转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 74 / 143 下载 TSV

上一页 74 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000612 Chr05 NC_080391.1:4605403-4605414promoter 内 1886-1897 bp + 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 4607518-4608783(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAGC
SmilChr03G000070 Chr03 NC_080389.1:831718-831729promoter 内 1831-1842 bp - 2159 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 828588-829559(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr07G003123 Chr07 NC_080393.1:33146591-33146602promoter 内 1762-1773 bp - 2228 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 33143461-33144363(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCTG
SmilChr07G003143 Chr07 NC_080393.1:33326324-33326335promoter 内 1762-1773 bp - 2228 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 33323194-33324096(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCTG
SmilChr01G003705 Chr01 NC_080387.1:55413920-55413931promoter 内 1728-1739 bp - 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 55416193-55417162(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr01G005172 Chr01 NC_080387.1:69472381-69472392promoter 内 1636-1647 bp + 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 69474746-69476712(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTATC
SmilChr02G002559 Chr02 NC_080388.1:44521484-44521495promoter 内 1573-1584 bp - 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 44523912-44525140(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr03G003488 Chr03 NC_080389.1:53446867-53446878promoter 内 1447-1458 bp + 2543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 53449421-53456826(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr03G001829 Chr03 NC_080389.1:25066223-25066234promoter 内 1418-1429 bp - 2572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 25063548-25063651(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCAG
SmilChr01G000069 Chr01 NC_080387.1:1190470-1190481promoter 内 1396-1407 bp + 2594 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 1193075-1195895(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCTG
SmilChr06G003284 Chr06 NC_080392.1:45395602-45395613promoter 内 1375-1386 bp - 2615 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 45379598-45392987(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTT
SmilChr03G002229 Chr03 NC_080389.1:35190497-35190508promoter 内 1182-1193 bp + 2808 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 35186619-35187689(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTT
SmilChr02G001498 Chr02 NC_080388.1:27939377-27939388promoter 内 1126-1137 bp + 2864 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 27933258-27936513(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr07G001213 Chr07 NC_080393.1:9274373-9274384promoter 内 1118-1129 bp - 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 9267792-9271501(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGGC
SmilChr01G001395 Chr01 NC_080387.1:27442202-27442213promoter 内 1088-1099 bp - 2902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 27439228-27439300(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTT
SmilChr03G002036 Chr03 NC_080389.1:30718350-30718361promoter 内 1056-1067 bp + 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 30721295-30721639(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCTG
SmilChr05G001979 Chr05 NC_080391.1:20439321-20439332promoter 内 1031-1042 bp + 2959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 20442291-20444482(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTT
SmilChr08G003041 Chr08 NC_080394.1:30572993-30573004promoter 内 835-846 bp - 3155 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 30576159-30576794(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCTT
SmilChr04G000678 Chr04 NC_080390.1:7761588-7761599promoter 内 701-712 bp - 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 7754387-7758299(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr03G001834 Chr03 NC_080389.1:25181085-25181096promoter 内 672-683 bp - 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 25176699-25177767(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr01G004669 Chr01 NC_080387.1:64796443-64796454promoter 内 639-650 bp + 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 64792241-64793092(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTA
SmilChr08G000294 Chr08 NC_080394.1:2011743-2011754promoter 内 595-606 bp + 3395 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2015149-2019541(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTGAT
SmilChr04G001861 Chr04 NC_080390.1:30303528-30303539promoter 内 571-582 bp - 3419 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 30295575-30300109(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr02G003044 Chr02 NC_080388.1:51235214-51235225promoter 内 564-575 bp + 3426 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 51230962-51231788(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GACACCTGTCAA
SmilChr06G000384 Chr06 NC_080392.1:3044277-3044288promoter 内 544-555 bp - 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 3038523-3040831(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCTT
SmilChr06G002973 Chr06 NC_080392.1:42558822-42558833promoter 内 537-548 bp - 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 42562286-42576840(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr07G003337 Chr07 NC_080393.1:35759012-35759023promoter 内 430-441 bp - 3560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 35753898-35755452(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCTG
SmilChr01G003703 Chr01 NC_080387.1:55413920-55413931promoter 内 383-394 bp - 3607 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 55408889-55410313(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGA
SmilChr02G000566 Chr02 NC_080388.1:7991535-7991546promoter 内 150-161 bp + 3840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 7980525-7987695(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGG
SmilChr01G003706 Chr01 NC_080387.1:55413920-55413931promoter 内 70-81 bp - 3920 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 55417851-55420324(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAACTGTCAA
SmilChr03G000946 Chr03 NC_080389.1:10742835-10742846promoter 内 1416-1427 bp + 2574 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 4 10739515-10740261(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTT
SmilChr03G000943 Chr03 NC_080389.1:10710927-10710938promoter 内 1413-1424 bp + 2577 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 4 10707604-10708350(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTT
SmilChr03G000808 Chr03 NC_080389.1:9236137-9236148promoter 内 2970-2981 bp + 1020 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 9237168-9238748(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCTT
SmilChr07G002513 Chr07 NC_080393.1:23819962-23819973promoter 内 655-666 bp + 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 23812511-23816627(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGACT
SmilChr05G000633 Chr05 NC_080391.1:4771960-4771971promoter 内 3960-3971 bp - 30 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 4772001-4773993(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTAGG
SmilChr07G002835 Chr07 NC_080393.1:28393282-28393293promoter 内 3808-3819 bp - 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 28393475-28394035(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAACTGTCAA
SmilChr01G005853 Chr01 NC_080387.1:74482693-74482704promoter 内 3753-3764 bp - 237 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 74482941-74485901(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGACT
SmilChr01G004604 Chr01 NC_080387.1:64023838-64023849promoter 内 3652-3663 bp - 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 64020290-64023500(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATC
SmilChr05G003519 Chr05 NC_080391.1:46990483-46990494promoter 内 3099-3110 bp + 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 46987806-46989592(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCGA
SmilChr01G003737 Chr01 NC_080387.1:55697844-55697855promoter 内 2477-2488 bp - 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 55699368-55701398(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr01G005019 Chr01 NC_080387.1:68187135-68187146promoter 内 2150-2161 bp - 1840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 68182488-68185295(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCTC
SmilChr04G002405 Chr04 NC_080390.1:38597061-38597072promoter 内 1681-1692 bp + 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 38593744-38594752(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACC
SmilChr03G003481 Chr03 NC_080389.1:53372991-53373002promoter 内 1462-1473 bp - 2528 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 53362783-53370463(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTCCAGCTGTG
SmilChr07G002512 Chr07 NC_080393.1:23809312-23809323promoter 内 1399-1410 bp + 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 23811914-23811985(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCTT
SmilChr05G004282 Chr05 NC_080391.1:56607508-56607519promoter 内 1328-1339 bp + 2662 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 56610181-56613051(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTA
SmilChr01G001517 Chr01 NC_080387.1:29046144-29046155promoter 内 1151-1162 bp + 2839 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 29048994-29051927(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTA
SmilChr04G001144 Chr04 NC_080390.1:16857744-16857755promoter 内 780-791 bp - 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 16860965-16865244(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGACT
SmilChr02G001318 Chr02 NC_080388.1:24501183-24501194promoter 内 667-678 bp + 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 24504517-24509144(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTA
SmilChr07G002510 Chr07 NC_080393.1:23809312-23809323promoter 内 504-515 bp + 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 23801937-23805826(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCCA
SmilChr04G000748 Chr04 NC_080390.1:9176397-9176408promoter 内 308-319 bp - 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 9169708-9172715(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTA