转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 7 / 149 下载 TSV

上一页 7 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G002053 Chr07 NC_080393.1:18637390-18637400promoter 内 2763-2773 bp + 1228 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 18638628-18646660(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr02G000753 Chr02 NC_080388.1:12270425-12270435promoter 内 2754-2764 bp - 1237 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 12271672-12277517(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr03G000360 Chr03 NC_080389.1:4039230-4039240promoter 内 2704-2714 bp + 1287 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 4027312-4037943(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr01G004834 Chr01 NC_080387.1:66473579-66473589promoter 内 2609-2619 bp + 1382 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 66466249-66472197(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr02G003044 Chr02 NC_080388.1:51233241-51233251promoter 内 2538-2548 bp + 1453 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 51230962-51231788(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr03G001100 Chr03 NC_080389.1:12667854-12667864promoter 内 2450-2460 bp - 1541 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 12665480-12666313(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr02G003139 Chr02 NC_080388.1:52390213-52390223promoter 内 2401-2411 bp - 1590 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 52391813-52392259(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr06G002231 Chr06 NC_080392.1:31518704-31518714promoter 内 1940-1950 bp + 2051 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 31520765-31521523(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr07G002396 Chr07 NC_080393.1:22326495-22326505promoter 内 1897-1907 bp - 2094 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 22328599-22328670(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr02G004850 Chr02 NC_080388.1:70647389-70647399promoter 内 1754-1764 bp - 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 70649636-70654261(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr06G003111 Chr06 NC_080392.1:43960572-43960582promoter 内 1735-1745 bp + 2256 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 43962838-43964748(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr04G002979 Chr04 NC_080390.1:46203061-46203071promoter 内 1712-1722 bp + 2279 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 46193167-46200782(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr03G003346 Chr03 NC_080389.1:51778967-51778977promoter 内 1305-1315 bp + 2686 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 51781663-51784959(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr03G002645 Chr03 NC_080389.1:42087371-42087381promoter 内 987-997 bp + 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 42083593-42084367(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr07G002052 Chr07 NC_080393.1:18637390-18637400promoter 内 941-951 bp + 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 18633392-18634340(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr07G002277 Chr07 NC_080393.1:21008697-21008707promoter 内 687-697 bp - 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 21012011-21016553(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr02G000289 Chr02 NC_080388.1:3681167-3681177promoter 内 509-519 bp - 3482 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 3676633-3677685(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr03G003344 Chr03 NC_080389.1:51778967-51778977promoter 内 424-434 bp + 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 51767952-51775400(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGGA
SmilChr01G005880 Chr01 NC_080387.1:74735122-74735132promoter 内 250-260 bp + 3741 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 74738873-74740800(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr04G002339 Chr04 NC_080390.1:37729643-37729653promoter 内 146-156 bp + 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 37733498-37735638(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr02G000752 Chr02 NC_080388.1:12270425-12270435promoter 内 12-22 bp - 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 12265035-12266446(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCGGCTGTCA
SmilChr04G001403 Chr04 NC_080390.1:22837991-22838001promoter 内 2126-2136 bp - 1865 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 22839866-22841266(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGG
SmilChr01G003194 Chr01 NC_080387.1:50690603-50690613promoter 内 1717-1727 bp + 2274 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 50687862-50688329(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGG
SmilChr05G000244 Chr05 NC_080391.1:1866359-1866369promoter 内 596-606 bp + 3395 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 1869764-1871498(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCG
SmilChr02G002620 Chr02 NC_080388.1:45505547-45505557promoter 内 3302-3312 bp + 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 45503857-45504858(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGG
SmilChr01G000900 Chr01 NC_080387.1:19062093-19062103promoter 内 3087-3097 bp - 904 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 19063007-19063716(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGG
SmilChr03G000353 Chr03 NC_080389.1:3958046-3958056promoter 内 2484-2494 bp - 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 3953502-3956539(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCG
SmilChr02G002619 Chr02 NC_080388.1:45505547-45505557promoter 内 2282-2292 bp + 1709 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 45500653-45503838(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGGG
SmilChr03G004100 Chr03 NC_080389.1:59884065-59884075promoter 内 1596-1606 bp + 2395 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 59886470-59902314(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTCG
SmilChr07G003002 Chr07 NC_080393.1:30809721-30809731promoter 内 2062-2072 bp + 1929 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 5 30806545-30807792(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr05G003383 Chr05 NC_080391.1:44822916-44822926promoter 内 1156-1166 bp - 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 4 44825761-44827943(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr05G002183 Chr05 NC_080391.1:23314581-23314591promoter 内 3714-3724 bp - 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 23310963-23314304(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr04G001050 Chr04 NC_080390.1:14969294-14969304promoter 内 3469-3479 bp - 522 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 14969826-14970193(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGCCAGCTGGT
SmilChr01G005747 Chr01 NC_080387.1:73556292-73556302promoter 内 2931-2941 bp + 1060 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 73557362-73558285(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr04G003456 Chr04 NC_080390.1:51057220-51057230promoter 内 2142-2152 bp + 1849 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 51049952-51055371(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr01G005125 Chr01 NC_080387.1:69054304-69054314promoter 内 1539-1549 bp + 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 69056766-69059958(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr05G002863 Chr05 NC_080391.1:34145398-34145408promoter 内 1138-1148 bp - 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 34148261-34149547(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr03G002249 Chr03 NC_080389.1:35418045-35418055promoter 内 268-278 bp - 3723 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 35421778-35425099(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGCCAGCTGGT
SmilChr03G001319 Chr03 NC_080389.1:15463611-15463621promoter 内 133-143 bp - 3858 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 15458438-15459753(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr01G005672 Chr01 NC_080387.1:72994026-72994036promoter 内 3989-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 72994038-72995363(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr01G004260 Chr01 NC_080387.1:60859386-60859396promoter 内 3904-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 60859483-60860828(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr02G001098 Chr02 NC_080388.1:19800603-19800613promoter 内 3886-3896 bp + 105 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 19800718-19802970(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr05G002938 Chr05 NC_080391.1:35425687-35425697promoter 内 3751-3761 bp + 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 35425937-35428198(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGGCT
SmilChr05G002596 Chr05 NC_080391.1:29182800-29182810promoter 内 3645-3655 bp - 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 29181060-29182454(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr06G001661 Chr06 NC_080392.1:18892141-18892151promoter 内 3499-3509 bp + 492 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 18890472-18891649(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGCCAGCTGGA
SmilChr07G000035 Chr07 NC_080393.1:160917-160927promoter 内 3488-3498 bp - 503 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 160343-160414(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr02G004809 Chr02 NC_080388.1:70261658-70261668promoter 内 3250-3260 bp + 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 70262409-70265309(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr02G004653 Chr02 NC_080388.1:68962410-68962420promoter 内 3187-3197 bp - 804 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 68959571-68961606(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCG
SmilChr03G003743 Chr03 NC_080389.1:56473649-56473659promoter 内 2865-2875 bp - 1126 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 56474785-56481308(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT
SmilChr03G000302 Chr03 NC_080389.1:3452585-3452595promoter 内 2642-2652 bp + 1349 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 3449974-3451236(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT