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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 76 / 151 下载 TSV

上一页 76 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000530 Chr03 NC_080389.1:5663568-5663580promoter 内 2611-2623 bp - 1378 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 5654198-5662190(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACAATA
SmilChr02G003664 Chr02 NC_080388.1:58036243-58036255promoter 内 2531-2543 bp + 1458 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 58037713-58038463(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCATA
SmilChr02G005115 Chr02 NC_080388.1:72671571-72671583promoter 内 2311-2323 bp + 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72666026-72669893(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAGTGTAGGTAGG
SmilChr04G003473 Chr04 NC_080390.1:51185183-51185195promoter 内 2293-2305 bp + 1696 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 51186891-51189681(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCTTA
SmilChr03G002351 Chr03 NC_080389.1:37141993-37142005promoter 内 2246-2258 bp + 1743 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 37137945-37140250(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTGGTAGGTGCT
SmilChr01G002366 Chr01 NC_080387.1:40835403-40835415promoter 内 2184-2196 bp + 1805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 40837220-40839089(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATGAA
SmilChr04G000772 Chr04 NC_080390.1:9488374-9488386promoter 内 2135-2147 bp + 1854 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 9485336-9486520(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCATTAGGTAAC
SmilChr01G002996 Chr01 NC_080387.1:48914364-48914376promoter 内 2026-2038 bp - 1963 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 48916339-48918397(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAGT
SmilChr02G004511 Chr02 NC_080388.1:67641804-67641816promoter 内 2015-2027 bp - 1974 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 67638530-67639830(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTCAT
SmilChr02G000702 Chr02 NC_080388.1:11219997-11220009promoter 内 1988-2000 bp - 2001 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 11208006-11217996(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAACCTACCAAG
SmilChr02G001201 Chr02 NC_080388.1:22148737-22148749promoter 内 1856-1868 bp - 2133 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 22150882-22155610(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTTGTAGGTAAA
SmilChr04G001807 Chr04 NC_080390.1:29560851-29560863promoter 内 1787-1799 bp - 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 29555573-29558649(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACTCCT
SmilChr02G000700 Chr02 NC_080388.1:11189725-11189737promoter 内 1769-1781 bp + 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 11191957-11196658(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATGAA
SmilChr03G001685 Chr03 NC_080389.1:22228391-22228403promoter 内 1725-1737 bp + 2264 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 22230667-22232603(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACCTAG
SmilChr01G000906 Chr01 NC_080387.1:19143606-19143618promoter 内 1625-1637 bp + 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 19139124-19141242(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTATA
SmilChr03G003305 Chr03 NC_080389.1:51242062-51242074promoter 内 1532-1544 bp - 2457 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 51244531-51247597(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAGG
SmilChr03G002408 Chr03 NC_080389.1:38269324-38269336promoter 内 1504-1516 bp + 2485 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 38271821-38274358(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCATA
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SmilChr02G000699 Chr02 NC_080388.1:11189725-11189737promoter 内 1222-1234 bp + 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 11185973-11186958(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCATTAGGTAAA
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SmilChr01G000908 Chr01 NC_080387.1:19143606-19143618promoter 内 1163-1175 bp + 2826 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 19146444-19155447(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCATA
SmilChr05G001633 Chr05 NC_080391.1:15265050-15265062promoter 内 1088-1100 bp + 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 15258696-15262149(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAGGTAGGTATA
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SmilChr02G005405 Chr02 NC_080388.1:74586126-74586138promoter 内 828-840 bp - 3161 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 74579314-74582965(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCACCTACCATT
SmilChr03G000364 Chr03 NC_080389.1:4079180-4079192promoter 内 724-736 bp + 3265 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 4082457-4083367(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAACCTACCAAC
SmilChr02G005345 Chr02 NC_080388.1:74281028-74281040promoter 内 600-612 bp - 3389 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 74264302-74277639(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAACCTACCAGC
SmilChr02G002845 Chr02 NC_080388.1:48590807-48590819promoter 内 469-481 bp - 3520 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 48594339-48599625(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAGGTAGGTGTA
SmilChr01G002106 Chr01 NC_080387.1:37084231-37084243promoter 内 446-458 bp + 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 37078139-37080688(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCATTAGGTAAC
SmilChr04G003654 Chr04 NC_080390.1:53033178-53033190promoter 内 417-429 bp + 3572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 53028888-53029606(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTTGTAGGTAAA
SmilChr04G001575 Chr04 NC_080390.1:26149449-26149461promoter 内 226-238 bp - 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 26142214-26145686(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAACCTACCAAC
SmilChr03G001941 Chr03 NC_080389.1:27634106-27634118promoter 内 139-151 bp + 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 27621750-27630256(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTTAC
SmilChr03G004158 Chr03 NC_080389.1:60358622-60358634promoter 内 135-147 bp - 3854 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 60362488-60378219(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCATTAGGTAAC
SmilChr04G004085 Chr04 NC_080390.1:55894933-55894945promoter 内 133-145 bp - 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 55887282-55891077(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATTGT
SmilChr02G002823 Chr02 NC_080388.1:48349839-48349851promoter 内 69-81 bp + 3920 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 48342138-48345919(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAGT
SmilChr01G000351 Chr01 NC_080387.1:7304169-7304181promoter 内 40-52 bp + 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7308130-7311543(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAACCTACCAAC
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SmilChr01G000695 Chr01 NC_080387.1:15590038-15590050promoter 内 3725-3737 bp + 264 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 15590314-15592030(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAAATTT
SmilChr04G000758 Chr04 NC_080390.1:9255576-9255588promoter 内 3487-3499 bp - 502 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 9252657-9255074(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACAAGC
SmilChr04G003955 Chr04 NC_080390.1:55101210-55101222promoter 内 3464-3476 bp - 525 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 55101747-55102630(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGTTAGGTAAT
SmilChr01G000338 Chr01 NC_080387.1:6930378-6930390promoter 内 3380-3392 bp - 609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 6930999-6934624(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCGGTAGGTGCA
SmilChr03G003117 Chr03 NC_080389.1:48300049-48300061promoter 内 3331-3343 bp + 658 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 48298550-48299391(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGCGGTAGGTTGG
SmilChr04G002998 Chr04 NC_080390.1:46386045-46386057promoter 内 3171-3183 bp + 818 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 46373412-46385227(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAGTTAGGTAAT
SmilChr04G003204 Chr04 NC_080390.1:48876557-48876569promoter 内 2418-2430 bp + 1571 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 48878140-48878934(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTTAT
SmilChr01G005713 Chr01 NC_080387.1:73347583-73347595promoter 内 1966-1978 bp - 2023 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 73341651-73345560(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTTTG
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SmilChr01G000893 Chr01 NC_080387.1:18976708-18976720promoter 内 1443-1455 bp - 2546 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 18979266-18980289(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTTGTAGGTAAG