转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 73 / 143 下载 TSV

上一页 73 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G004441 Chr07 NC_080393.1:57054161-57054172promoter 内 3255-3266 bp + 735 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 57053343-57053426(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATC
SmilChr04G001006 Chr04 NC_080390.1:14020485-14020496promoter 内 3147-3158 bp - 843 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 14019536-14019642(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATCCAGCTGTT
SmilChr02G000112 Chr02 NC_080388.1:1428367-1428378promoter 内 3016-3027 bp + 974 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 1426595-1427393(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGG
SmilChr02G005222 Chr02 NC_080388.1:73431664-73431675promoter 内 2968-2979 bp - 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 73432697-73435402(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr02G002142 Chr02 NC_080388.1:38542136-38542147promoter 内 2797-2808 bp + 1193 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 38543340-38546017(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr05G001282 Chr05 NC_080391.1:10967916-10967927promoter 内 2731-2742 bp + 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 10969186-10969259(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAGC
SmilChr01G005161 Chr01 NC_080387.1:69386501-69386512promoter 内 2709-2720 bp - 1281 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 69381428-69385220(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTT
SmilChr05G000475 Chr05 NC_080391.1:3653753-3653764promoter 内 2694-2705 bp + 1296 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 3650708-3652457(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTT
SmilChr05G003970 Chr05 NC_080391.1:53467206-53467217promoter 内 2472-2483 bp + 1518 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 53462133-53465688(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr06G002031 Chr06 NC_080392.1:26459360-26459371promoter 内 2428-2439 bp + 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 26460933-26462923(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTT
SmilChr01G001725 Chr01 NC_080387.1:31780310-31780321promoter 内 2360-2371 bp - 1630 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 31781951-31786771(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr04G002556 Chr04 NC_080390.1:40874192-40874203promoter 内 2348-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 40871294-40872550(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr01G005678 Chr01 NC_080387.1:73060536-73060547promoter 内 2339-2350 bp - 1651 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 73055593-73058885(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTA
SmilChr05G002421 Chr05 NC_080391.1:26708012-26708023promoter 内 2175-2186 bp + 1815 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 26709838-26712749(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTT
SmilChr06G002595 Chr06 NC_080392.1:37161275-37161286promoter 内 1931-1942 bp + 2059 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 37163345-37165926(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTT
SmilChr01G001854 Chr01 NC_080387.1:33476552-33476563promoter 内 1918-1929 bp + 2072 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 33471818-33474480(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr05G002790 Chr05 NC_080391.1:32643972-32643983promoter 内 1787-1798 bp - 2203 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 32638802-32641769(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTT
SmilChr02G001885 Chr02 NC_080388.1:34167121-34167132promoter 内 1722-1733 bp + 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 34169400-34171363(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr04G002299 Chr04 NC_080390.1:37241165-37241176promoter 内 1673-1684 bp - 2317 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 37243493-37246743(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGG
SmilChr04G001588 Chr04 NC_080390.1:26397308-26397319promoter 内 1613-1624 bp + 2377 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 26389526-26394931(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr08G003013 Chr08 NC_080394.1:30246946-30246957promoter 内 1224-1235 bp - 2766 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 30241895-30244180(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTT
SmilChr07G001784 Chr07 NC_080393.1:15156824-15156835promoter 内 1183-1194 bp + 2807 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 15159642-15163020(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr07G001017 Chr07 NC_080393.1:7383291-7383302promoter 内 1114-1125 bp + 2876 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 7386178-7389248(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTT
SmilChr01G001866 Chr01 NC_080387.1:33640508-33640519promoter 内 1081-1092 bp - 2909 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 33643428-33644575(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr01G001656 Chr01 NC_080387.1:30617148-30617159promoter 内 812-823 bp - 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 30609923-30613970(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTT
SmilChr08G003632 Chr08 NC_080394.1:39644549-39644560promoter 内 802-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 39647748-39648651(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr08G001670 Chr08 NC_080394.1:13937706-13937717promoter 内 798-809 bp + 3192 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 13930931-13934514(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGG
SmilChr03G004511 Chr03 NC_080389.1:63190841-63190852promoter 内 788-799 bp - 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 63186729-63187639(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTA
SmilChr02G001304 Chr02 NC_080388.1:24188846-24188857promoter 内 735-746 bp - 3255 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 24192112-24198150(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTT
SmilChr04G000857 Chr04 NC_080390.1:10886196-10886207promoter 内 730-741 bp + 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 10880055-10882936(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGACA
SmilChr06G000664 Chr06 NC_080392.1:5842383-5842394promoter 内 704-715 bp + 3286 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 5837541-5839097(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr04G002557 Chr04 NC_080390.1:40874192-40874203promoter 内 672-683 bp + 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 40877521-40880801(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr04G001794 Chr04 NC_080390.1:29406345-29406356promoter 内 504-515 bp - 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 29400577-29402859(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr08G001415 Chr08 NC_080394.1:11338453-11338464promoter 内 344-355 bp + 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 11331363-11334807(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGG
SmilChr05G003101 Chr05 NC_080391.1:39421355-39421366promoter 内 3679-3690 bp + 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 39421677-39422706(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTATC
SmilChr04G001975 Chr04 NC_080390.1:32004366-32004377promoter 内 3392-3403 bp + 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 32002398-32003768(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGG
SmilChr01G002227 Chr01 NC_080387.1:38741468-38741479promoter 内 3309-3320 bp + 681 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 38742160-38743032(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr02G000567 Chr02 NC_080388.1:7991535-7991546promoter 内 3088-3099 bp + 902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 7992448-7995052(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTCCAGCTGTT
SmilChr06G002442 Chr06 NC_080392.1:35163948-35163959promoter 内 2977-2988 bp + 1013 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 35162435-35162935(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr05G001281 Chr05 NC_080391.1:10967916-10967927promoter 内 2733-2744 bp + 1257 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 10966167-10966659(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCTT
SmilChr03G001794 Chr03 NC_080389.1:24505979-24505990promoter 内 2530-2541 bp - 1460 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 24507450-24508299(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr06G002807 Chr06 NC_080392.1:40783611-40783622promoter 内 2234-2245 bp + 1756 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 40780705-40781855(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCGA
SmilChr06G002444 Chr06 NC_080392.1:35163948-35163959promoter 内 2179-2190 bp + 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 35165770-35179223(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr02G000732 Chr02 NC_080388.1:11895004-11895015promoter 内 2168-2179 bp + 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 11896837-11898215(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr01G000868 Chr01 NC_080387.1:18551087-18551098promoter 内 2159-2170 bp + 1831 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 18548401-18549256(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCGA
SmilChr07G001163 Chr07 NC_080393.1:8712533-8712544promoter 内 2052-2063 bp - 1938 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 8707822-8710595(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr05G003102 Chr05 NC_080391.1:39421355-39421366promoter 内 2028-2039 bp + 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 39423328-39425985(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTATC
SmilChr02G004401 Chr02 NC_080388.1:66352316-66352327promoter 内 2012-2023 bp + 1978 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 66348931-66350338(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCTT
SmilChr08G002222 Chr08 NC_080394.1:20224303-20224314promoter 内 1902-1913 bp + 2088 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 20226402-20227190(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAGC
SmilChr08G001696 Chr08 NC_080394.1:14182359-14182370promoter 内 1887-1898 bp - 2103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 14184473-14185406(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTT