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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 69 / 139 下载 TSV

上一页 69 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000447 Chr02 NC_080388.1:5857042-5857053promoter 内 654-665 bp - 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 5850595-5853706(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTC
SmilChr02G000793 Chr02 NC_080388.1:13084121-13084132promoter 内 557-568 bp - 3433 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 13079223-13080688(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTTCGACGTGGC
SmilChr01G006010 Chr01 NC_080387.1:75654516-75654527promoter 内 447-458 bp - 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 75658070-75662073(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCACGTCACGC
SmilChr04G003697 Chr04 NC_080390.1:53334092-53334103promoter 内 130-141 bp + 3860 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 53337963-53340609(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCACACGTGGC
SmilChr01G005189 Chr01 NC_080387.1:69594132-69594143promoter 内 3972-3983 bp + 18 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69594161-69598476(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATGCGACGTGGC
SmilChr01G001592 Chr01 NC_080387.1:29998721-29998732promoter 内 3918-3929 bp + 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 29998804-30004658(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTC
SmilChr04G001660 Chr04 NC_080390.1:27565086-27565097promoter 内 3811-3822 bp - 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 27565276-27583680(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGAAG
SmilChr04G001005 Chr04 NC_080390.1:14006551-14006562promoter 内 3628-3639 bp + 362 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14006924-14011746(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTTCGACGTGGC
SmilChr02G001945 Chr02 NC_080388.1:35073477-35073488promoter 内 3576-3587 bp + 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 35073902-35076549(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGAC
SmilChr04G003442 Chr04 NC_080390.1:50943474-50943485promoter 内 3342-3353 bp - 648 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50938830-50942826(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGTC
SmilChr03G003252 Chr03 NC_080389.1:50391793-50391804promoter 内 3322-3333 bp - 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50392472-50396682(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTGTA
SmilChr04G001421 Chr04 NC_080390.1:23095612-23095623promoter 内 3174-3185 bp + 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 23096439-23101996(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAACGACGTGGC
SmilChr01G005314 Chr01 NC_080387.1:70394152-70394163promoter 内 3013-3024 bp + 977 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 70392116-70393175(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTGAA
SmilChr01G005194 Chr01 NC_080387.1:69632968-69632979promoter 内 2974-2985 bp + 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69627145-69631952(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGCAT
SmilChr02G004933 Chr02 NC_080388.1:71312857-71312868promoter 内 2814-2825 bp + 1176 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 71314044-71314942(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CATCGACGTGGC
SmilChr01G004840 Chr01 NC_080387.1:66533532-66533543promoter 内 2798-2809 bp - 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 66534735-66537276(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCACCT
SmilChr02G005442 Chr02 NC_080388.1:74800529-74800540promoter 内 2749-2760 bp - 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 74801781-74805413(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGATC
SmilChr04G003399 Chr04 NC_080390.1:50525681-50525692promoter 内 2579-2590 bp + 1411 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50518944-50524270(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAACC
SmilChr02G005478 Chr02 NC_080388.1:75008267-75008278promoter 内 2518-2529 bp + 1472 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 75004608-75006795(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGATC
SmilChr04G000103 Chr04 NC_080390.1:920033-920044promoter 内 2456-2467 bp - 1534 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 921578-924923(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGTGA
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SmilChr02G003651 Chr02 NC_080388.1:57908682-57908693promoter 内 2403-2414 bp - 1587 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 57887944-57907095(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAACGACGTGGC
SmilChr02G003315 Chr02 NC_080388.1:54406519-54406530promoter 内 2370-2381 bp + 1620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54399664-54404899(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAACC
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SmilChr03G003589 Chr03 NC_080389.1:54556143-54556154promoter 内 2287-2298 bp + 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54552627-54554440(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATCA
SmilChr03G000493 Chr03 NC_080389.1:5275890-5275901promoter 内 1728-1739 bp + 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5272609-5273628(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGCGA
SmilChr01G001119 Chr01 NC_080387.1:22827982-22827993promoter 内 1685-1696 bp + 2305 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22823266-22825677(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAACC
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SmilChr01G000768 Chr01 NC_080387.1:16810503-16810514promoter 内 1619-1630 bp - 2371 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16812885-16820170(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGTGT
SmilChr01G005315 Chr01 NC_080387.1:70394152-70394163promoter 内 1508-1519 bp + 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 70396645-70397726(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCACACGTGGC
SmilChr03G003868 Chr03 NC_080389.1:57792577-57792588promoter 内 1091-1102 bp + 2899 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 57795487-57797092(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAACGACGTGGC
SmilChr01G005195 Chr01 NC_080387.1:69632968-69632979promoter 内 952-963 bp + 3038 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69636017-69645047(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATGCGACGTGGC
SmilChr04G000608 Chr04 NC_080390.1:6894927-6894938promoter 内 930-941 bp + 3060 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 6881880-6891867(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGCAA
SmilChr01G001979 Chr01 NC_080387.1:35194050-35194061promoter 内 817-828 bp + 3173 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 35189026-35190877(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCGGC
SmilChr02G004931 Chr02 NC_080388.1:71312857-71312868promoter 内 788-799 bp + 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 71307922-71309655(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGATG
SmilChr01G001963 Chr01 NC_080387.1:34966276-34966287promoter 内 741-752 bp + 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34961171-34963027(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCGGC
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SmilChr01G004754 Chr01 NC_080387.1:65740407-65740418promoter 内 571-582 bp + 3419 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 65743837-65744217(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAACGACGTGGC
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SmilChr03G000492 Chr03 NC_080389.1:5275890-5275901promoter 内 388-399 bp + 3602 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5270820-5272288(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGCGA
SmilChr02G005440 Chr02 NC_080388.1:74800529-74800540promoter 内 347-358 bp - 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 74789115-74796886(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GATCGACGTGGC
SmilChr04G002304 Chr04 NC_080390.1:37319251-37319262promoter 内 291-302 bp + 3699 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 37309996-37315552(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAACA
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SmilChr01G001725 Chr01 NC_080387.1:31781248-31781259promoter 内 3298-3309 bp + 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 31781951-31786771(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGT