转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 83 / 139 下载 TSV

上一页 83 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004377 Chr01 NC_080387.1:61969896-61969907promoter 内 2740-2751 bp + 1250 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 61971157-61977289(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTC
SmilChr04G003171 Chr04 NC_080390.1:48344800-48344811promoter 内 2699-2710 bp - 1291 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 48342003-48343509(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTTGACGTGTC
SmilChr02G000262 Chr02 NC_080388.1:3413011-3413022promoter 内 2655-2666 bp + 1335 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 3409681-3411676(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCACCA
SmilChr03G002208 Chr03 NC_080389.1:34779459-34779470promoter 内 2633-2644 bp - 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 34776289-34778102(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGTT
SmilChr04G003044 Chr04 NC_080390.1:46974362-46974373promoter 内 2595-2606 bp + 1395 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 46975768-46977181(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTTGACGTGTC
SmilChr03G002873 Chr03 NC_080389.1:45408549-45408560promoter 内 2579-2590 bp - 1411 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 45395002-45407138(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTC
SmilChr04G000217 Chr04 NC_080390.1:1906792-1906803promoter 内 2522-2533 bp + 1468 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 1903660-1905324(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGCGCT
SmilChr03G002258 Chr03 NC_080389.1:35559206-35559217promoter 内 2376-2387 bp + 1614 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 35560831-35561946(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACACGTGGC
SmilChr02G000973 Chr02 NC_080388.1:17015768-17015779promoter 内 2331-2342 bp + 1659 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 17017438-17018094(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTTGACGTGTC
SmilChr01G005632 Chr01 NC_080387.1:72769654-72769665promoter 内 2326-2337 bp - 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 72766936-72767990(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGTGACGTGAT
SmilChr02G000047 Chr02 NC_080388.1:635888-635899promoter 内 2295-2306 bp + 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 637594-649458(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGTA
SmilChr03G000360 Chr03 NC_080389.1:4039647-4039658promoter 内 2286-2297 bp - 1704 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 4027312-4037943(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTC
SmilChr02G004868 Chr02 NC_080388.1:70782346-70782357promoter 内 2249-2260 bp - 1741 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 70784098-70786981(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATCT
SmilChr04G003398 Chr04 NC_080390.1:50516725-50516736promoter 内 2218-2229 bp - 1772 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 50511428-50514953(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACACGTGGC
SmilChr01G004265 Chr01 NC_080387.1:60914771-60914782promoter 内 2109-2120 bp - 1881 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 60911850-60912890(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTC
SmilChr04G001020 Chr04 NC_080390.1:14291911-14291922promoter 内 2077-2088 bp - 1913 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14288685-14289998(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGGTGACGTGAA
SmilChr01G002551 Chr01 NC_080387.1:43611605-43611616promoter 内 2063-2074 bp + 1927 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 43613543-43615559(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACACGTGGC
SmilChr03G001099 Chr03 NC_080389.1:12667436-12667447promoter 内 2036-2047 bp + 1954 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 12664727-12665482(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATCT
SmilChr03G004027 Chr03 NC_080389.1:59275351-59275362promoter 内 2031-2042 bp + 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 59268266-59273392(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCATCA
SmilChr01G005716 Chr01 NC_080387.1:73364175-73364186promoter 内 1958-1969 bp + 2032 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 73366218-73368088(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGACGACGTGGT
SmilChr02G004270 Chr02 NC_080388.1:64914062-64914073promoter 内 1900-1911 bp - 2090 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 64907854-64911972(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTTGACGTGTC
SmilChr04G001861 Chr04 NC_080390.1:30302253-30302264promoter 内 1846-1857 bp - 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 30295575-30300109(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTC
SmilChr04G002321 Chr04 NC_080390.1:37503044-37503055promoter 内 1786-1797 bp - 2204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 37497828-37500840(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGAG
SmilChr03G004346 Chr03 NC_080389.1:61734395-61734406promoter 内 1736-1747 bp + 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 61736660-61739767(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGACGACGTGGT
SmilChr02G004286 Chr02 NC_080388.1:65165309-65165320promoter 内 1727-1738 bp + 2263 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 65167583-65167655(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTC
SmilChr01G000732 Chr01 NC_080387.1:16290321-16290332promoter 内 1717-1728 bp + 2273 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 16287167-16288048(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAACT
SmilChr04G000340 Chr04 NC_080390.1:3131213-3131224promoter 内 1636-1647 bp + 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 3133578-3137664(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGACGACGTGGA
SmilChr03G004554 Chr03 NC_080389.1:63513837-63513848promoter 内 1477-1488 bp - 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 63516361-63526829(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCACCA
SmilChr04G000316 Chr04 NC_080390.1:2900671-2900682promoter 内 1476-1487 bp - 2514 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2903196-2906187(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATCT
SmilChr03G001603 Chr03 NC_080389.1:20359639-20359650promoter 内 1393-1404 bp - 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 20356209-20357042(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGACGACGTGGA
SmilChr02G002616 Chr02 NC_080388.1:45391137-45391148promoter 内 1388-1399 bp + 2602 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 45393750-45408835(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGTG
SmilChr03G002831 Chr03 NC_080389.1:44809010-44809021promoter 内 1124-1135 bp - 2866 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 44804631-44806144(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGTG
SmilChr04G002423 Chr04 NC_080390.1:38868828-38868839promoter 内 1111-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 38871718-38873046(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTC
SmilChr01G004328 Chr01 NC_080387.1:61424349-61424360promoter 内 736-747 bp - 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 61427614-61432136(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATCT
SmilChr01G005006 Chr01 NC_080387.1:68116194-68116205promoter 内 531-542 bp + 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 68107762-68112735(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGACT
SmilChr01G001852 Chr01 NC_080387.1:33444437-33444448promoter 内 405-416 bp - 3585 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 33438179-33440852(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGACGACGTGGT
SmilChr03G000813 Chr03 NC_080389.1:9302024-9302035promoter 内 315-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 9305710-9308869(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTC
SmilChr01G002530 Chr01 NC_080387.1:43322549-43322560promoter 内 244-255 bp - 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 43317510-43318803(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGACGACGTGGA
SmilChr01G000026 Chr01 NC_080387.1:486548-486559promoter 内 242-253 bp - 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 480225-482800(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTC
SmilChr02G005366 Chr02 NC_080388.1:74360377-74360388promoter 内 208-219 bp - 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 74352580-74356595(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTCGACGTGGT
SmilChr01G000813 Chr01 NC_080387.1:17534756-17534767promoter 内 199-210 bp + 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 17538558-17561262(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGTG
SmilChr04G003355 Chr04 NC_080390.1:50163617-50163628promoter 内 117-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 50156991-50159744(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGTGACGTGCG
SmilChr01G003190 Chr01 NC_080387.1:50649201-50649212promoter 内 67-78 bp + 3923 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 50639513-50645278(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATCT
SmilChr02G001611 Chr02 NC_080388.1:29976274-29976285promoter 内 16-27 bp + 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 29980259-29983080(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTC
SmilChr04G002253 Chr04 NC_080390.1:36516042-36516053promoter 内 12-23 bp + 3978 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 36492325-36512064(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCATCA
SmilChr02G000937 Chr02 NC_080388.1:16354584-16354595promoter 内 542-553 bp + 3448 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 3 16347731-16351136(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCACGTCACCG
SmilChr04G001450 Chr04 NC_080390.1:23828720-23828731promoter 内 3898-3909 bp + 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 23828823-23830991(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGGGGT
SmilChr02G000608 Chr02 NC_080388.1:8877016-8877027promoter 内 3754-3765 bp + 236 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 8871483-8876780(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCCGTG
SmilChr02G001813 Chr02 NC_080388.1:32970325-32970336promoter 内 3351-3362 bp + 639 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 32970975-32982329(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGCG
SmilChr04G003787 Chr04 NC_080390.1:54026846-54026857promoter 内 3304-3315 bp + 686 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 2 54021630-54026160(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGAAA