转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 69 / 151 下载 TSV

上一页 69 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002828 Chr03 NC_080389.1:44762371-44762383promoter 内 3139-3151 bp - 850 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 44759008-44761521(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAACCTACCTCG
SmilChr02G002522 Chr02 NC_080388.1:43829615-43829627promoter 内 3087-3099 bp - 902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 43825725-43828713(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCCAA
SmilChr03G000824 Chr03 NC_080389.1:9435672-9435684promoter 内 3077-3089 bp - 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 9427890-9434760(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACACTT
SmilChr04G002494 Chr04 NC_080390.1:39837560-39837572promoter 内 3052-3064 bp - 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 39835092-39836623(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCAGA
SmilChr02G000337 Chr02 NC_080388.1:4306806-4306818promoter 内 2896-2908 bp - 1093 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4304631-4305713(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACACAC
SmilChr03G002506 Chr03 NC_080389.1:39910176-39910188promoter 内 2812-2824 bp - 1177 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 39907835-39908999(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATTGC
SmilChr03G002597 Chr03 NC_080389.1:41273539-41273551promoter 内 2656-2668 bp + 1333 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 41262782-41272206(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAGATTAGGTAAC
SmilChr03G003012 Chr03 NC_080389.1:47019869-47019881promoter 内 2655-2667 bp - 1334 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 47021215-47022940(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTGGTAGGTAAT
SmilChr03G003892 Chr03 NC_080389.1:58011514-58011526promoter 内 2649-2661 bp - 1340 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 58012866-58013804(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGAGTAGGTAGT
SmilChr01G003390 Chr01 NC_080387.1:52610829-52610841promoter 内 2604-2616 bp + 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 52606417-52609444(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAGGGTAGGTTGA
SmilChr01G003024 Chr01 NC_080387.1:49298357-49298369promoter 内 2545-2557 bp + 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 49291554-49296913(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTGTC
SmilChr03G002489 Chr03 NC_080389.1:39575341-39575353promoter 内 2435-2447 bp + 1554 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 39571282-39573787(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGGTTAGGTAAT
SmilChr04G001928 Chr04 NC_080390.1:31387064-31387076promoter 内 2380-2392 bp - 1609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 31384665-31385455(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACACAC
SmilChr01G001969 Chr01 NC_080387.1:35078085-35078097promoter 内 2238-2250 bp - 1751 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 35079848-35080779(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGTGTAGGTAGG
SmilChr05G001203 Chr05 NC_080391.1:10109849-10109861promoter 内 2145-2157 bp + 1844 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 10104555-10108005(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGTGTAGGTAGA
SmilChr03G002072 Chr03 NC_080389.1:31640754-31640766promoter 内 2049-2061 bp - 1940 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 31642706-31645760(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGTGTAGGTAGG
SmilChr03G004557 Chr03 NC_080389.1:63537723-63537735promoter 内 2042-2054 bp + 1947 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 63539682-63542489(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACATAT
SmilChr01G005523 Chr01 NC_080387.1:72106825-72106837promoter 内 1993-2005 bp - 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 72100465-72104829(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACACAC
SmilChr01G006047 Chr01 NC_080387.1:75968814-75968826promoter 内 1975-1987 bp - 2014 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 75970840-75976116(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTTGA
SmilChr05G000834 Chr05 NC_080391.1:6568309-6568321promoter 内 1803-1815 bp - 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 6570507-6579674(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTTGA
SmilChr04G000804 Chr04 NC_080390.1:9901230-9901242promoter 内 1752-1764 bp + 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 9895308-9898993(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTATG
SmilChr03G000596 Chr03 NC_080389.1:6618374-6618386promoter 内 1715-1727 bp + 2274 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 6613066-6616100(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTTGA
SmilChr02G003114 Chr02 NC_080388.1:52136888-52136900promoter 内 1698-1710 bp + 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 52132638-52134597(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGTTAGGTAAT
SmilChr01G001683 Chr01 NC_080387.1:31044769-31044781promoter 内 1631-1643 bp + 2358 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 31038720-31042411(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGTGTAGGTAGG
SmilChr04G001562 Chr04 NC_080390.1:25931537-25931549promoter 内 1621-1633 bp + 2368 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 25928367-25929169(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGTGTAGGTAGG
SmilChr05G001929 Chr05 NC_080391.1:19623667-19623679promoter 内 1602-1614 bp - 2387 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 19616563-19621280(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACACAC
SmilChr01G004044 Chr01 NC_080387.1:58867500-58867512promoter 内 1575-1587 bp - 2414 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 58869926-58875331(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGTGTAGGTAGG
SmilChr02G001182 Chr02 NC_080388.1:21731116-21731128promoter 内 1516-1528 bp - 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 21733601-21734524(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGTGTAGGTAGG
SmilChr04G004182 Chr04 NC_080390.1:56398543-56398555promoter 内 1455-1467 bp - 2534 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 56394557-56396009(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACCACA
SmilChr03G003127 Chr03 NC_080389.1:48452393-48452405promoter 内 1324-1336 bp - 2665 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 48455070-48457050(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGTGTAGGTAGG
SmilChr02G002887 Chr02 NC_080388.1:49167774-49167786promoter 内 1203-1215 bp - 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 49170572-49173761(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCGGTAGGTTGG
SmilChr04G003092 Chr04 NC_080390.1:47563786-47563798promoter 内 1160-1172 bp - 2829 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 47560053-47560957(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCCAA
SmilChr04G003592 Chr04 NC_080390.1:52359013-52359025promoter 内 1138-1150 bp - 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 52353605-52356162(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCATT
SmilChr02G002744 Chr02 NC_080388.1:47421881-47421893promoter 内 1111-1123 bp - 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 47424771-47425681(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGTGTAGGTAGG
SmilChr03G003877 Chr03 NC_080389.1:57877963-57877975promoter 内 948-960 bp + 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 57881016-57883408(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCATG
SmilChr04G001539 Chr04 NC_080390.1:25352316-25352328promoter 内 898-910 bp + 3091 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 25346518-25349225(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTGTC
SmilChr04G000540 Chr04 NC_080390.1:6005396-6005408promoter 内 826-838 bp - 3163 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 6001304-6002233(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACACAC
SmilChr04G000597 Chr04 NC_080390.1:6722620-6722632promoter 内 691-703 bp + 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 6715491-6719322(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTTAA
SmilChr05G001505 Chr05 NC_080391.1:13794637-13794649promoter 内 665-677 bp - 3324 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 13797973-13803947(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATGGTAGGTTAA
SmilChr01G001286 Chr01 NC_080387.1:25630225-25630237promoter 内 664-676 bp + 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 25633562-25634590(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCTCT
SmilChr04G000848 Chr04 NC_080390.1:10735950-10735962promoter 内 609-621 bp - 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 10739342-10742141(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGTGTAGGTAGG
SmilChr03G002827 Chr03 NC_080389.1:44762371-44762383promoter 内 554-566 bp - 3435 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 44751241-44758936(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAACCTACCTCG
SmilChr01G006201 Chr01 NC_080387.1:77712459-77712471promoter 内 488-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 77707736-77708958(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGTA
SmilChr03G000201 Chr03 NC_080389.1:2279096-2279108promoter 内 414-426 bp - 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 2282683-2287094(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTAAT
SmilChr02G002767 Chr02 NC_080388.1:47724730-47724742promoter 内 156-168 bp + 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 47728575-47730018(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCTCT
SmilChr01G001617 Chr01 NC_080387.1:30290775-30290787promoter 内 123-135 bp - 3866 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 30283607-30286909(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAACCTACCAAT
SmilChr04G003094 Chr04 NC_080390.1:47563786-47563798promoter 内 98-110 bp - 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 47567689-47567760(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTAAT
SmilChr01G002695 Chr01 NC_080387.1:45207781-45207793promoter 内 70-82 bp + 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45211712-45216382(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACCACA
SmilChr02G005064 Chr02 NC_080388.1:72317441-72317453promoter 内 67-79 bp + 3922 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 72321375-72327195(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTCCT
SmilChr02G004635 Chr02 NC_080388.1:68820190-68820202promoter 内 3904-3916 bp - 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 68818426-68820105(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCGTG