转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 81 / 151 下载 TSV

上一页 81 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005538 Chr02 NC_080388.1:75413801-75413813promoter 内 2070-2082 bp + 1919 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 75408257-75411882(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTATGTAGGTAAG
SmilChr03G004398 Chr03 NC_080389.1:62172786-62172798promoter 内 2052-2064 bp - 1937 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62174735-62179268(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGAGTAGGTATG
SmilChr02G000683 Chr02 NC_080388.1:10783744-10783756promoter 内 2030-2042 bp + 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 10780977-10781785(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTTGA
SmilChr01G002144 Chr01 NC_080387.1:37428218-37428230promoter 内 1945-1957 bp - 2044 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 37430274-37436163(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr04G002698 Chr04 NC_080390.1:42477436-42477448promoter 内 1936-1948 bp + 2053 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 42479501-42481258(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr02G001144 Chr02 NC_080388.1:20778092-20778104promoter 内 1904-1916 bp - 2085 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 20761415-20776007(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCTTA
SmilChr01G003354 Chr01 NC_080387.1:52296926-52296938promoter 内 1869-1881 bp + 2120 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 52291283-52294806(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTTTAGGTAAG
SmilChr03G000927 Chr03 NC_080389.1:10608423-10608435promoter 内 1849-1861 bp + 2140 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 10610575-10612075(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTGCT
SmilChr01G002574 Chr01 NC_080387.1:43828575-43828587promoter 内 1830-1842 bp + 2159 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 43821872-43826416(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr02G003896 Chr02 NC_080388.1:61055504-61055516promoter 内 1827-1839 bp - 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 61050395-61053342(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr01G002989 Chr01 NC_080387.1:48825466-48825478promoter 内 1773-1785 bp - 2216 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 48818132-48823250(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACATAA
SmilChr04G000968 Chr04 NC_080390.1:12972631-12972643promoter 内 1749-1761 bp + 2240 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 12974883-12978450(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACTGGA
SmilChr05G001969 Chr05 NC_080391.1:20327398-20327410promoter 内 1675-1687 bp + 2314 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 20322994-20325084(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G000756 Chr03 NC_080389.1:8645680-8645692promoter 内 1649-1661 bp + 2340 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 8641850-8643340(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCATTAGGTAAC
SmilChr02G004114 Chr02 NC_080388.1:63437936-63437948promoter 内 1592-1604 bp + 2397 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 63440345-63441890(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr04G000874 Chr04 NC_080390.1:11098419-11098431promoter 内 1544-1556 bp - 2445 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 11100876-11102437(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAGGTAGGTATA
SmilChr01G001257 Chr01 NC_080387.1:25235941-25235953promoter 内 1542-1554 bp - 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 25230481-25233494(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr03G002076 Chr03 NC_080389.1:31748707-31748719promoter 内 1540-1552 bp + 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 31733993-31746258(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G005308 Chr01 NC_080387.1:70334251-70334263promoter 内 1530-1542 bp - 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 70336722-70337592(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTTGTAGGTAAA
SmilChr03G003180 Chr03 NC_080389.1:49260024-49260036promoter 内 1444-1456 bp - 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 49256691-49257479(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACAATG
SmilChr03G000249 Chr03 NC_080389.1:2936346-2936358promoter 内 1304-1316 bp - 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 2939043-2943253(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGCGAA
SmilChr04G001331 Chr04 NC_080390.1:21506971-21506983promoter 内 1256-1268 bp - 2733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 21509716-21510660(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAGGTAGGCGAA
SmilChr01G004042 Chr01 NC_080387.1:58834504-58834516promoter 内 1220-1232 bp - 2769 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 58828095-58831735(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr05G001849 Chr05 NC_080391.1:18529329-18529341promoter 内 1194-1206 bp + 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 18532136-18535671(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTCTA
SmilChr01G005512 Chr01 NC_080387.1:71964368-71964380promoter 内 1184-1196 bp + 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 71959914-71961563(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTTAA
SmilChr04G003550 Chr04 NC_080390.1:51856730-51856742promoter 内 1167-1179 bp + 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51859564-51863084(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACAGAC
SmilChr03G003609 Chr03 NC_080389.1:54724510-54724522promoter 内 1161-1173 bp - 2828 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 54718005-54721682(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATGGT
SmilChr01G000010 Chr01 NC_080387.1:228274-228286promoter 内 1129-1141 bp - 2860 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 221140-225414(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr01G003160 Chr01 NC_080387.1:50426408-50426420promoter 内 1112-1124 bp - 2877 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 50422740-50423531(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATGAT
SmilChr01G003355 Chr01 NC_080387.1:52296926-52296938promoter 内 1088-1100 bp + 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 52299839-52302820(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAAAATT
SmilChr02G002998 Chr02 NC_080388.1:50664685-50664697promoter 内 1066-1078 bp + 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 50658167-50661762(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCGTTAGGTAAT
SmilChr02G005461 Chr02 NC_080388.1:74914605-74914617promoter 内 1020-1032 bp - 2969 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 74917586-74920857(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCGGGTAGGTTAA
SmilChr04G003198 Chr04 NC_080390.1:48831495-48831507promoter 内 1016-1028 bp - 2973 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 48834480-48834959(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTTGTAGGTAGA
SmilChr01G003311 Chr01 NC_080387.1:51796677-51796689promoter 内 852-864 bp + 3137 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51791498-51793540(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr05G001405 Chr05 NC_080391.1:12631241-12631253promoter 内 689-701 bp + 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 12621992-12627941(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr04G003302 Chr04 NC_080390.1:49745929-49745941promoter 内 655-667 bp + 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 49749275-49750338(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr01G001592 Chr01 NC_080387.1:29995449-29995461promoter 内 646-658 bp + 3343 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 29998804-30004658(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr02G001385 Chr02 NC_080388.1:26359463-26359475promoter 内 621-633 bp + 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 26353016-26356095(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAGGTAGGTATA
SmilChr05G000015 Chr05 NC_080391.1:71433-71445promoter 内 418-430 bp - 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 64443-67862(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAAATCT
SmilChr03G000056 Chr03 NC_080389.1:536937-536949promoter 内 408-420 bp + 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 532326-533356(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G000708 Chr01 NC_080387.1:15845917-15845929promoter 内 388-400 bp - 3601 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 15849530-15850611(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGGAGTAGGTATG
SmilChr02G005041 Chr02 NC_080388.1:72133826-72133838promoter 内 368-380 bp - 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 72137459-72141439(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATGATAGGTAAG
SmilChr01G000240 Chr01 NC_080387.1:4491344-4491356promoter 内 357-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 4494988-4496928(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTAGTAGGTAGT
SmilChr05G001970 Chr05 NC_080391.1:20327398-20327410promoter 内 343-355 bp + 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 20331056-20333011(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr05G000018 Chr05 NC_080391.1:71433-71445promoter 内 340-352 bp - 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 75094-79727(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGATTTAGGTAAG
SmilChr03G002267 Chr03 NC_080389.1:35797249-35797261promoter 内 294-306 bp + 3695 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 35800956-35804016(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCGCCTACCTCT
SmilChr01G004016 Chr01 NC_080387.1:58563490-58563502promoter 内 225-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 58558436-58559726(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGTGTAGGTAAA
SmilChr05G001002 Chr05 NC_080391.1:8180973-8180985promoter 内 164-176 bp - 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 8184810-8189177(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGAGGTAGGTGTC
SmilChr03G000928 Chr03 NC_080389.1:10608423-10608435promoter 内 53-65 bp + 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 10612371-10613598(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTGCT
SmilChr04G001971 Chr04 NC_080390.1:31931805-31931817promoter 内 31-43 bp - 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 31925539-31927847(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA