转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G004480; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00029285-RA_Salv SmilChr07G004480 WRKY XP_057776222.1 MP00531 CTTTGACTTTTTT

可能结合的靶基因

9784 个结合位点 6663 个候选靶基因 第 69 / 134 下载 TSV

上一页 69 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003183 Chr01 NC_080387.1:50604727-50604739promoter 内 172-184 bp + 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 50600254-50600910(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CAGAAAGTCAATC
SmilChr01G005582 Chr01 NC_080387.1:72527927-72527939promoter 内 157-169 bp + 3832 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 72523486-72524095(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CCAGAAGTCAAGG
SmilChr01G005719 Chr01 NC_080387.1:73373770-73373782promoter 内 135-147 bp - 3854 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 73377636-73381453(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TGCAAAGTCAAAT
SmilChr03G000287 Chr03 NC_080389.1:3259694-3259706promoter 内 104-116 bp - 3885 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 3263591-3264484(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CCAGAAGTCAAGG
SmilChr01G005567 Chr01 NC_080387.1:72464663-72464675promoter 内 69-81 bp + 3920 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 72458824-72460743(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TAAGAAGTCAAAC
SmilChr02G004526 Chr02 NC_080388.1:67861626-67861638promoter 内 9-21 bp + 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 67842087-67857646(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTAAAAGTCAATA
SmilChr02G000759 Chr02 NC_080388.1:12387271-12387283promoter 内 3982-3994 bp - 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 12387290-12390391(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CAGAAAGTCAATC
SmilChr01G003618 Chr01 NC_080387.1:54714696-54714708promoter 内 3949-3961 bp - 40 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 54714748-54718095(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GAACAAGTCAAAA
SmilChr02G003409 Chr02 NC_080388.1:55264822-55264834promoter 内 3931-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 55259912-55264764(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CATTGACTTTGCA
SmilChr02G001402 Chr02 NC_080388.1:26610571-26610583promoter 内 3877-3889 bp - 112 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 26610695-26614264(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ATTAAAGTCAAGG
SmilChr02G000725 Chr02 NC_080388.1:11785403-11785415promoter 内 3853-3865 bp - 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 11784668-11785267(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTATGA
SmilChr01G002951 Chr01 NC_080387.1:48394992-48395004promoter 内 3805-3817 bp + 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 48389141-48394808(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CATAAAGTCAAAT
SmilChr02G002938 Chr02 NC_080388.1:49890113-49890125promoter 内 3669-3681 bp + 320 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 49884668-49889793(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTCAAAGTCAAAA
SmilChr01G004248 Chr01 NC_080387.1:60784432-60784444promoter 内 3610-3622 bp - 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 60783001-60784053(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 AATTGACTTTTCA
SmilChr02G000999 Chr02 NC_080388.1:17624889-17624901promoter 内 3602-3614 bp + 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 17625288-17627802(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTATCA
SmilChr01G003934 Chr01 NC_080387.1:57636311-57636323promoter 内 3568-3580 bp - 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57631456-57635890(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTATAT
SmilChr01G005692 Chr01 NC_080387.1:73198966-73198978promoter 内 3498-3510 bp - 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 73197240-73198475(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TATTGACTTTTAA
SmilChr02G001518 Chr02 NC_080388.1:28293835-28293847promoter 内 3337-3349 bp - 652 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 28294499-28302957(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TGCAAAGTCAAAT
SmilChr03G001047 Chr03 NC_080389.1:12196303-12196315promoter 内 3314-3326 bp + 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 12196990-12199512(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CGTTGACTTGGTT
SmilChr01G000059 Chr01 NC_080387.1:947574-947586promoter 内 3224-3236 bp - 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 945299-946809(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTGAA
SmilChr03G000716 Chr03 NC_080389.1:7955489-7955501promoter 内 3116-3128 bp + 873 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 7953867-7954616(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTAAAAGTCAATA
SmilChr03G000302 Chr03 NC_080389.1:3452336-3452348promoter 内 2889-2901 bp - 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3449974-3451236(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ATTTGACTTTGCA
SmilChr01G005429 Chr01 NC_080387.1:71457495-71457507promoter 内 2844-2856 bp - 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 71458652-71461641(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TGCAAAGTCAATG
SmilChr02G003516 Chr02 NC_080388.1:56351651-56351663promoter 内 2798-2810 bp + 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56352854-56354315(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TATTGACTTTTAA
SmilChr01G005061 Chr01 NC_080387.1:68525654-68525666promoter 内 2654-2666 bp - 1335 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 68527001-68528110(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TGAAAAGTCAATT
SmilChr01G005404 Chr01 NC_080387.1:71305598-71305610promoter 内 2652-2664 bp + 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 71303109-71304261(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CGTAAAGTCAAAA
SmilChr02G003484 Chr02 NC_080388.1:56106577-56106589promoter 内 2593-2605 bp - 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56105110-56105181(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ATTTGACTTTGAT
SmilChr02G004843 Chr02 NC_080388.1:70559372-70559384promoter 内 2584-2596 bp + 1405 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 70552265-70557967(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTAAAAGTCAATA
SmilChr01G001296 Chr01 NC_080387.1:25827749-25827761promoter 内 2560-2572 bp + 1429 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 25825694-25826320(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TCCAAAGTCAAAT
SmilChr01G005590 Chr01 NC_080387.1:72563734-72563746promoter 内 2559-2571 bp + 1430 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 72558686-72562304(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CCAGAAGTCAAGG
SmilChr01G001103 Chr01 NC_080387.1:22577917-22577929promoter 内 2540-2552 bp + 1449 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 22569983-22576468(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ATCAAAGTCAAAT
SmilChr01G005593 Chr01 NC_080387.1:72574464-72574476promoter 内 2515-2527 bp - 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 72572491-72572990(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CCTTGACTTCTGG
SmilChr01G005375 Chr01 NC_080387.1:70981612-70981624promoter 内 2509-2521 bp - 1480 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 70973790-70980132(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTACG
SmilChr01G003634 Chr01 NC_080387.1:54855230-54855242promoter 内 2401-2413 bp + 1588 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 54856830-54858072(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ATTTGACTTTGAT
SmilChr01G000210 Chr01 NC_080387.1:3704401-3704413promoter 内 2293-2305 bp + 1696 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3706109-3707727(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TCTTGACTTTCCA
SmilChr01G004834 Chr01 NC_080387.1:66474125-66474137promoter 内 2061-2073 bp - 1928 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 66466249-66472197(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GTTTGACTTCTTA
SmilChr01G002129 Chr01 NC_080387.1:37295559-37295571promoter 内 2026-2038 bp - 1963 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 37297534-37299100(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ATCAAAGTCAAAT
SmilChr02G004557 Chr02 NC_080388.1:68099837-68099849promoter 内 2010-2022 bp - 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 68101828-68103606(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 GAATAAGTCAAAA
SmilChr02G000854 Chr02 NC_080388.1:14550016-14550028promoter 内 1950-1962 bp + 2039 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 14546214-14547977(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TCCAAAGTCAATG
SmilChr01G000438 Chr01 NC_080387.1:8803735-8803747promoter 内 1913-1925 bp - 2076 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8799929-8801659(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ATTTGACTTTGAT
SmilChr02G002989 Chr02 NC_080388.1:50560442-50560454promoter 内 1877-1889 bp - 2112 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 50553903-50558330(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTGAA
SmilChr02G000871 Chr02 NC_080388.1:14999576-14999588promoter 内 1774-1786 bp + 2215 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 15001803-15003549(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ATTTGACTTTGAT
SmilChr01G005588 Chr01 NC_080387.1:72558853-72558865promoter 内 1563-1575 bp + 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 72554953-72556427(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CCAGAAGTCAAGG
SmilChr02G000629 Chr02 NC_080388.1:9491402-9491414promoter 内 1521-1533 bp + 2468 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 9493882-9494572(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TTTTGACTTTACG
SmilChr02G000859 Chr02 NC_080388.1:14758974-14758986promoter 内 1331-1343 bp + 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 14755255-14756316(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TCCAAAGTCAATG
SmilChr01G003935 Chr01 NC_080387.1:57636311-57636323promoter 内 1267-1279 bp - 2722 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57633155-57633589(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CTTTGACTTATAT
SmilChr01G000439 Chr01 NC_080387.1:8803735-8803747promoter 内 1141-1153 bp - 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8800797-8800887(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 ATTTGACTTTGAT
SmilChr02G001328 Chr02 NC_080388.1:24739943-24739955promoter 内 1119-1131 bp - 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 24742825-24747007(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TCACAAGTCAAAG
SmilChr01G003453 Chr01 NC_080387.1:53104000-53104012promoter 内 1107-1119 bp + 2882 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 53106894-53106967(+) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 TATTGACTTTTAA
SmilChr02G000789 Chr02 NC_080388.1:12989153-12989165promoter 内 1016-1028 bp - 2973 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 12985385-12986180(-) SMil_00029285-RA_Salv MP00531 CATTGACTTTGGA