转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 71 / 134 下载 TSV

上一页 71 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004043 Chr01 NC_080387.1:58841901-58841913promoter 内 3569-3581 bp + 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 58842333-58846746(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATGTGGATAATA
SmilChr01G002697 Chr01 NC_080387.1:45233444-45233456promoter 内 3529-3541 bp + 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 45233916-45235474(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGGAAGGATAAGG
SmilChr01G001168 Chr01 NC_080387.1:23722435-23722447promoter 内 3498-3510 bp - 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 23722938-23723570(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAACTAA
SmilChr02G005441 Chr02 NC_080388.1:74801490-74801502promoter 内 3417-3429 bp + 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 74799341-74800918(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCACATT
SmilChr01G000220 Chr01 NC_080387.1:3864742-3864754promoter 内 3339-3351 bp - 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3860587-3864092(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGGAGGATAAGA
SmilChr02G004346 Chr02 NC_080388.1:65737199-65737211promoter 内 3325-3337 bp + 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 65737875-65740476(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CACATGGATAAGA
SmilChr02G001725 Chr02 NC_080388.1:31761818-31761830promoter 内 3300-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 31762519-31763588(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCTTCT
SmilChr01G005767 Chr01 NC_080387.1:73754695-73754707promoter 内 3298-3310 bp - 691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 73755398-73759578(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTGTT
SmilChr02G003145 Chr02 NC_080388.1:52483066-52483078promoter 内 3242-3254 bp + 747 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52478208-52482319(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCACATT
SmilChr02G004504 Chr02 NC_080388.1:67568662-67568674promoter 内 3165-3177 bp + 824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 67569498-67573393(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAATGGATAACA
SmilChr02G003388 Chr02 NC_080388.1:54982835-54982847promoter 内 3155-3167 bp - 834 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 54983681-54986207(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCATTTT
SmilChr02G004702 Chr02 NC_080388.1:69329098-69329110promoter 内 3129-3141 bp + 860 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 69329970-69333125(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGACGGATAAGG
SmilChr01G000393 Chr01 NC_080387.1:8075233-8075245promoter 内 3037-3049 bp - 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8068297-8074281(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CACATGGATAAGA
SmilChr01G004734 Chr01 NC_080387.1:65518729-65518741promoter 内 2983-2995 bp - 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 65513431-65517723(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CACTCGGATAAGG
SmilChr02G000561 Chr02 NC_080388.1:7897623-7897635promoter 内 2862-2874 bp + 1127 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 7893948-7896496(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCATTTT
SmilChr02G001542 Chr02 NC_080388.1:28675644-28675656promoter 内 2718-2730 bp + 1271 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 28676927-28682190(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAATGGATAACA
SmilChr01G006140 Chr01 NC_080387.1:76914682-76914694promoter 内 2590-2602 bp + 1399 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 76909055-76913283(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCATTAT
SmilChr02G004723 Chr02 NC_080388.1:69482998-69483010promoter 内 2533-2545 bp + 1456 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 69476382-69481542(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTAATGT
SmilChr01G004984 Chr01 NC_080387.1:67891417-67891429promoter 内 2504-2516 bp + 1485 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 67888541-67889932(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTGTT
SmilChr02G004189 Chr02 NC_080388.1:64221616-64221628promoter 内 2458-2470 bp - 1531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 64203209-64220085(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGAAGGGATAAGA
SmilChr01G001721 Chr01 NC_080387.1:31683686-31683698promoter 内 2424-2436 bp - 1565 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 31685263-31686471(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATGTG
SmilChr03G001407 Chr03 NC_080389.1:16668902-16668914promoter 内 2282-2294 bp - 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 16670621-16674981(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACTCA
SmilChr02G000172 Chr02 NC_080388.1:2212485-2212497promoter 内 2252-2264 bp - 1737 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2198951-2210748(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGTAAGATAAGG
SmilChr01G003315 Chr01 NC_080387.1:51875960-51875972promoter 内 2246-2258 bp + 1743 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51877715-51880313(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAACA
SmilChr02G000206 Chr02 NC_080388.1:2688877-2688889promoter 内 2217-2229 bp + 1772 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 2690661-2692657(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAGTGGATAATG
SmilChr02G005175 Chr02 NC_080388.1:73047966-73047978promoter 内 2100-2112 bp - 1889 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 73049867-73053673(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTAAGT
SmilChr02G002168 Chr02 NC_080388.1:38906937-38906949promoter 内 2071-2083 bp - 1918 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 38908867-38910207(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCATTTT
SmilChr02G003146 Chr02 NC_080388.1:52483066-52483078promoter 内 2056-2068 bp + 1933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52480406-52481133(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCACATT
SmilChr03G000026 Chr03 NC_080389.1:368282-368294promoter 内 2044-2056 bp - 1945 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 370239-372416(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCACACA
SmilChr02G001955 Chr02 NC_080388.1:35284281-35284293promoter 内 2003-2015 bp - 1986 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 35286279-35288543(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCTTACT
SmilChr01G002773 Chr01 NC_080387.1:46187671-46187683promoter 内 1866-1878 bp + 2123 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 46179891-46185548(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCAAAAT
SmilChr02G003911 Chr02 NC_080388.1:61202217-61202229promoter 内 1852-1864 bp - 2137 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 61195543-61200080(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGAAGGGATAAGA
SmilChr02G000267 Chr02 NC_080388.1:3466915-3466927promoter 内 1762-1774 bp - 2227 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3469154-3470115(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATCAAA
SmilChr02G005471 Chr02 NC_080388.1:74981813-74981825promoter 内 1755-1767 bp - 2234 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 74977964-74979579(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAAGAGATAAGG
SmilChr02G004751 Chr02 NC_080388.1:69700389-69700401promoter 内 1741-1753 bp + 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 69702649-69704762(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAACA
SmilChr01G001851 Chr01 NC_080387.1:33439043-33439055promoter 内 1733-1745 bp + 2256 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 33435244-33436787(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGCAGA
SmilChr01G002907 Chr01 NC_080387.1:47789794-47789806promoter 内 1557-1569 bp - 2432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 47792238-47793432(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCATAA
SmilChr02G001977 Chr02 NC_080388.1:35727921-35727933promoter 内 1530-1542 bp + 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 35730392-35731091(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTGTTGATAAGG
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SmilChr01G005064 Chr01 NC_080387.1:68544748-68544760promoter 内 1159-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 68537871-68541918(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCACAGG
SmilChr01G005475 Chr01 NC_080387.1:71743461-71743473promoter 内 1140-1152 bp + 2849 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 71734846-71740612(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATGAT
SmilChr03G000010 Chr03 NC_080389.1:115724-115736promoter 内 1122-1134 bp + 2867 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 110983-112857(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATCAAA
SmilChr02G003502 Chr02 NC_080388.1:56220200-56220212promoter 内 1101-1113 bp - 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 56216197-56217312(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAACA
SmilChr02G004158 Chr02 NC_080388.1:63898532-63898544promoter 内 1025-1037 bp - 2964 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63901508-63904482(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCCGAA
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SmilChr02G001335 Chr02 NC_080388.1:24819822-24819834promoter 内 910-922 bp - 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 24813733-24816743(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTTAGGATAAGT
SmilChr01G004324 Chr01 NC_080387.1:61399484-61399496promoter 内 900-912 bp - 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 61402585-61404376(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCACATT
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SmilChr01G004983 Chr01 NC_080387.1:67891417-67891429promoter 内 675-687 bp + 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 67882168-67888103(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTGTT