转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 79 / 149 下载 TSV

上一页 79 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G001925 Chr07 NC_080393.1:16668431-16668441promoter 内 2733-2743 bp + 1258 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 16669699-16670260(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr07G002779 Chr07 NC_080393.1:27676560-27676570promoter 内 2694-2704 bp + 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 27677867-27679444(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr06G003159 Chr06 NC_080392.1:44562824-44562834promoter 内 2476-2486 bp - 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 44560251-44561309(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCG
SmilChr04G002962 Chr04 NC_080390.1:46010820-46010830promoter 内 2435-2445 bp - 1556 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 46001952-46009264(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr07G000706 Chr07 NC_080393.1:4915365-4915375promoter 内 2206-2216 bp - 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 4910651-4913580(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr07G000037 Chr07 NC_080393.1:167749-167759promoter 内 1815-1825 bp + 2176 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 162832-165573(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGC
SmilChr07G000039 Chr07 NC_080393.1:167749-167759promoter 内 1785-1795 bp + 2206 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 169965-173166(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAG
SmilChr01G004178 Chr01 NC_080387.1:60229734-60229744promoter 内 1559-1569 bp + 2432 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 60222171-60227302(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAGT
SmilChr07G001357 Chr07 NC_080393.1:10526381-10526391promoter 内 1528-1538 bp - 2463 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 10522972-10523918(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr05G000702 Chr05 NC_080391.1:5287088-5287098promoter 内 1493-1503 bp - 2498 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 5289596-5291558(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCGA
SmilChr02G003621 Chr02 NC_080388.1:57520874-57520884promoter 内 1345-1355 bp - 2646 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 57523530-57524994(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCGA
SmilChr06G003089 Chr06 NC_080392.1:43739304-43739314promoter 内 1289-1299 bp + 2702 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 43742016-43747651(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr05G004270 Chr05 NC_080391.1:56471538-56471548promoter 内 1259-1269 bp - 2732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 56474280-56476087(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr01G004357 Chr01 NC_080387.1:61762475-61762485promoter 内 1223-1233 bp + 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 61756501-61759707(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCGA
SmilChr03G004613 Chr03 NC_080389.1:63852400-63852410promoter 内 1214-1224 bp + 2777 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63845222-63849623(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGC
SmilChr03G004612 Chr03 NC_080389.1:63852400-63852410promoter 内 1188-1198 bp + 2803 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 63839534-63849597(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGC
SmilChr06G001817 Chr06 NC_080392.1:21326236-21326246promoter 内 1100-1110 bp + 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 21329137-21332450(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCG
SmilChr03G000143 Chr03 NC_080389.1:1576267-1576277promoter 内 1096-1106 bp - 2895 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 1569688-1573372(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr02G002901 Chr02 NC_080388.1:49302644-49302654promoter 内 1051-1061 bp + 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 49292824-49299704(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCGA
SmilChr06G001664 Chr06 NC_080392.1:18920292-18920302promoter 内 971-981 bp + 3020 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 18923322-18926978(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr04G002760 Chr04 NC_080390.1:43349166-43349176promoter 内 952-962 bp - 3039 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 43338436-43346127(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCG
SmilChr06G002117 Chr06 NC_080392.1:28308844-28308854promoter 内 868-878 bp + 3123 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 28311977-28319309(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr01G004879 Chr01 NC_080387.1:66878931-66878941promoter 内 859-869 bp - 3132 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 66882073-66884023(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr01G002315 Chr01 NC_080387.1:40146817-40146827promoter 内 696-706 bp + 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 40137832-40143522(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr06G003161 Chr06 NC_080392.1:44562824-44562834promoter 内 688-698 bp - 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 44566137-44589406(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAGT
SmilChr01G002324 Chr01 NC_080387.1:40328623-40328633promoter 内 611-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 40313988-40325243(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATC
SmilChr07G001926 Chr07 NC_080393.1:16668431-16668441promoter 内 292-302 bp + 3699 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 16672140-16676645(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATGGCTGTCA
SmilChr02G002221 Chr02 NC_080388.1:39484791-39484801promoter 内 268-278 bp - 3723 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 39488524-39489384(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGC
SmilChr07G002390 Chr07 NC_080393.1:22290159-22290169promoter 内 240-250 bp + 3751 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 22284890-22286408(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGC
SmilChr06G003157 Chr06 NC_080392.1:44562824-44562834promoter 内 81-91 bp - 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 44558211-44558914(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCG
SmilChr01G004830 Chr01 NC_080387.1:66432290-66432300promoter 内 86-96 bp - 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 4 66436205-66438902(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCAA
SmilChr05G002890 Chr05 NC_080391.1:34669511-34669521promoter 内 1423-1433 bp - 2568 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 34672089-34681025(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCAA
SmilChr01G001489 Chr01 NC_080387.1:28667286-28667296promoter 内 366-376 bp - 3625 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 28670921-28673589(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATG
SmilChr01G001736 Chr01 NC_080387.1:31960911-31960921promoter 内 174-184 bp - 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 31955859-31957094(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATGGCTGTCA
SmilChr03G003505 Chr03 NC_080389.1:53656646-53656656promoter 内 3955-3965 bp - 36 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 53656692-53659401(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATG
SmilChr06G000149 Chr06 NC_080392.1:1047010-1047020promoter 内 3953-3963 bp - 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 1047058-1048865(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCAA
SmilChr03G000076 Chr03 NC_080389.1:930718-930728promoter 内 3311-3321 bp - 680 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 927039-930038(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCA
SmilChr03G000314 Chr03 NC_080389.1:3579239-3579249promoter 内 3263-3273 bp - 728 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 3575411-3578511(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCA
SmilChr03G000278 Chr03 NC_080389.1:3163936-3163946promoter 内 3086-3096 bp - 905 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 3160443-3163031(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCA
SmilChr07G001892 Chr07 NC_080393.1:16341947-16341957promoter 内 2813-2823 bp + 1178 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 16343135-16345754(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATGGCTGTCA
SmilChr02G004571 Chr02 NC_080388.1:68211827-68211837promoter 内 2648-2658 bp - 1343 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 68213180-68218239(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAT
SmilChr03G003591 Chr03 NC_080389.1:54563597-54563607promoter 内 2551-2561 bp + 1440 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 54565047-54570287(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATGGCTGTCA
SmilChr06G001836 Chr06 NC_080392.1:21562030-21562040promoter 内 2026-2036 bp - 1965 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 21556603-21560065(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGTAG
SmilChr01G003787 Chr01 NC_080387.1:56265131-56265141promoter 内 1938-1948 bp + 2053 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 56262231-56263078(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAT
SmilChr05G000306 Chr05 NC_080391.1:2325552-2325562promoter 内 1914-1924 bp + 2077 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 2317421-2323475(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGG
SmilChr06G000015 Chr06 NC_080392.1:234779-234789promoter 内 1794-1804 bp + 2197 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 236986-242359(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCA
SmilChr04G001973 Chr04 NC_080390.1:31965231-31965241promoter 内 1751-1761 bp - 2240 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 31957767-31962991(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCA
SmilChr02G003415 Chr02 NC_080388.1:55394933-55394943promoter 内 1614-1624 bp + 2377 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 55397320-55400201(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATGGCTGTCA
SmilChr04G001240 Chr04 NC_080390.1:19501217-19501227promoter 内 1489-1499 bp + 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 19503729-19504793(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATGGCTGTCA
SmilChr01G001426 Chr01 NC_080387.1:27904918-27904928promoter 内 1216-1226 bp - 2775 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 27899043-27902143(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAGGCTGTCA