转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G005851; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011948-RA_Salv SmilChr01G005851 MYB XP_057789306.1 MP00055 CAGATAAGGT

可能结合的靶基因

9685 个结合位点 6638 个候选靶基因 第 86 / 133 下载 TSV

上一页 86 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003242 Chr01 NC_080387.1:51155686-51155695promoter 内 2867-2876 bp + 1125 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 51148716-51154561(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G003712 Chr01 NC_080387.1:55468775-55468784promoter 内 2738-2747 bp - 1254 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 55462679-55467521(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G005502 Chr01 NC_080387.1:71900320-71900329promoter 内 2358-2367 bp + 1634 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 71895928-71898686(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr02G002858 Chr02 NC_080388.1:48769986-48769995promoter 内 2265-2274 bp + 1727 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 48771722-48772641(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G005236 Chr01 NC_080387.1:69933993-69934002promoter 内 2256-2265 bp + 1736 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 69931647-69932257(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr02G004342 Chr02 NC_080388.1:65672955-65672964promoter 内 2075-2084 bp + 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 65674881-65678148(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G005503 Chr01 NC_080387.1:71896199-71896208promoter 内 1391-1400 bp - 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 71898809-71900601(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr02G004719 Chr02 NC_080388.1:69451423-69451432promoter 内 1201-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 69448186-69448632(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G005261 Chr01 NC_080387.1:70086470-70086479promoter 内 918-927 bp - 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 70089553-70092093(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G005202 Chr01 NC_080387.1:69697640-69697649promoter 内 890-899 bp - 3102 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 69693884-69694538(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr03G000588 Chr03 NC_080389.1:6541574-6541583promoter 内 414-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 6535229-6537996(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G001445 Chr01 NC_080387.1:28140892-28140901promoter 内 321-330 bp - 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 28144572-28148054(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G003141 Chr01 NC_080387.1:50247388-50247397promoter 内 3926-3935 bp - 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 50247463-50250725(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr02G005144 Chr02 NC_080388.1:72842597-72842606promoter 内 3858-3867 bp + 134 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 72840117-72842463(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr02G002493 Chr02 NC_080388.1:43371143-43371152promoter 内 3788-3797 bp + 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 43367254-43370939(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G004388 Chr01 NC_080387.1:62054473-62054482promoter 内 3653-3662 bp - 339 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 62048214-62054134(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr02G005447 Chr02 NC_080388.1:74829329-74829338promoter 内 3591-3600 bp + 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 74829739-74831528(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G003209 Chr01 NC_080387.1:50864524-50864533promoter 内 3571-3580 bp - 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 50864954-50866673(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G002756 Chr01 NC_080387.1:45898227-45898236promoter 内 3561-3570 bp + 431 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 45889575-45897796(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G002729 Chr01 NC_080387.1:45632854-45632863promoter 内 3472-3481 bp + 520 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 45633383-45635183(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr03G000410 Chr03 NC_080389.1:4442083-4442092promoter 内 3279-3288 bp - 713 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 4440018-4441370(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr03G000214 Chr03 NC_080389.1:2500851-2500860promoter 内 3167-3176 bp + 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 2496980-2500026(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr02G003037 Chr02 NC_080388.1:51078064-51078073promoter 内 2796-2805 bp + 1196 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 51079269-51080318(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr02G003371 Chr02 NC_080388.1:54838258-54838267promoter 内 2672-2681 bp - 1320 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 54839587-54841481(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr02G004097 Chr02 NC_080388.1:63276477-63276486promoter 内 2658-2667 bp - 1334 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 63277820-63278786(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr02G001736 Chr02 NC_080388.1:31936277-31936286promoter 内 2629-2638 bp + 1363 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 31937649-31939943(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr02G002525 Chr02 NC_080388.1:43929786-43929795promoter 内 2574-2583 bp + 1418 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 43931213-43934713(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G005481 Chr01 NC_080387.1:71787887-71787896promoter 内 2264-2273 bp - 1728 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 71780374-71786159(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G005010 Chr01 NC_080387.1:68120938-68120947promoter 内 2244-2253 bp + 1748 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 68122695-68125175(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G004408 Chr01 NC_080387.1:62172334-62172343promoter 内 1989-1998 bp + 2003 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 62174346-62175450(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G005242 Chr01 NC_080387.1:69957295-69957304promoter 内 1941-1950 bp - 2051 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 69959355-69959968(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G004764 Chr01 NC_080387.1:65832973-65832982promoter 内 1841-1850 bp + 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 65835133-65838194(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G005212 Chr01 NC_080387.1:69738364-69738373promoter 内 1806-1815 bp - 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 69740559-69741209(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G004458 Chr01 NC_080387.1:62694789-62694798promoter 内 1701-1710 bp + 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 62697089-62699251(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr02G003312 Chr02 NC_080388.1:54365716-54365725promoter 内 1593-1602 bp - 2399 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 54362925-54363317(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G005221 Chr01 NC_080387.1:69765758-69765767promoter 内 1568-1577 bp - 2424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 69768191-69768685(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G005025 Chr01 NC_080387.1:68217064-68217073promoter 内 1518-1527 bp + 2474 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 68212631-68214590(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G004328 Chr01 NC_080387.1:61424854-61424863promoter 内 1241-1250 bp - 2751 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 61427614-61432136(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr03G000205 Chr03 NC_080389.1:2359022-2359031promoter 内 1139-1148 bp + 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 2361884-2363159(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr02G003162 Chr02 NC_080388.1:52660333-52660342promoter 内 1137-1146 bp + 2855 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 52663197-52666161(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G004476 Chr01 NC_080387.1:62878107-62878116promoter 内 1079-1088 bp + 2913 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 62872367-62875194(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr03G000787 Chr03 NC_080389.1:8957961-8957970promoter 内 498-507 bp - 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 8961464-8962555(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr02G003817 Chr02 NC_080388.1:59800175-59800184promoter 内 418-427 bp - 3574 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 59787754-59796601(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G004383 Chr01 NC_080387.1:62007037-62007046promoter 内 410-419 bp - 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 62010628-62013104(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr01G005243 Chr01 NC_080387.1:69957295-69957304promoter 内 368-377 bp - 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 69960928-69962883(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr02G003633 Chr02 NC_080388.1:57679566-57679575promoter 内 353-362 bp - 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57672451-57675927(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr01G004369 Chr01 NC_080387.1:61870224-61870233promoter 内 281-290 bp - 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 61873944-61875652(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACATTATCTG
SmilChr03G000409 Chr03 NC_080389.1:4442083-4442092promoter 内 236-245 bp - 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 4437397-4438327(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr02G003845 Chr02 NC_080388.1:60214808-60214817promoter 内 85-94 bp - 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 60206723-60210901(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGT
SmilChr02G000970 Chr02 NC_080388.1:16973959-16973968promoter 内 3260-3269 bp - 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 4 16971727-16973227(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAAGT