610 Chr02 NC_080388.1:29968152-29968162promoter 内 2718-2728 bp - 1273 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 29969435-29972595(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCTGAGCC
SmilChr03G001829 Chr03 NC_080389.1:25065994-25066004promoter 内 1648-1658 bp + 2343 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 25063548-25063651(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCC
SmilChr01G002494 Chr01 NC_080387.1:42693722-42693732promoter 内 483-493 bp + 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 42685787-42690214(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCTGAGCC
SmilChr07G003969 Chr07 NC_080393.1:50519627-50519637promoter 内 3519-3529 bp - 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 50515949-50519155(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCAGC
SmilChr01G000568 Chr01 NC_080387.1:11739781-11739791promoter 内 3367-3377 bp - 624 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 11740415-11741377(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCC
SmilChr03G000886 Chr03 NC_080389.1:10114769-10114779promoter 内 3211-3221 bp + 780 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 10111702-10113989(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCCCTGAGCC
SmilChr03G001624 Chr03 NC_080389.1:20835709-20835719promoter 内 3165-3175 bp + 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 20836545-20837898(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCAGC
SmilChr02G000549 Chr02 NC_080388.1:7640381-7640391promoter 内 3063-3073 bp + 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 7641319-7646267(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGG
SmilChr03G000045 Chr03 NC_080389.1:498226-498236promoter 内 2897-2907 bp - 1094 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 493017-497132(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGGA
SmilChr08G003988 Chr08 NC_080394.1:48088726-48088736promoter 内 2673-2683 bp - 1318 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 48090054-48091619(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCA
SmilChr07G003625 Chr07 NC_080393.1:42780730-42780740promoter 内 2219-2229 bp - 1772 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 42778853-42778958(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCAGC
SmilChr05G000809 Chr05 NC_080391.1:6318878-6318888promoter 内 2153-2163 bp - 1838 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 6311172-6317040(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGGA
SmilChr04G001367 Chr04 NC_080390.1:22192736-22192746promoter 内 2109-2119 bp + 1882 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 22194628-22206378(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
SmilChr07G000716 Chr07 NC_080393.1:4987388-4987398promoter 内 1832-1842 bp - 2159 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 4976890-4985229(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGCC
SmilChr02G004806 Chr02 NC_080388.1:70233329-70233339promoter 内 1355-1365 bp + 2636 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 70225492-70230693(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAAGC
SmilChr05G003165 Chr05 NC_080391.1:40431178-40431188promoter 内 1198-1208 bp - 2793 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 40425987-40428385(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGG
SmilChr08G002666 Chr08 NC_080394.1:26152416-26152426promoter 内 997-1007 bp - 2994 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 26140173-26149422(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTTCAGCGCC
SmilChr02G001142 Chr02 NC_080388.1:20671771-20671781promoter 内 600-610 bp + 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 20675172-20679004(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCAGC
SmilChr01G001061 Chr01 NC_080387.1:21924678-21924688promoter 内 3931-3941 bp + 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 21924748-21926213(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
SmilChr05G001930 Chr05 NC_080391.1:19638914-19638924promoter 内 3886-3896 bp - 105 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 19635051-19638809(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC
SmilChr01G002375 Chr01 NC_080387.1:40963249-40963259promoter 内 3875-3885 bp + 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 40963375-40970669(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCAGC
SmilChr07G003520 Chr07 NC_080393.1:40329697-40329707promoter 内 3768-3778 bp - 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 40328032-40329474(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGGA
SmilChr06G002361 Chr06 NC_080392.1:34397265-34397275promoter 内 3587-3597 bp + 404 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 34397679-34398254(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGGA
SmilChr07G001029 Chr07 NC_080393.1:7515903-7515913promoter 内 3510-3520 bp + 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 7507313-7515422(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCCCTGAGCC
SmilChr01G002500 Chr01 NC_080387.1:42833830-42833840promoter 内 3467-3477 bp - 524 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 42834364-42835534(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCCCTGAGCC
SmilChr02G004586 Chr02 NC_080388.1:68352745-68352755promoter 内 3442-3452 bp + 549 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 68346493-68352196(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCC
SmilChr07G002157 Chr07 NC_080393.1:19726829-19726839promoter 内 3429-3439 bp + 562 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 19727401-19727875(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCC