转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G000478; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001018-RA_Salv SmilChr08G000478 GATA XP_057781809.1 MP00130 AGATCTAGATCTGAA

可能结合的靶基因

9821 个结合位点 6015 个候选靶基因 第 83 / 121 下载 TSV

上一页 83 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003191 Chr02 NC_080388.1:53070188-53070202promoter 内 3187-3201 bp - 800 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 53067817-53069388(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGACTGAGATCTGGG
SmilChr05G001749 Chr05 NC_080391.1:17033187-17033201promoter 内 3167-3181 bp + 820 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 17034021-17036216(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCTTGTAGATCTGAT
SmilChr02G004936 Chr02 NC_080388.1:71338890-71338904promoter 内 3138-3152 bp - 849 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 71335126-71338041(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CAGCTCGGATCTGAT
SmilChr01G005294 Chr01 NC_080387.1:70266098-70266112promoter 内 3104-3118 bp - 883 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 70266995-70270703(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr04G003471 Chr04 NC_080390.1:51172807-51172821promoter 内 3102-3116 bp - 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 51173706-51178967(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCCAGTGAG
SmilChr04G000551 Chr04 NC_080390.1:6156044-6156058promoter 内 3048-3062 bp - 939 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 6156997-6160663(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr01G000135 Chr01 NC_080387.1:2284697-2284711promoter 内 3047-3061 bp + 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2285651-2289043(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGATAGAGATCTGCT
SmilChr04G000214 Chr04 NC_080390.1:1889503-1889517promoter 内 3040-3054 bp + 947 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1890464-1893442(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGGGATAGATCTGTG
SmilChr02G003570 Chr02 NC_080388.1:56865751-56865765promoter 内 3037-3051 bp - 950 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 56866715-56870048(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr04G003452 Chr04 NC_080390.1:51010678-51010692promoter 内 3013-3027 bp - 974 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 51005042-51009704(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TAGGTCGGATCTGAC
SmilChr01G000012 Chr01 NC_080387.1:275616-275630promoter 内 2970-2984 bp + 1017 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 271082-274599(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr01G006026 Chr01 NC_080387.1:75829920-75829934promoter 内 2886-2900 bp - 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 75831035-75834081(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACAAGATCTACATCT
SmilChr01G004693 Chr01 NC_080387.1:64981944-64981958promoter 内 2885-2899 bp + 1102 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 64983060-64985774(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTTCTAGATCTATG
SmilChr04G004163 Chr04 NC_080390.1:56299444-56299458promoter 内 2854-2868 bp - 1133 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 56300591-56302912(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTGAGATCTAATTGC
SmilChr01G003105 Chr01 NC_080387.1:49855772-49855786promoter 内 2842-2856 bp - 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 49856931-49862217(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATGAGATCTAATCTT
SmilChr03G001242 Chr03 NC_080389.1:14313913-14313927promoter 内 2842-2856 bp + 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 14309318-14312768(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr01G001533 Chr01 NC_080387.1:29349748-29349762promoter 内 2821-2835 bp - 1166 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 29345473-29348582(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TACACTAGATCTGCA
SmilChr01G002710 Chr01 NC_080387.1:45358271-45358285promoter 内 2810-2824 bp + 1177 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 45353277-45357094(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TACAGATCTGTAATT
SmilChr01G001152 Chr01 NC_080387.1:23474657-23474671promoter 内 2804-2818 bp - 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 23475854-23482002(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr02G004933 Chr02 NC_080388.1:71312829-71312843promoter 内 2786-2800 bp + 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 71314044-71314942(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCATATAGATCTAGG
SmilChr02G005570 Chr02 NC_080388.1:75598410-75598424promoter 内 2756-2770 bp - 1231 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 75592284-75597179(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATTCCAAATCTGAA
SmilChr03G001480 Chr03 NC_080389.1:17853578-17853592promoter 内 2739-2753 bp + 1248 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 17849127-17852330(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr02G000222 Chr02 NC_080388.1:2884694-2884708promoter 内 2710-2724 bp - 1277 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2882983-2883417(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCTTGTAGATCTGAT
SmilChr02G004571 Chr02 NC_080388.1:68211877-68211891promoter 内 2698-2712 bp + 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 68213180-68218239(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGGAGGAGATCTGGG
SmilChr03G000765 Chr03 NC_080389.1:8747490-8747504promoter 内 2685-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 8748806-8752097(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr01G000138 Chr01 NC_080387.1:2330090-2330104promoter 内 2623-2637 bp - 1364 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2331468-2335218(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GACAGATCTGCAGCC
SmilChr03G000468 Chr03 NC_080389.1:4992721-4992735promoter 内 2620-2634 bp - 1367 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 4994102-4997403(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr01G003783 Chr01 NC_080387.1:56215419-56215433promoter 内 2602-2616 bp + 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 56216818-56219149(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATTGTAGATCTGCA
SmilChr02G004976 Chr02 NC_080388.1:71648713-71648727promoter 内 2557-2571 bp + 1430 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 71650157-71655342(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATTCCAAATCTGAA
SmilChr01G003875 Chr01 NC_080387.1:57022295-57022309promoter 内 2556-2570 bp + 1431 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 57023740-57024237(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTATTTAGATCTCAT
SmilChr05G001296 Chr05 NC_080391.1:11143437-11143451promoter 内 2502-2516 bp + 1485 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 11138888-11141952(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr04G002200 Chr04 NC_080390.1:35631655-35631669promoter 内 2501-2515 bp + 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 35627112-35630169(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr04G004072 Chr04 NC_080390.1:55812016-55812030promoter 内 2488-2502 bp + 1499 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 55813529-55815622(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGGTCGAGATCTGCA
SmilChr03G000639 Chr03 NC_080389.1:7037473-7037487promoter 内 2483-2497 bp + 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 7032952-7035969(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr03G003202 Chr03 NC_080389.1:49576952-49576966promoter 内 2346-2360 bp + 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 49573389-49575311(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTTAGATCTATCACC
SmilChr01G001979 Chr01 NC_080387.1:35192576-35192590promoter 内 2288-2302 bp + 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 35189026-35190877(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CACAGATCTACAACA
SmilChr03G000145 Chr03 NC_080389.1:1585324-1585338promoter 内 2280-2294 bp - 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1587045-1589941(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCGAGACTC
SmilChr01G001565 Chr01 NC_080387.1:29677588-29677602promoter 内 2266-2280 bp - 1721 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 29672780-29675867(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TACACTAGATCTGCA
SmilChr01G004674 Chr01 NC_080387.1:64833946-64833960promoter 内 2265-2279 bp + 1722 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 64835682-64837584(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGAGCTAGATCTATG
SmilChr04G002102 Chr04 NC_080390.1:33924011-33924025promoter 内 2240-2254 bp + 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 33925772-33934824(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATATATAGATCTCAA
SmilChr02G004570 Chr02 NC_080388.1:68211877-68211891promoter 内 2205-2219 bp + 1782 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 68207567-68210095(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CCCAGATCTCCTCCT
SmilChr01G001963 Chr01 NC_080387.1:34964827-34964841promoter 内 2187-2201 bp + 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 34961171-34963027(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CACAGATCTACAACA
SmilChr03G000863 Chr03 NC_080389.1:9835653-9835667promoter 内 2179-2193 bp - 1808 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 9837475-9839163(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATTTAGTTTC
SmilChr03G001153 Chr03 NC_080389.1:13314096-13314110promoter 内 2167-2181 bp + 1820 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 13308143-13312276(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGCAGATCTAGGGTT
SmilChr02G003849 Chr02 NC_080388.1:60237443-60237457promoter 内 2162-2176 bp + 1825 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 60233021-60235618(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTTGGATCTAGTTTT
SmilChr02G002666 Chr02 NC_080388.1:46154644-46154658promoter 内 2110-2124 bp + 1877 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 46156535-46157296(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAATCTAGATCGCGG
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SmilChr02G002213 Chr02 NC_080388.1:39372855-39372869promoter 内 2075-2089 bp - 1912 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 39374781-39375809(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCCGTTTAG
SmilChr03G004549 Chr03 NC_080389.1:63463727-63463741promoter 内 1994-2008 bp + 1993 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 63465734-63468977(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGACTTAGATCTTGG
SmilChr04G000213 Chr04 NC_080390.1:1889503-1889517promoter 内 1825-1839 bp + 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1886190-1887341(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CACAGATCTATCCCT